Un choque con el Prisma Paradoxal envía a Sonic a un mundo paralelo llamado Nueva Yugork, donde el triste entorno le resulta extrañamente familiar.

Un corte de electricidad permite que dos rebeldes se cuelen en un laboratorio en el que el Consejo del Caos estudia la conexión entre Sonic y su fuente de energía

Los rebeldes se enfrentan al Consejo del Caos para conseguir el fragmento de Prisma. Entonces Sonic hace un inquietante descubrimiento sobre cómo se hizo añicos su mundo

En una dimensión llamada el Boscage Maze, Sonic se topa con unas versiones de sus amigos que le advierten que en el suelo de la selva hay un temible monstruo

Para regresar a la dimensión correcta, Sonic debe enfrentarse al monstruo de la selva que les declaró la guerra a sus amigos y conseguir el poderoso fragmento de Prisma.

De vuelta en Nueva Yugork, Sonic trata de convencer a Nine de que se una a la Resistencia, pero él está ocupado constuyendo un nuevo hogar

En el tropical de Ninguna Parte, Sonic conoce a una simpática banda de piratas y a su misterioso capitán, quien adora las fiestas