Il ne reste que deux singes vivants pour les tests de Rachel, très inquiète. Mais un espoir se présente lorsque l'équipage reçoit un appel de détresse d'un bateau de pêche sur lequel survie une Jamaïcaine entourée de cadavres infectés par le virus. Son immunité l'encourage à faire un prélèvement d'ADN qui s'ajouterait à ses recherches.

Les Russes ont capturé Chandler et Tex et proposent de les échanger contre le Dr Scott, qui vient juste d'élaborer un premier vaccin. Alors que la scientifique est transférée sur le paquebot russe, Slattery organise un plan d'attaque pour les libérer…

Maintenant qu'elle a développé un vaccin, Rachel Scott doit le tester sur des êtres humains. Six personnes se portent alors volontaires mais toutes vont présenter de nouveaux symptômes. Sur le sol américain, le père et la femme de Chandler tentent de réparer leur radio pour joindre l'USS Nathan James…

Maintenant qu'ils disposent du vaccin et du remède contre le virus, surnommé « la grippe rouge », Chandler et l'équipage de l'USS Nathan James rentrent à Baltimore, où politiques et seigneurs de guerre s'affrontent pour garder le contrôle de la ville. Chandler espère y retrouver sa famille et la sauver avant que l'infection ne les emporte…