改编自京极夏彦百鬼夜行系列的第二部作品。榎木津礼二郎（阿部宽 饰）经营侦探事务所。一天，原电影明星柚木阳子（黑木瞳 饰）委托其受理她14岁的女儿加菜子（寺岛咲 饰）失踪一案。作家关口巽（椎名桔平 饰）和记者鸟口守彦（Magy 饰）对最近发生的美少女被肢解杀人事件十分好奇，一起前往现场追查，却在路途中迷路而误入一栋奇怪的盒状建筑物。负责侦破连续杀人事件的青木警官（堀部圭亮 饰）乘坐的列车上加菜子被撞下车送往医院。刑警木场修（宫迫博之 饰）强忍疲惫下接手处理案件，却发现加菜子的母亲，正是他暗恋多年的阳子。但日，运送加菜子的救护车和随同车辆消失在了匣馆的领地中。消失的少女、相模湖分尸杀人案、追查案件的木场和关口、盒子般奇怪的建筑物，到底是什么将他们联系在一起？魍魉，真的只存在人心吗

A series of murders of beautiful girls occur in Tokyo not long after the end of the war. Also the daughter of a retired actress, Yuzuki Yoko, has gone missing. In the meantime, a religious cult that claims to shut away misfortunes in a box has been gaining popularity, displaying an eerie aspect. Yoko's daughter is alleged to have been run over by a train, and taken into a research institute situated in a gigantic box-shaped building. A private detective Enokizu (Abe Hiroshi), a writer Sekiguchi (Shiina Kippei), a journalist Atsuko and a police detective Kiba each pursues their own case, and Chuzenji (Tsutsumi Shinichi), an owner of a secondhand bookshop, "Kyogoku Do" suspects that all cases are linked to the box-shaped research institute.

暗い性格で友達もいなかった楠本頼子は、クラス一の秀才で美少女の柚木加菜子に突然「私たちは互いが互いの生まれ変わりなんだ」と声をかけられる。始めは戸惑う頼子だったが、互いに孤独だった2人は親交を深め、2人で最終電車に乗って湖を見に行こうと約束する。しかし加菜子は中央線武蔵小金井駅のホームから何者かに突き落とされ、列車に轢かれてしまう。 たまたま勤務帰りの刑事・木場修太郎がその列車に乗り合わせていた。木場は頼子と共に加奈子が運ばれた病院へ向かうが、そこへ女優・美波絹子こと加奈子の姉・柚木陽子と出会うことになる。 一方、小説家・関口巽は稀代の新人小説家・久保竣公と出会う。そして雑誌記者・鳥口守彦と稀譚社社員・中禅寺敦子と共に、武蔵野連続バラバラ殺人事件を追って道に迷い、とある「匣」のような建物と遭遇する。その建物こそ、加奈子が収容された研究所・美馬坂近代醫學研究所だった。 同じ頃、鳥口は「穢れ封じ御筥様」の調査を行っており、関口の紹介の下拝み屋・京極堂に相談を持ちかける。 バラバラ殺人と加奈子の誘拐、事件の裏に渦巻く「魍魎」とは何なのか。

호러소설가 교고쿠 나쓰히코의 동명 소설을 원작으로 한 영화. 한 소녀가 기차역에서 사지가 잘리는 열차사고를 당하는데, 사건을 맡은 형사는 그녀가 막대한 유산 때문에 협박받고 있다는 사실을 알게 된다. 한편 시내에서는 토막난 소녀의 사체가 상자에서 발견되는 사건이 연쇄적으로 발생한다. 별개로 진행되던 사건은 명탐정 아키히코에 의해 퍼즐처럼 맞춰지며 하나의 거대한 그림을 완성해나간다.