La squadra omicidi del commissario Moser sta investigando su un killer professionista che uccide le sue vittime con un colpo di pistola alla nuca. Durante lo svolgimento dalle indagini, Stockinger chiama Moser a casa per avvertirlo che l'uomo è stato individuato alla stazione centrale di Vienna. I due, insieme a Rex, corrono sul luogo per catturarlo e, grazie al loro collega a quattro zampe, riescono ad arrestarlo. Ma, quando lo portano alla centrale per interrogarlo, trovano ad aspettarli un avvocato che riesce a far liberare subito il suo cliente. Intanto, il mandante del killer, messo a conoscenza dell'accaduto ed avendo paura che qualcuno possa risalire a lui, ordina a uno dei suoi uomini di rapire Rex, pensando così di poter ricattare Moser e di indurlo a rinunciare alle indagini. La mattina seguente, mentre Rex torna dalla panetteria dove di solito va a prendere la colazione, un uomo lo blocca nel portone di casa e gli spara una pallottola narcotizzante, quindi lo carica su un furgone e scappa. Poco dopo, Moser riceve una telefonata dal rapitore, che lo informa del rapimento di Rex e lo minaccia di uccidere il cane se non chiude il caso che sta lavorando. Preso dal panico, Moser decide di seguire alla lettera gli ordini dei rapitori, senza informare nessuno di ciò che sta accadendo, neanche i suoi colleghi di lavoro. Ma questi ultimi, rendendosi conto che c'è qualche cosa che non quadra, chiedono spiegazioni. Moser, allora, decide di dir loro tutto pregandoli, però, di non immischiarsi. Ma Stockinger e Höllerer decidono comunque di aiutarlo. I tre si mettono subito al lavoro dividendosi i compiti: Moser e Stockinger alla ricerca di Rex, mentre Höllerer deve occuparsi di arrestare il killer, che sta per lasciare il paese. Alla fine la squadra riesce a trovare e liberare Rex, ma anche ad arrestare il killer ed il suo misterioso mandante.