Il film è ambientato 25 anni dopo gli eventi di Pomodori assassini (denominato la Grande Guerra del Pomodoro nel film). Questi ortaggi sono stati completamente banditi e molti sono ancora terrorizzati dall'esperienza. Uno scienziato pazzo, il Prof. Cancrena (che si scoprirà essere l'artefice dei pomodori del primo film) è intenzionato a conquistare il mondo mediante una speciale macchina in grado di mutare i pomodori in esseri umani. Tra le creazioni vi è Tara, volendone fare sua amante. Ma la donna fugge assieme a FT, un pomodoro peloso frutto di un errore genetico e maltrattato dal professore. Tara s'innamorerà di Chad, un ragazzo che consegna pizze e ignaro delle origini della donna, ma il Prof. farà di tutto per riaverla accanto e attuare il suo piano malvagio.
Ex-Green Beret Matt Collins is kidnapped along with his fiancée, Lauren Sadler, by crazed hunter extraordinaire Danton Vachs. Every year he holds a contest where people can purchase the right to hunt down and kill a human being. This time, Collins is to be the hunted. Vachs uses Lauren as motivation for Collins to really fight to survive and thus provide the buyers with a truly exceptional hunt. Collins is turned loose on an uncharted island and four killers set out to find and kill him.
Two men face the consequences of gambling after playing with men beyond their league.