Tai is now a university student, living alone, working hard at school, and working every day, but with his future still undecided. Meanwhile, Matt and others continue to work on Digimon incidents and activities that help people with their partner Digimon. When an unprecedented phenomenon occurs, the DigiDestined discover that when they grow up, their relationship with their partner Digimon will come closer to an end.
De wereld begon in te storten. De woedende Meicoomon absorbeert Tailmon, die een duistere evolutie heeft ondergaan, en verandert in de immens krachtige Ordinemon. Zoals voorspeld door Yggdrasil staat de echte wereld op het punt te worden opgeslokt door de digitale wereld. Ondertussen beschouwt Homeostasis Ordinemon als uit de hand gelopen en stelt hij zijn definitieve plan op dat de echte wereld zal omvatten. Het is tijd voor de DigiDestinies om een definitief besluit te nemen. Welke toekomst zullen zij voor zichzelf kiezen?
In 2012, na de gebeurtenissen in Digimon Adventure: Last Evolution Kizuna, moeten DigiDestined uit de vroege volwassenheid – Daisuke, Miyako, Iori, Takeru Takashi, Hikari en Ken – hun nieuwe verantwoordelijkheden verzoenen met hun Digimon-partners. Maar Rui Owada, een mysterieuze jongeman, verschijnt en beweert de eerste mens te zijn die samenwerkt met een Digimon-Ukkomon. Zou Rui echt de allereerste DigiDestined kunnen zijn?
Takuya Kanbara, Koji Minamoto, J.P. Shibayama, Zoe Orimoto, Tommy Himi, Bokomon, Neemon ride a Trailmon (Ball) through a desert when they get caught in a battle between human and beast Digimon. It is interrupted by the Lost Island, an island trapped between dimensions, crashing down between them and scooping all involved up.
Omnimon confronteert Mephistomon (die werd gevormd uit de gegevens van Apocalymon) in een donkere hoek van de digitale wereld over de poging van Mephistomon om zowel de digitale wereld als de echte wereld te vernietigen en de gegevens op te nemen om echt onoverwinnelijk te worden. Ze vechten, maar dan ziet Mephistomon een kans en glipt hij de echte wereld binnen.
In this movie, that takes place three months after MaloMyotismon's defeat, the DigiDestined go up against Diaboromon again. Tai and Matt head back to the Internet to deal with him with Omnimon, while the younger Chosen Children go to deal with the rampage of a swarm of Kuramon (Diaboromon's Fresh form). With the help of Angemon and Angewomon (with T.K. and Kari), Omnimon was able to destroy Diaboromon again, but it turned out to be a trap, as his destruction allowed many more Kuramon to go to the Real World. Things go out of control when the Kuramon in the Real World merge to create a Mega level called Armageddemon, an alternate Mega in Diaboromon's evolutionary line. It is so powerful that neither Omnimon nor Imperialdramon were able to defeat it on their own.
Een jaar na de gebeurtenissen van het eerste seizoen verschijnt een Digimon-virus genaamd Diaboromon dat het internet aanvalt. De kinderen en hun Digimon verenigen zich opnieuw om te voorkomen dat hij elk communicatienetwerk op de planeet vernietigt.
Het verhaal speelt zich af in de Verenigde Staten. Wallace is een Digisavior die in de VS woont, maar in tegenstelling tot de andere kinderen heeft hij twee Digimons. Helaas werd een van hen besmet met een virus, waardoor hij geleidelijk kwaadaardig werd. Een paar jaar later reizen Hikari en Takeru door New York wanneer Hikari een vreemde aanwezigheid voelt. De tieners komen oog in oog te staan met de kwaadaardige Digimon en vervolgens met Wallace, die de enige lijkt te zijn die hem kan tegenhouden. De Japanse Digisaviors zullen zich dan verzamelen om hem te helpen.
Upon arriving at the Digital World after the "reboot", the Digidestined are hunted by a new villain. Meanwhile, Sora is troubled by her partner Digimon's indifference towards her.
After seeing Meicoomon's abrupt transformation and killing of Leomon, Agumon and the other Digimon are kept isolated in Koushiro's office in order to prevent them from infection, but signs of infection begin to appear in Patamon.
The DigiDestined go to a nearby hot springs theme park and everyone has a good time, but Joe doesn't show up because he wants to study for his exams. Another infected Digimon, Ogremon, attacks Odaiba. Gomamon runs away from home while Mimi faces problems with the other DigiDestined and her classmates because of her selfish ideas.
Het is zomervakantie! Voor Gingka en Co, die enthousiast zijn over een Beyblade-toernooi, staat Helios, een mysterieuze jongere, hen in de weg. In zijn handen bezit hij 'Sol Blaze', een Beyblade die al sinds de oudheid wordt doorgegeven. Terwijl de intense strijd tussen Gingka en Helios zich ontvouwt, ontwikkelen zich over de hele wereld extreme weersomstandigheden.
Meicoomon rampages after witnessing Meiko Mochizuki being injured by the man bearing Gennai's likeness. "It would have been better if you hadn't been born..." Meicoomon disappears into the Real World, which has since become distorted. Possessing overwhelming power, she's the key to the world's destruction.
The Dematerialization Phenomenon, in which the real world becomes digital, has become a problem and must be resolved immediately. After hearing of this incident, Netto and Rockman left off after their father and Network Researcher, Yuuichirou. He also had found news of an invasion in the computer of the Trinity Brain trust company: 'The Earth itself will understand the way things stand in the cyber world'. In order to destroy the program causing the incident, Netto and Rockman have to go deep underground. But old enemies await them there, as well as new ones. As they fought each other, the vicious cyber-life, Nebula Grey, awakens. The Dematerialization Phenomenon will not be stopped unless Nebula Grey is defeated.
De film begint rond Agumon, Gaomon en Lalamon, wier partners samen met de rest van de stadsbevolking in een magische slaap zijn geplaatst door een mysterieuze doornige wijnstok die zich door de stad verspreidde. Terwijl de Digimon zich een weg banen door de stille stad, komen ze een roedel Goblimon tegen, geleid door een Ogremon, die een jong meisje aanvallen. Ze schrikken de goblins af, en het meisje, Rhythm, onthult dat ze eigenlijk een Digimon is, en legt vervolgens uit dat de doornen het werk zijn van een Digimon genaamd Argomon. Het kwartet gaat de confrontatie aan met de slechterik bovenop zijn wolkenkrabberhol.
De allereerste Gear die ooit ter wereld is gemaakt, wordt gestolen. Het toestel, genaamd Kaiservern, verslaat de prijswinnaars van de Australische conventie één voor één. Kouya en Manganji, die een prijs hebben gewonnen op de Azië-conventie, worden ook doelwitten. Wanneer de onbekende uitrustingsjager die Kaiservern afhandelt voor Kouya en Manganji verschijnt, besluiten de twee jongens samen te vechten om de overwinning op hun vijand te behalen.