当一名日本水手在美国领土上被杀，有证据表明该案与之前在日本谋杀受害者女友的案件有关时，NCIS必须在指控错误的人之前找到凶手，从而引发外交危机。

NCIS在调查一个装满违禁武器的集装箱时与Whistler的团队擦肩而过；坦南特辩论逮捕亚历克斯朋友的父亲，因为她知道这会导致她的朋友搬走。

当Jesse和他的女儿一起航行一天时，海盗突然劫持了他们的游艇，将所有乘客劫持为人质，并袭击了Jesse，让他的团队迅速找到并营救他的女儿。

米利厄斯上尉继续与坦南特及其团队合作，处理美国和东欧之间的囚犯交换事件。惠斯勒也接受了厄尼的建议，做出了一个盛大的姿态，希望能赢回露西。

坦南特的团队与NCIS特工尼克·托雷斯和杰西卡·奈特一起，追踪“乌鸦”号在瓦胡岛的行踪，并了解他袭击世界上最大的国际海上作战演习RIMPAC（环太平洋演习）的计划。

坦南特和NCIS团队在调查一起致命车祸时怀疑这是一起谋杀案，该车祸涉及一名冒充者的海军军官。此外，当惠斯勒卧底了解事故背后的真相时，她发现自己处于危险之中。

当露西在守夜时接到一个承认谋杀的男子打来的奇怪电话时，NCIS小组开始寻找他。

当坦南特中情局的一个人物再次出现时，NCIS团队从最不可能的地方寻求帮助，以抓捕一个威胁要摧毁坦南特建造的一切的杀手。

After Tennant passes her medical and psych evaluations, she's surprised to see Sam's conducting her final interview to clear her return to work. Also, when the team discovers a breach in the U.S. Marshal's database, Sam joins Tennant in Las Vegas to locate the hacker.

Following the crash of a prisoner transport plane, the NCIS team must find the convicts that escaped onto the island. Meanwhile, Sam Hanna and Tennant are tasked with locating a high-profile Russian prisoner known as "The Chemist".