사이버트론의 존폐가 걸린 일이다. 어떤 희생이라도 치러야 한다. 올스파크가 파괴되었다고 믿는 메가트론. 수용소를 급습한 엘리타 일행은 상상치 못한 장면을 목격한다.

어떻게 하면 빠져나갈 수 있을까. 우주에서 표류 중이던 옵티머스 프라임과 오토봇이 용병에게 끌려간다. 메가트론의 네메시스 프로젝트는 뜻밖의 방향으로 흘러간다.

싸움은 잠시 미뤄두고 힘을 합치자. 스코포녹의 위협적인 공격에 함께 맞서게 된 프라임과 메가트론. 그 모습을 본 스타스크림은 반역을 꾀한다. 새로운 시대를 열어볼까?