Tennants team, samen met NCIS-agenten Nick Torres en Jessica Knight, volgen de verblijfplaats van The Raven op het eiland Oahu en komen meer te weten over zijn plannen om RIMPAC (The Rim of the Pacific Exercises) aan te vallen, 's werelds grootste internationale maritieme oorlogsvoering.

Het onderzoek van het NCIS-team voert hen diep in de wereld van illegaal straatracen nadat het lichaam van een marinier op een autokerkhof wordt ontdekt. Tennant is ook bezorgd dat Alex iets voor haar verbergt, en Whistler is bezorgd om Lucy aan haar collega's voor te stellen.

Tennant en het NCIS-team vermoeden vals spel wanneer ze een dodelijk auto-ongeluk onderzoeken waarbij een marineofficier betrokken is die een bedrieger blijkt te zijn. Ook komt Whistler in gevaar wanneer ze undercover gaat om de waarheid achter het ongeluk te achterhalen.

Wanneer een matroos van de marine dood aanspoelt op een heilige, verboden kapu-site, brengt het NCIS-team CGIS Special Agent Pike om het mysterie te ontmaskeren en een mogelijke seriemoordenaar op het eiland te vangen. Ook ontmoet Tennant de nieuwe vriendin van Alex.

Het NCIS-team onderzoekt de dood van een matroos van de marine en neemt het op tegen een meedogenloze lokale criminele organisatie. Ook zoekt Lucy een nieuw appartement.

Wanneer een marinierskorporaal sterft in een getijdenpoel nadat hij is blootgesteld aan fentanyl, moet het NCIS-team snel de bron van de drugs vinden; Alex praat met zijn ouders over een tussenjaar; Ernie onthult persoonlijk nieuws aan Lucy.

Wanneer de moeder van een jonge jongen vermist raakt, gaat het NCIS-team op zoek naar haar en ontdekt dat zij niet de enigen zijn die naar haar zoeken.

Wanneer een marineofficier wordt vermoord tijdens maanlicht in een gemeenschapstheater, rekruteert het NCIS-team een ​​bekend gezicht om hen te helpen hen naar een meedogenloze internationale moordenaar te leiden. Ook schakelt Kai Whistler in om een ​​onderzoek te openen naar een oude vriend die crimineel is geworden.

Wanneer Commander Chase uit haar huis wordt ontvoerd door een Army Ranger die wordt beschuldigd van moord, moet het NCIS-team snel handelen om haar en de verdachte te vinden.

Tennant, Jimmy Palmer en Sam Hanna worden gevangengenomen met een vrouw die beweert een CIA-agent te zijn en informatie van het team eist. Ook horen Jesse, Ernie, Whistler en Alden Parker over een aanwinst die in Hawaï is aangekomen en die mogelijk verband houdt met verschillende buitenlandse moorden.

De crossover begint op NCIS S20E10 Too Many Cooks (I). Het gaat verder op NCIS: Los Angeles S14E09 A Long Time Coming (III).

Wanneer speciaal agent Pike in een hinderlaag wordt gelokt terwijl hij undercover werkt met een lokale Japanse misdaadfamilie, moet het team de persoon vinden die verantwoordelijk is voor het organiseren van de aanslagen. Ook gaat Kai dieper in op zijn onderzoek naar een oude vriend die crimineel is geworden.

Wanneer een kapitein van een elite-marinier wordt vermoord, vindt het NCIS-team een ​​verdachte op een heel ongebruikelijke plek.

Na een close call bij een meth-labexplosie, ontdekt het NCIS-team dat Kai het doelwit is van zijn oude vriend die crimineel is geworden en hem moet neerhalen; Lucy krijgt haar eerste grote koffer aan boord van haar vliegdekschip.

Wanneer de moord op een kapitein en zijn vrouw een eerdere zaak weerspiegelt, schakelt het NCIS-team een ​​voormalig teamlid in om te helpen bepalen of ze te maken hebben met een copycat-moordenaar.

Wanneer een deserteur van de marine per ongeluk uit zijn schuilplaats komt, wordt zijn familie een doelwit dat het NCIS-team en Charlie 1 (Linc Hand) ertoe aanzet om te onderzoeken wie er achter hen aan zit.

Wanneer marinebewoners ontdekken dat er van de ene op de andere dag is ingebroken in hun voertuigen, brengt het NCIS-team dit in verband met een reeks eigenaardige misdaden en spoort het een onwaarschijnlijke bandiet op. Ook worstelt Whistler met een niet-meewerkende informant en weegt Alex zijn universiteitsopties af.

Kapitein Milius keert terug naar Hawai'i terwijl het NCIS-team probeert een gevaarlijk en waardevol doelwit van de Amerikaanse regering te pakken te krijgen met de hulp van een informant zoals ze nog nooit eerder zijn tegengekomen. Ook behandelen Tennant en Daniel de acceptatie van Alex bij de Marine Academie

Wanneer Tennant een verdachte ondervraagt ​​tijdens zijn helikoptertransfer en de helikopter crasht, moet ze haar vaardigheden gebruiken om zichzelf en de andere passagiers te redden.

Na de mysterieuze dood van een astronaut in een zeer gevoelige Mars-simulatie, moet het NCIS-team Ernie naar de habitat sturen om het alleen te onderzoeken.

De ontdekking van een dode voormalige MI6-agent onthult geheimen uit het verleden van Tennant, waardoor ze tot het uiterste moet gaan om de verantwoordelijke partij op te sporen.

Wanneer een figuur uit het CIA-verleden van Tennant (Vanessa Lachey) weer opduikt, zoekt het NCIS-team hulp op de meest onwaarschijnlijke plek om een ​​moordenaar te pakken te krijgen die dreigt alles te vernietigen wat Tennant heeft gebouwd.