타카나시 세이는 약간 일 중독인 20대 회사원이다. 어느 날 밤, 야근을 마치고 집에 돌아오자마자 갑자기 빛에 휩싸여 이세계의 왕궁에 '성녀'로서 소환되었다. 하지만 뒤이어 나타난 왕자는 같이 소환된 소녀만 신경을 썼고 방치된 세이는 아주 한가한 시간을 보내게 된다. 그러던 중 왕궁 부지를 산책하다 만난 청년 주드의 안내로 가게 된 약용 식물 연구소. 원래 식물을 좋아했기에 연구소에 흥미를 갖게 된 세이는 그곳에서 연구원으로서 일하게 된다. 그리고 약초와 마법을 사용한 포션 만들기에서 뜻하지 않게 능력을 발휘하게 되는데...

빈사상태였던 기사를 구한 포션이 호평을 받으면서 공로자인 세이는 상으로 연구소 안에 주방을 설치해달라고 한다. 이세계에서는 요리에 약초를 사용하는 관습이 없었지만 약초를 사용한 세이의 요리는 소장 요한이 감동할 정도로 맛있었다. 며칠 뒤 세이는 요한의 소개로 제3기사단의 단장 알베르트와 인사한다. 그는 바로 세이가 포션으로 구한 기사 본인이었다. 블루그레이빛 눈동자를 가진 알베르트가 다정하게 미소 짓자 안절부절못하는 세이. 그리고 왕궁 도서관에서는 새로운 만남이 세이를 기다리고 있었는데...

여름의 휴일, 세이는 알베르트의 권유로 마을에 간다. 북적이는 사람들을 보며 눈을 반짝이는 세이의 손을 잡고 다정하게 에스코트하는 알베르트. 두 사람은 함께 거리를 걸으며 즐거운 한때를 보낸다. 그리고 헤어질 때 알베르트는 세이에게 머리 장식을 선물한다. 그 이야기를 들은 요한과 엘리자베스는 알베르트의 행동에 담긴 그의 의도를 짐작한다. 며칠 후 머리 장식에 마법 부여가 되어있다는 사실을 알게 된 세이는 직접 마법 부여를 해보고 싶어져서 가르침을 받기 위해 궁정 마도사단을 찾아간다. 그곳에서 만난 것은 부사단장인 에어하르트였는데...

국왕 지그프리트는 집무실에서 요한과 에어하르트로부터 세이의 뛰어난 마력에 대한 보고를 받는다. 한편, 당사자인 세이도 자신이 뛰어난 마력을 가지고 있다는 것을 자각하고 있었다. 가장 타당한 근거는 자신이 '진짜 성녀'라는 것 하지만 그것을 적극적으로 알릴 생각은 없어서 세이는 가능하면 일반으로서 지내고 싶다고 생각했다. 어느 날, 또 포션을 잔뜩 만들어버린 세이는 요한에 의해 강제적인 휴가를 받게 된다. 자료 조사나 할 겸 들른 왕궁 도서관에서 갑자기 국왕 지그프리트가 말을 걸어오는데...

궁정 마도사단 단장 유리에게 '감정'을 받게 된 세이. 하지만 세이는 유리의 감정 마법을 무의식중에 튕겨내 버린다. 그것은 세이의 마력량이 유리보다 많다는 것을 의미했다. 확증은 없었지만 마력의 특이성으로 세이가 성녀라고 판단한 유리는 그것을 지그프리트 국왕에게 보고한다. 왕궁의 사자는 세이에게 국왕이 알현할 것을 요청했다고 전한다. 국왕 알현의 날 세이는 의욕이 넘치는 시녀들에 의해 아름답게 꾸며지고 세이의 호위를 맡은 알베르트와 함께 알현실로 향하는데...

세이는 정식으로 마법을 배우게 되었고 그 강사 역할은 유리가 맡게 된다. 이번 기회에 세이의 신비한 마력을 자세히 관찰하겠다고 말하며 유열에 가득 찬 유리. 하지만 유리의 지도는 예상외로 스파르타식이었고 세이는 마법의 고속 발동이라는 과제 앞에서 고전한다. 그래서 더욱 실전적인 연습으로 감각을 기르기 위해 알베르트에게 부탁해 제3기사단의 훈련에 참가한다. 그것은 모두 언젠가 토벌의 지원 요청이 들어올 때를 대비한 것이었다. 세이가 듣는 강의는 마법 외에도 있었는데 그중 댄스와 매너 등을 배우는 날을 세이는 '숙녀의 날'이라고 불렀는데...

