Jonas Maury, sur le terrain en Turquie, doit mener un interrogatoire. Sur la base militaire de Iskenderun, il tente une manoeuvre pour localiser un djihadiste français. Marie-Jeanne et Raymond se recueillent sur la tombe d'Henri Duflot. Le bureau, à la recherche Malotru, est sur une piste à Moscou...

Liz, bras droit de JJA, est infiltrée au sein du BDL, sous couvert d'un audit de fonctionnement. Elle cherche à en savoir plus sur Malotru, pour protéger les intérêts de la DGSE. Celui-ci se rend chez Tatiana Khlebnikova, pour parler de la mort de son mari. Il envoie un message codé au BDL...

JJA interpelle Marie-Jeanne. Malotru a été arrêté. Il est désormais aux mains du FSB. Il lui demande de prendre du recul. En Russie, Malotru tente de survivre en prison mais sa situation est précaire. Des instructions spéciales ont été transmises aux détenus le concernant...

Marie-Jeanne fait part de ses doutes à Marc Lauré, passé dans le privé, après l'échange qu'elle a eu avec JJA. Elle s'explique avec Raymond, suspicieux. L'équipe, sur la brèche, tente de devancer Malotru, en anticipant ses prochaines actions...

Un groupe de hackers a piraté le matériel de Marina, alias Rocambole, infiltrée à Moscou. Mais la tentative d'intrusion a été repérée. Les geeks du BDL tentent de remonter le fil. Malotru passe un marché avec le FSB, suivant l'idée que lui a soufflé Marie-Jeanne. Jonas prend des risques sur le terrain...

Après avoir vu le collecteur, Jonas et Jean-Paul sont à Rakka en Syrie. Ils sont momentanément pris en charge par un groupe de militantes armées qui cherchent à prendre le contrôle de l'hôpital. En France, Cesar, qui doit prendre l'identité de Sylvain, met au point son récit dans les moindres détails...

A Damas, Jonas et Jean-Paul attendent vainement des autorités syriennes l'ouverture de la morgue. Ils ne peuvent pas confirmer le décès d'Iode 3. JJA découvre une faille dans la légende de César. Il alerte aussitôt le Bureau des légendes, qui réagit. A Moscou, Malotru est chargé de l'accueil d'Ellenstein, qui n'est autre que César. Karlov et un psychologue visionnent l'enregistrement de leur entretien, pour tenter de déterminer leur sincérité...

Karlov propose à Malotru de rejoindre le FSB et de travailler pour eux depuis Moscou. En France, le personnel du Bureau des légendes, Sisteron en tête, doit répondre à un questionnaire concernant Marie-Jeanne. Un document à charge que JJA veut exploiter pour faire son procès lors d'une réunion des directeurs. Marina vit mal que la DGSE utilise Micha, elle craint d'être, une fois de plus, à l'origine d'un drame...

Sisteron prévient Marina qu'elle a été dénoncée mais que son arrestation servirait une mission primordiale. Il la laisse à la frontière face à un choix cornélien. Malotru dit adieu à Samara et rentre en France où il est mis au secret. Jonas a perdu la trace d'Iode 3 et fait appel à l'intelligence artificielle pour tenter de le retrouver...

En Ukraine, Malotru se rend sur le lieu de l'échange pour récupérer Marina. Sur le chemin du retour, leur escorte dévie de l'itinéraire convenu avec la DGSE. Il alerte Sisteron. A Paris, comprenant que la vie de Malotru est en jeu, Marie-Jeanne affronte JJA et Ponte. Jonas interroge Iode 3 pour empêcher un attentat imminent en France...

JJA, le directeur de la sécurité interne, a repris la direction du Bureau des Légendes pour y mettre de l’ordre tandis que Marie-Jeanne s'est s’éloignée de Mortier et teste sa résistance au stress sur le terrain en Egypte. La DGSE est secouée par les révélations concernant l'exécution de Paul Lefebvre...

