Un robusto tanque abandona la Industria Kenbishi para dirigirse a un pueblo remoto. La Sección 9 se tiene que encargar de detenerlo y descubrir la causa del extraño funcionamiento.

Togusa investiga una instalación misteriosa gubernamental para investigar el «Síndrome de Autismo Cerebral» descubriendo una de las claves para resolver el caso del Hombre que ríe.

Después de la investigación de Togusa, la Sección 9 tiene que «detener» a un oficial del gobierno que puede tener la pista clave del caso del Hombre que ríe. Para ello tiene que atraparlo antes que el enemigo.

Togusa intenta encontrar al equipo de la Sección 9 después de salir de la cárcel e intenta asesinar al responsable de la disolución del equipo, antes de llevar a cabo la operación es detenido por Batou; y...

Togusa tiene un encuentro con un ciborg que persigue a una chica que finalmente es asesinada por él. Durante el juicio, la defensa del ciborg examina con lupa a Togusa mientras intenta probar que la muerte resultante fue un accidente.

The Chief Cabinet Secretary uses the excuse of the refugees possessing 10kg of plutonium to mobilize the military against Dejima. With the available evidence against the refugees, Prime Minister Kayabuki reluctantly agrees. However, she soon learns from the Chief Cabinet Secretary that he's aligned himself with Imperial America and is now after her job.

Knowing her days as P.M. are numbered, she agrees with Aramaki's plan and calls the U.N. in for a nuclear inspection of Dejima. The move buys them some time to defuse the situation, and Section 9 heads to Dejima to meet up with the U.N in two days. However, with tensions running high it is only a matter of time before someone fires the first shot.