Les touche-à-tout Yun et Haberu enquêtent sur des sons émanant d'un manoir inhabité. Ils localisent la source à proximité, tandis que Mei entend la même mélodie.

Une nuée de Rodans se dirige vers Nigashio. L'équipe de l'usine Otaki tente en vain de les éloigner de la ville, mais se retrouve rapidement encerclée.

Mei découvre un code mystérieux dans les recherches du professeur Ashihara. L'équipe d'Otaki affronte Anguirus dans le cadre du plan d'extermination de la ville.