Μια σύγκρουση με το Πρίσμα του Παράδοξου στέλνει τον Σόνικ σε έναν παράλληλο κόσμο που ονομάζεται Πόλη της Νιου Γιοκ, όπου το βαρετό τοπίο μοιάζει παραδόξως οικείο.

Μια διακοπή ρεύματος επιτρέπει σε δύο επαναστάτες να μπουν σε ένα εργαστήριο όπου το Συμβούλιο του Χάους μελετά την παράξενη σύνδεση του Σόνικ με την πηγή ενέργειάς τους.

Για να πάρουν το θραύσμα του Πρίσματος, οι επαναστάτες μάχονται με το Συμβούλιο του Χάους. Τότε, ο Σόνικ ανακαλύπτει κάτι σημαντικό για την καταστροφή του κόσμου του.

Σε μια διάσταση που ονομάζεται Δασολαβύρινθος, ο Σόνικ συναντά εκδοχές των φίλων του που ζουν στα δέντρα και τον προειδοποιούν για ένα τέρας που ζει στη ζούγκλα.

Για να επιστρέψει στη σωστή διάσταση, ο Σόνικ πρέπει να πολεμήσει το τέρας της ζούγκλας που κυνήγησε τους φίλους του και να πάρει το πανίσχυρο Θραύσμα του Πρίσματος.

Πίσω στο Νιου Γιοκ, ο Σόνικ προσπαθεί απεγνωσμένα να πείσει τον Νάιν να ενταχθεί στην Αντίσταση, αλλά ο Νάιν επικεντρώνεται στην κατασκευή ενός ολοκαίνουριου σπιτιού.

Στο τροπικό Πουθενά, ο Σόνικ συναντά μια φιλική ομάδα πειρατών και τον μυστηριώδη καπετάνιο τους, ο οποίος λατρεύει τα πάρτι.