Индијана Џонс није обичан археолог. Први пут ћемо га угледати у џунглама Перуа 1936. како трчи кроз постављене замке не би ли се докопао идола од чистог злата. Тај предмет му је отео главни супарник, француски археолог Белок који се припрема да убије нашег јунака. У првом од серије многих сличних бекстава, Инди успева да умакне Белоку тако што је ускочио у авион који се сасвим случајно ту затекао. Када идућег пута будемо видели Џонса, он ће бити речит професор са наочарима. Затим ће га Маркус Броди позвати да нађе давно изгубљен Заветни ковчег. Али да би нашао Ковчег, Инди најпре мора да осигура медаљон који се налази под заштитом Индијевог старог пријатеља Абнера Рејвенвуда, чија је кћерка Марион била у вези са Џонсом. Без обзира на своје личне размирице, Инди и Марион постају партнери у овој авантури која иде од лутања рупама пуним змија у Бунару душа до преживљавања ископавања Изгубљеног ковчега.

Радња другог филма у филмском серијалу Џорџа Лукаса и Стивена Спилберга одвија се годину дана пре догађаја из филма "Отимачи изгубљеног ковчега" (1984). Након кратког сукоба око драгоцене епрувете и дивље вожње низ помахниталу реку на Хималајима, Инди (Харисон Форд) почиње да се бави текућом проблематиком: како пронаћи драгоцени драгуљ и неколико отетих дечака и вратити их у забачено источноиндијско село. Овога пута, његови пратиоци су приглупа и лако страшљива певачица из ноћног клуба (Кејт Кепшо) и враголаст дванаестогодишњи клинац по имену Шорти (Џонатан Ке Кван). У филму је заплет у другом плану у односу на узбудљиву акцију која обухвата језиву вожњу кроз напуштено рударско окно и Индијево спашавање главне јунакиње од ритуелног обреда приношења жртве. Има и неколико шаљивих спомињања филма "Отимачи изгубљеног ковчега", пре свега духовите варијације на тему Индијевог пуцања у ратника Шерпаса.

Индијана Џонс (Харисон Форд) креће у потрагу за Светим Гралом, из кога је наводно Исус пио на последњој вечери. Свакоме ко пије из њега он доноси вечну младост, али Индија Свети Грал занима само из једног разлога. Његов отац, Хенри (Шон Конери), је нестао када је кренуо у потрагу за Гралом. У потрази ће му помоћи сарадница његовог оца, као и очев дневник. Ипак, не иде све по плану и ускоро креће авантура у којој упознајемо и Индијевог оца.

Индијана Џонс, познати археолог и истраживач, удружује се са младим човеком, Мутом Вилијамсом, како би открио мистерију иза легендарних кристалних лобања.

Нашавши се у новој ери, приближавајући се пензији, Инди се бори са уклапањем у свет за који се чини да га је прерастао. Али док се пипци превише познатог зла враћају у облику старог ривала, Инди мора да стави шешир и још једном подигне бич како би се уверио да древни и моћни артефакт не падне у погрешне руке.