Scavando nei misteri del bizzarro delitto del lago, Peggy scopre che l'indagine rischia di mettere in pericolo la sua carriera e la vita dei suoi affetti piu' cari.

Peggy fa di tutto per fermare un'esplosione nucleare che minaccia tutta la California, mentre l'esperienza e la prontezza di Jarvis vengono messe a dura prova.

Peggy si rivolge a un avversario inaspettato per farsi aiutare a salvare Wilkes mentre Whitney cerca di prendere il controllo della pericolosa Materia Zero.

Peggy pianifica una missione di salvataggio mentre Whitney cerca ancora più potere oscuro. Nel frattempo, Jarvis impara che non dovrebbe fare promesse che non può mantenere.

Peggy e Sousa propongono uno scambio a Whitney Frost. Allo stesso tempo, la chiave per eliminare la Materia Zero potrebbe essere la collaborazione di Howard Stark con il SSR.

Peggy deve sopportare uno scioccante tradimento mentre procede con il suo piano per salvare il dottor Wilkes e fermare Whitney Frost. Nel frattempo, una mossa non prevista di Thompson mette tutti in pericolo.

Nel finale di stagione tutti affrontano una missione estremamente pericolosa quando Peggy sollecita Howard Stark per eliminare la Materia Zero.