세이와 동시에 성녀로서 소환된 또 한 명의 인물 ───미소노 아이라. 세이처럼 방치되지 않고 카일 왕자의 보호를 받았지만 그녀는 갑자기 이세계로 소환된 것에 당황하고 원래 세계로 돌아갈 수 없다는 것을 알고 눈물 흘린다. 카일 왕자는 그런 아이라를 돌보며 왕립 학원에 편입시킨다. 아이라 자신도 자신이 할 수 있는 것이라면 노력하려고 하며 마법 공부에 힘쓴다. 하지만 그녀를 지나치게 보호하는 카일 왕자의 영향으로 아이라는 학원 안에서 고립되고 만다. 그 상태를 어떻게든 바꿔 보려고 엘리자베스는 아이라에게 대화를 요청하는데...

염원하던 금서고 열람을 허가받은 세이는 더 효과가 높은 포션을 만들기 위해 연구에 몰두한다. 유리로부터 과거의 성녀는 마물을 섬멸하는 '성녀의 술법'이라는 마법을 사용했다는 말을 듣지만 자세한 기록은 남아있지 않아서 정확한 것은 알 수 없었다. 어느 날 밤 이 세계에서 만난 사람들에게 보답하고 싶어 하는 세이의 마음에서 뭔가가 솟구쳐 올랐다. 그리고 그 순간 주변으로 퍼져 나가는 금색의 빛. 그것이 무엇인지 해답을 얻지 못한 채로 세이는 서쪽 숲의 토벌에 회복 담당으로 참가한다. 세이는 유리, 알베르트와 함께 위험한 숲속을 나아가는데...

세이가 발한 빛나는 마법은 장기의 늪에서 솟아나는 마물들을 일소했다.그 일로 인해, 세이는 점점 주위로부터 성녀로서 주목받게 되어 간다.그럴 때, 왕국내에서는 엘리자베스가, 아이라에 앉아 있는 카일 왕자에게 다가오고 있었다.카일 왕자는 성녀로 알려진 세이를 부정하는 발언을 해, 마침 있던 세이는 어색해져 버린다.거기에 나타난 지크프리트 국왕이 자리를 잡았지만 카일 왕자는 근신 처분을 받게 됐다.잠시 후 엘리자베스는 세이와 아이라를 교류시키기 위해 다과회를 연다.

토벌을 위해 지방의 클라우스너령으로 원정하는 제3기사단. 위험이 따르는 임무였지만 동행하는 세이는 약초의 일대 산지인 클라우스너령에서 새로운 약초를 배울 수 있을 것으로 기대했다.영주 다니엘은 세이에게 약사 콜린나를 소개. 콜린나는 이 땅에서 '제약의 조'라 불리던 약사가 남긴 일기를 세이에게 읽게 해준다.이 약사도 성녀였을지도 모른다.그렇게 생각하던 중 지역 용병단에서 숲에 마물이 나타났다고 알려진다.제3기사단에서도 부상자가 나왔다고 듣고, 알베르트가 걱정인 세이는 무심코 달려나간다--!

다시 성녀의 기술을 내뱉은 세이는 그 발동 조건을 스스로 깨닫고 난감해했다.반면 세이의 능력을 본 용병단 레온하르트는 동료로 권유하려 하지만 그녀가 성녀라는 사실을 알고 어쩔 수 없이 포기한다.드디어 본격적인 토벌이 시작된다.성녀의 기술이 필요한 사태도 생각할 수 있지만 세이는 알베르토에게 발동 조건을 털어놓을 수 없었다.클라우스너령 숲은 생각했던 대로 진귀한 식물로 넘쳐났다.알베르트와 레온하르트에게 호위를 받은 세이는 두근거리면서 숲속으로 향한다….

슬라임의 습격을 받은 세이는 왕도에서 지원하러 달려온 유리와 아일라의 가세로 무사히 숲에서 철수했다.이후 콜린나의 도움으로 성녀의 기술을 자유자재로 발동할 수 있도록 훈련에 힘쓰는 세이.재편성한 부대에서 다시 숲으로 향하게 되지만 과거 마물 토벌로 일대를 불태웠던 유리의 참여에 고향 숲을 사랑하는 레오는 걱정스러운 표정을 짓는다.앞길에는 또다시 슬라임이 출현하는데 목적지는 숲속 깊은 곳에 있는 섬기( 行く氣)가 소용돌이치는 늪.거대한 괴물같은 슬라임도 덮쳐오는 가운데, 세이는 「성녀의 술」로 늪의 정화를 시도하지만…!?

