ジャズピアノと読書を愛する安和隆（柄本佑）は幼いときに両親が韓国生まれと知って以来、自分が何者なのか模索していた。やがて親友の湯浅（濱田岳）と同じ大学の医学部に進み青春をおう歌。映画をきっかけに出会った終子（尾野真千子）と恋に落ちる。大学では精神科医の永野教授（近藤正臣）の影響で精神科の道を志すが、父・哲圭（石橋凌）からは猛反対を受け…。そんな和隆が暮らす神戸の街を、１９９５年１月、大地震が襲う。

大地震が起きてすぐ、安和隆（柄本佑）は勤務先の病院に向かう。そこで目にしたのは野戦病院さながらの光景だった。自分の無力さを痛感した和隆は、避難所を回りながら、精神科医として自分にできることは何かを模索し続ける。そんななか、旧知の新聞記者から「震災を内側から書いてほしい」とコラムの連載の依頼を受け……。心の傷に苦しむ被災者に寄り添う日々が続く一方、和隆の実家では父・哲圭（石橋凌）の事業が傾き始める。

震災から２か月。急速に街の再建設が進んでいく神戸。その一方で、多くの被災者が復興から取り残されていた。心の傷に苦しむ人々に寄り添い続ける安和隆（柄本佑）の前に、精神疾患を抱えた患者・片岡心愛（清水くるみ）が現れる。診察の結果、片岡の中には複数の人格が同居していることがわかる…！治療に全力を尽くす和隆だったが、父・哲圭（石橋凌）の事業が失敗したことを知り…。

震災から５年がたち、神戸の街は徐々に復興を遂げつつあった。新しい病院に移り、精神科医として理想の医療に燃える安和隆（柄本佑）。そんな中、和隆にがんが発覚する。仕事を中断して治療に専念するか、病を抱えながらも患者に向かい続けるか、選択を迫られる。自然治癒率は５００分の１。幼い２人の子どもを抱えながら、身重の妻・終子（尾野真千子）と共に有効な治療法を探す和隆は、ついに「心のケア」の本質にたどり着く…。