Unge professor Langdon nås av nyheten att hans vän och mentor, Smithsonian-chefen Peter Solomon, har blivit tillfångatagen. Den mystiske kidnapparen Mal'Akh kräver bara en sak i utbyte, att Langdon ska söka rätt på en gömd gammal portal.

Langdon och Katherine träffar på Peters frimurarvän Bellamy som går med på att hjälpa dem. Katherine inser att hon kanske aldrig kommer att få tillfälle att försonas med sin far och Mal'Akh kräver att Langdon ska göra sig av med sin följeslagare.

Bellamy berättar om en man som för 100 år sedan lärde sig konsten att påverka materia med bara sina tankar. Strax därefter hittar Langdon och Katherine en gammal 16-millimetersfilm, vars innehåll porträtterar samme man som Bellamy precis beskrivit.

Katherine tycker sig få ett tecken på att hennes far är vid liv och bestämmer sig för att fortsätta kämpa. Langdon söker vidare efter nästa ledtråd och Sato inleder ett samarbete med Katherine, men går det verkligen att lita på henne?

Mal'akh skickar videobevis på att Peter fortfarande lever. Sato, Katherine och Langdon gör upp en plan på att överlista Mal'akh, men saker och ting går inte riktigt enligt plan. Samtidigt hamnar Nuñez i klorna på en av Mal'akhs följeslagare.

Katherine granskar videon på Peter för att finna ledtrådar om Mal'akh's tillhåll. Langdon återförenas med Peter och tillsammans söker de efter ett snabbt sätt att fly. Peter får en uppenbarelse om sin kidnappare och avslöjar sin slutsats för Sato.

I förhör med Sato berättar Mal'akh mer om sin transformation och genom återblickar får vi veta mer om hans förflutna. Langdon funderar på att fria till Katherine samtidigt som hon distraherar sig genom att djupdyka i sin forskning.

Langdon och Katherine rusar för att varna Katherines mamma efter deras senaste upptäckt. Peter återförenas med leviatanerna, men när Mal'akh riktar sin vrede mot deras organisation väljer medlemmarna att gå bakom ryggen på Peter.

Katherine, Langdon och Peter inser att det bästa sättet att besegra Mal'akh är att fortsätta följa ledtrådarna så att de sedan kan vidarebefordra informationen till allmänheten. Mal'akh verkar dock alltid vara två steg framför dem.

Mal'akh lanserar det sista steget i sin stora plan. Peter och Langdon brottas med den uppoffring som krävs för att rädda Katherine. Nuñez och Sato kämpar för att snabbt sätta sig in i Cascade-vapnet.