After working his way up from the oppressed peasant class, the rogue ninja Kamui must struggle to free himself from the iron fist of his own clan. He travels through all the country running from ruthless killers who have traveled to the ends of the Earth to destroy him.

The movie version of the ninja anime based on Sanpei Shirato's manga.

No Japão do século XVII, Kamui é um ninja que deve utilizar as suas habilidades para ferir e matar outras pessoas. Porém, quando começa a crescer nele o desprezo por esse tal código de conduta, ele se torna um fugitivo em busca da verdadeira liberdade. Caçado por traição pelos demais ninjas da ordem, Kamui salva a vida de Hanbei, um pescador que lhe oferece abrigo em sua residência como forma de gratidão. Lá ele descobre o valor da amizade com os moradores e se apaixona por Saiyaka, a filha do pescador. Porém, ao cair em uma armadilha, Hanbei e Saiyaka são assassinados e a raiva e tristeza tomam conta de Kamui, fazendo com que ele parta em busca de vingança.

Um menino chamado Jiro encontra sua mãe e irmã assassinadas em sua casa. Falsamente acusado do crime, ele foge de sua aldeia e conhece um sacerdote chamado Tenkai, que o faz matar um ninja desonesto chamado Tarouza. Após cumprir essa tarefa, Jiro passa por treinamento para se tornar um mestre assassino. Muitos anos depois, Jiro descobre que era órfão e que seu verdadeiro pai era Tarouza, que havia trabalhado para Tenkai até abortar sua missão ao se apaixonar por uma mulher Ainu. O jovem ninja descobre que o Xogunato deveria recuperar o tesouro perdido do Capitão Kidd e usá-lo para isolar mais uma vez o Japão do resto do mundo. Usando as pistas que Tarouza manteve em segredo, Jiro - junto com a ninja Oyuki e um escravo chamado Sam - viaja para a Rússia e a América em busca do tesouro na esperança de usá-lo para se vingar de Tenkai.