일본에서의 지식을 활용해 다양한 상품을 개발해온 세이는 마침내 직접 만든 상품을 팔기 위한 상회를 열기로 했는데.

원래 있던 세계의 농산물을 찾아서 항구 도시 모르겐하펜을 방문한 세이. 그곳 선착장에서 사고 현장을 조우하지만 잠행이었기 때문에 회복 마법은 사용할 수 없었다. 도움을 요청하는 세이란 선장에게 가지고 있던 포션을 건네고 세이는 그 자리를 떠났는데.

왕궁에서 '성녀 세이'의 정식 소개 연회와 무도회가 개최되게 되었다. 주목받는 것을 좋아하지 않는 세이는 당황했지만 알베르트의 에스코트 신청을 받아들인다. 행사 당일, 국왕의 옆에는 성녀의 로브를 걸친 세이의 모습이 있었는데.

무역 상대국의 왕자를 유학생으로 맞이하게 되면서 세이는 한동안 왕궁에서 지내게 된다. 거기에는 국가 기밀인 성녀의 능력을 숨기기 위한 목적도 있었다. 유학생으로 오는 왕자의 나라가 이전에 만난 세이란과 같은 나라라는 사실을 알고 난 이후 나쁜 예감이 드는 세이였는데

연구소에서 만난 이후 유학생인 텐유는 매일같이 세이를 찾아서 돌아다닌다. 속이는 것도 한계라고 판단한 요한은 성녀인 것을 밝히지 않고 세이와 만나게 한다. 자기도 모르게 신이 나서 텐유와 식물에 대한 열띤 토론을 하던 세이는 텐유의 목적이 신경 쓰였는데

난병으로 고통받는 어머니가 있는 텐유는 세이란이 받았던 포션을 단서 삼아 뛰어난 실력의 약사를 찾고 있었다. 하지만, 어떤 상급 포션도 진행 중인 병에 효과가 있을 거라고는 기대하기 어려웠다. 사정을 알게 된 세이는 만능약 만들기에 도전하게 되었는데

알베르트가 이끄는 제3기사단과 세이가 나선 마물 토벌도 끝이 보이기 시작했다. 한숨 돌리던 중 앞으로는 세이의 결혼 문제가 거론될 거라고 말하는 엘리자베스. 성녀인 세이의 결혼은 왕국의 회의에서도 화제가 되었는데.

마물 토벌을 위해 알베르트의 고향 호크령을 방문한 세이 일행. 알베르트의 부모이자 영주인 호크 부부는 만찬회를 열었고 세이는 즐거운 한때를 보낸다. 다음 날, 마물이 출현하는 광산 부근은 이상한 분위기에 휩싸여 있었는데

광산이 있는 숲에 나타난 것은 살아있는 시체 같은 마수였다. 그것들을 만들어 내는 '검은 늪'을 향해 세이 일행은 광산의 어두운 갱도를 나아간다. 습격해오는 마수의 무리를 물리치고 도착한 최심부에서 풀 파워를 발휘하는 세이였는데

거대 마수를 쓰러뜨리고 '검은 늪'도 소멸시킨 세이 일행. 영주의 저택에서는 일행의 노고를 치하하는 연회가 개최되어 세이는 맛있는 요리를 마음껏 먹었다. 다음 날, 호크령의 시장을 방문하는데 동행한 알베르트는 들떠서 신이 난 세이를 눈부시다는 듯이 바라보고 있었다.

마물 토벌이 끝나면서 세이의 성녀로서의 사명은 일단락 지어졌다. 그러던 어느 날, 유리에게 양부인 드레베스 후작이 보낸 연극 초대장이 도착한다. 뭔가가 생각난 유리는 세이에게 연극을 보러 같이 가자고 권유했는데 이것이 큰 파문을 불러오게 되었는데.

세이와의 첫 만남과 지금까지의 일들을 추억하면서 자신의 마음을 마주하는 알베르트. 한편, 세이는 엘리자베스로부터 자신의 감정을 소중히 하라는 말을 듣는다. 주위 사람들 모두가 서투른 두 사람의 모습을 지켜보고 있었는데