Peut-on considérer que le bilan de Malotru est globalement positif ? En mettant en balance compromissions, marchandages et collaborations hasardeuses nouées au fil de ses missions, le résultat peut sembler mitigé, voire douteux. Parviendra-t-il à tirer son épingle du jeu sans éveiller des soupçons ?

Sisteron est envoyé dans le plus grand secret au Caire, en Egypte, afin de soutenir Marie-Jeanne dans sa mission. Pendant ce temps, Jules annonce à JJA qu'il a retrouvé la trace de Sylvain grâce à son téléphone portable. Le traçage numérique indique qu'il se trouve à Phnom Penh, au Cambodge. Le FSB propose au jeune homme de travailler sur un projet dangereux au sein de la cellule cambodgienne.

Liz Bernstein et la Mule poursuivent discrètement leurs investigations afin d'identifier la taupe au sein du service. Après quelques semaines de repos en Sologne, Marina retrouve son poste à Paris. Sisteron la charge de former Andrea sur les programmes informatiques utilisés par les hackers israéliens. Pendant ce temps, à Phnom Penh, Sylvain a décidé de collaborer au sein du groupe dirigé par Véra. A Paris, ses supérieurs s'interrogent sur sa capacité à gérer le danger inhérent à cette mission.

Une rencontre entre les différents chefs des tribus du Sinaï doit se tenir à l'hôtel Nile Sorman où est infiltrée Marie-Jeanne. Fouad, l'agent égyptien chargé de la sécurité de l'événement est reçu à la DGSE à Paris afin d'obtenir le soutien des Français. L'agent Brice Albrecht cherche à avoir des informations sur l'activité de l'Etat Islamique dans cette région. De son côté, Marina rejoint Andrea en Jordanie afin de l'aider dans sa mission.

En haut lieu à la DGSE, le travail de JJA est examiné avec attention. Liz Bernstein s'intéresse notamment à la façon dont il gère Pacemaker qui se trouve en mission au Cambodge. Au Caire, Marie-Jeanne découvre que sa chambre d'hôtel a été truffée de micros. Elle est convaincue que Fouad et son équipe l'écoutent à son insu. De son côté, Pacemaker est surveillé de près par le chef de la sécurité de la cellule du FSB.

JJA reçoit l'autorisation en haut lieu de recruter Mikhaïl, l'un des responsables du renseignement au FSB. Il entre en contact avec Pavel, à Moscou, pour mettre au point une stratégie. De son côté, Sylvain est envoyé à Séoul par les Russes afin d'enrôler Yellow Joon, un hacker de génie. A Paris, Sisteron avoue avoir perdu confiance en JJA. Il réclame une entrevue avec le patron de la DGSE pour s'en expliquer.

Mikhaïl Karlov reçoit par colis la clé USB dont Sylvain se sert pour travailler au quotidien. A la fois surpris et inquiet, il tente de joindre le jeune hacker qui travaille avec Véra à Phnom Penh. Il apprend que le jeune homme est en mission à Séoul et prend aussitôt un vol pour l'y rejoindre. Pendant ce temps, Alexis Bakatine, le responsable de la sécurité au FSB, poursuit son enquête sur l'espion «Septembre Noir» afin de savoir si Pavel est un agent double.

Marie-Jeanne quitte l'Egypte et retrouve un poste à Paris, au Bureau des légendes. Sisteron est chargé de lui faire un briefing sur les dossiers en cours. De son côté, Mikhaïl doit expliquer à sa femme et à son fils la situation difficile dans laquelle il se trouve au sein du FSB. Jonas découvre avec stupeur que la jeune femme avec qui il entretient une liaison depuis plusieurs semaines travaille... pour les Russes.

Marie-Jeanne présente sa candidature pour succéder à Michel Ponte au poste de directeur du service. Elle cherche à savoir qui la soutiendra parmi ses collègues. Pendant ce temps, Jonas reçoit l'aide de Marina afin de pouvoir confondre l'agent étranger qui travaille pour les Russes. La disparition de Mikhaïl soulève de nombreuses questions au sein de la DGSE. Certains pensent qu'il a préparé une action pour se venger.