Tôma, un ado aux dons surnaturels, fait équipe avec Index, une religieuse, contre des magiciens en quête des grimoires interdits implantés dans l'esprit de celle-ci.
Mikoto utilise son pouvoir de contrôle sur l'électricité pour aider à maintenir l'ordre dans la Cité Académique, qu'habitent surtout des étudiants psychiquement doués.
L'histoire nous entraîne dans un monde où certains enfants, durant la puberté, développent des pouvoirs spéciaux. Yū Otosaka est un étudiant de première année, banal, et tout ce qu'il y a de plus normal mais… seulement en apparence car en effet, il est l'un de ces adolescents à posséder des pouvoirs, appelés ESPers. Son pouvoir lui permet de prendre possession de n'importe quel corps de son choix pendant cinq secondes.
Il va par la suite faire la mystérieuse rencontre de Nao Tomori, présidente du Bureau des Élèves de l'académie Hoshi-no-Umi qui le mènera à la révélation du sort qui attend tous les détenteurs de ces capacités spéciales…
Ghost Hunt suit les aventures de chasse aux fantômes de Mai Taniyama, un étudiant de première année qui s'implique avec Shibuya Psychic Research (SPR) et son jeune responsable, Kazuya Shibuya. Les surnoms de Mahum Kazuya Shibuya "Naru" en raison de son attitude narcissique ( narushishisuto ) , et le surnom est généralement adopté par tous ceux qui viennent travailler avec SPR: le moine bouddhiste Houshou Takigawa; La jeune fille du sanctuaire Ayako Matsuzaki; Celebrity teen psychic Masako Hara; Et le prêtre catholique John Brown.
Vers la fin du 20e siècle, le Japon devient la 1ere puissance mondiale. En conséquence, des organisations terroristes commencent à cibler le pays dans l'espoir de déstabiliser la politique mondiale. L'une des plus dangereuses est le Mai Rouge, une organisation dédiée à la propagation du communisme. Pour contrer la violence croissante, le gouvernement met en place une cellule spéciale : la Special Security Force, qui vient de s'enrichir d'un nouveau membre en la personne d'Angel, une dure à cuire. Elle et le reste de la S.S.F. doivent faire face au Mai Rouge et à une mystérieuse force extérieure ayant ses propres objectifs.
Nitta Yoshifumi est un jeune yakuza qui gère ses affaires avec rigueur dans le secteur qu'il occupe. Mais un jour débarque Hina, une jeune fille dotée de pouvoirs télékinétiques. Elle oblige Nitta à l'accueillir chez lui, mettant ainsi fin à sa vie tranquille et bien rodée, car si les pouvoirs de Hina sont parfois utiles à Nitta, elle a aussi tendance à en perdre le contrôle. Malgré ces désagréments, notre yakuza prend soin de la fillette. Que peut-il advenir de cet étrange arrangement ?
Haruka Kotoura est une jeune fille qui vient d'être transférée dans une nouvelle école. Il se trouve que Kotoura-san a le don de lire dans les pensées des gens. Pour certains, c'est un don, pour d'autres une malédiction et à cause de son "don", elle n'arrête pas d'être rejetée par tous le monde, elle est traitée de monstre et bien d'autres choses. Elle ne fréquentait personne jusqu'à sa rencontre avec Yoshihisa Manabe, son camarade de classe.
Amane Todoroki est une jeune fille simple et insouciante, prête à foncer tête baissée dans n'importe quelle situation. Elle est l'une des rares personnes dotées de pouvoirs appelés "ISH". Ces pouvoirs lui permettent de matérialiser ce qu'elle imagine par la pensée. Amane est membre de "Nought", une troupe organisant des spectacles de magie. Lors d'un de ces spectacles, une jeune fille apparaît devant Amane. Il s'agit de la populaire Aya, membre du groupe "IAM" . Comme Amane, Aya possède l'ISH.