L'equipaggio mette le mani su un trasporto imperiale e la gang riesce a infiltrarsi nell'astronave di Tarkin che si trova nel sistema Mustafar. Ezra riesce a liberare Kanan, mentre Hera, Sabine e Zeb si occupano di stabilire una linea di fuga. Su Lothal, Tarkin presenta all'Agente Kallus un altro agente selezionato dall'Imperatore per schiacciare i ribelli: Darth Vader.

Ahsoka manda l'equipaggio dei ribelli in cerca del il capitano Rex, un eroe di guerra che Ahsoka vuole trovare e reclutare per la loro causa. Il capitano Rex si considera troppo vecchio per combattere e la missione è a rischio.

Ezra e l'equipaggio cominciano a stringere amicizia con il Capitano Rex e i suoi uomini, questo li spinge a lavorare insieme per respingere un attacco da parte dell'agente Kallus.

Ezra e Kanan vengono inviati ad indagare sui rapimenti dei neonati da parte dagli Inquisitori, qui scoprono che gli questi ultimi sono alla ricerca di bambini sensibili alla Forza.

Kanan, Ezra, e Ahsoka ritornano al Tempio degli Jedi su Lothal in cerca di risposte da Yoda e scoprire come gli inquisitori siamo sempre stati in grado di monitorare i ribelli.

Kanan, Ezra e Ahsoka cercano di ottenere informazioni sul Sith per combattere gli Inquisitori con l'aiuto di un nuovo alleato, ma con l’arrivo di Vader si trovano in inferiorità numerica. Per sconfiggere gli inquisitori Ezra accetta l’aiuto di Maul, nonostante i dubbi di Kanan e Ahsoka. Maul tradisce il gruppo e acceca Kanan. Darth Vader combatte con Ahsoka mentre il Tempio collassa. Ahsoka vede il vero volto di Darth Vader.

Mentre gli altri ribelli sono impegnati contro le forze imperiali al di fuori del Tempio Jedi, Ezra è al suo interno dove, grazie a un flashback, ha una straordinaria rivelazione.