Une fois installé à Green Hills, Sonic est déterminé à prouver qu’il a la trempe d’un héros. Il est mis à l’épreuve alors que le Dr Robotnik réapparaît, cette fois-ci avec un nouveau partenaire, Knuckles, cherchant une émeraude qui aurait le pouvoir de détruire des civilisations entières. Et voilà Sonic aux côtés de son propre acolyte, Tails, qui s’aventurent dans une mission de globe-trotter pour trouver l’émeraude avant qu’elle ne tombe dans de mauvaises mains.

Pour échapper à ses ennemis, le petit Sonic est projeté dans notre monde. Il mène une existence paisible, mais solitaire pendant dix longues années jusqu'à ce que sa vie soit à nouveau menacée. Pour ne pas être capturé par le vilain docteur Robotnik, Sonic devra se rendre à San Francisco afin de récupérer les anneaux qui lui permettront de se sauver dans une nouvelle dimension. L'agent de police Tom Wachowski, que Sonic observe dans l'ombre depuis des années, l'accompagnera dans son périple. Les deux nouveaux amis vivront bien des aventures sur la route les menant jusqu'en Californie.

Sonic, Tails, and Knuckles encounter an abandoned Badnik drone which upgraded itself using parts from a junkyard, with the intention of conquering the world.

While escorting Dr. Eggman and his hapless new helper Trip through a perilous ruin, Fang the Hunter will need to muster all his cunning to overcome past mistakes and escape the coils of a fierce new enemy. Meanwhile, Eggman discovers what may be the key to his next dastardly scheme.

Based on the well-known video game.