I kølvandet på en katastrofal mission i udlandet vender Navy SEAL-kommandant James Reece hjem med modstridende minder om operationen og spørgsmål om sin egen skyld.

Reece låser sig fast på sit første potentielle mål og får Bens hjælp. Med hans mentale helbred i tvivl, indgår Katie og Reece et uroligt, men gensidigt fordelagtigt partnerskab for at finde svar.

Reece bliver trukket dybere ind i en kompleks sammensværgelse og sætter et nyt navn på sin liste. I mellemtiden annoncerer forsvarsminister Lorraine Hartley en drastisk politisk revision for at hjælpe Special Operators. Og Katie opdager sandheden om, hvad der foregår i Reeces hoved.

Med hjælp fra sine nærmeste venner rejser Reece til Mexico for at finde udløseren, der dræbte hans familie. Katie fortsætter sin forskning fra et fjerntliggende sted. Steve Horn tager skridt til at bevare Capstones aftaler, og San Diego FBI Fugitive Task Force ledet af Tony Layun går ind i kampen i jagten på den useriøse SEAL James Reece.

Reece rejser til San Francisco for at søge svar på et stof, der kan have startet det hele. Katie forsøger at vende Mike Tedesco i et forsøg på at sprænge Capstones planer for Nubellum i luften. Tony og hans hold holder sig tæt på Horn i håb om at opsnappe Reece, før han dræber sit næste mål.

FBI's jagt intensiveres, efterhånden som de nærmer sig Reece. Uden medicinen eskalerer Reeces fysiske og psykiske symptomer. Omgivet af retshåndhævelse må en mand, der er opsat på sin mission, flygte uden at tage uskyldige liv.

Reece vender tilbage til Coronado for at få hammeren ned på de mennesker, der forrådte ham mest. Tilbage inden for murene i hans familiehjem dukker fragmenterede minder op. Katie spiller bold med FBI for at afslutte sin historie.

Et opgør brygger på forsvarsminister Hartleys Orcas Island-ejendom, da Reece, Katie, Ben og Tonys veje og mål kolliderer.