Die Bok’Nor, ein cardassisches Transportschiff, explodiert ganz in der Nähe der Raumstation. Spuren weisen darauf hin, dass das nicht die Tat bajoranischer Terroristen, sondern der Föderation ist! Das bestätigt auch Gul Dukat, der unerkannt auf die DS9 gekommen ist. Er will Sisko seinen Verdacht beweisen. Da wird ein Schiff der Föderation von Cardassianern angegriffen …

Gul Dukat ist entführt worden. Die Kolonisten Amaros und Sakonna, die zur Widerstandsgruppe „Maquis“ gehören, haben ihn in ihrer Gewalt. Sie leben an der entmilitarisierten Grenze zu Cardassia und stehen seit der Grenzverschiebung nicht mehr unter dem Schutz der Förderation. Sie wollen sich, wenn nötig mit allen Mitteln, gegen die Agressionen der Cardassianer wehren.

Quark findet in einem Schiffswrack ein Baby und bringt es zu Dr. Bashir. Mit dem Kleinen stimmt etwas nicht: Es hat einen ungewöhnlichen Stoffwechsel und wächst ungeheuer schnell. Schon nach kurzem entwickelt es sich zu einem ausgewachsenen und äußerst angriffslustigen Jem’Hadar, der außerdem süchtig nach einer bestimmten Substanz ist. Nur vor Odo, dem Wechselbalg, hat er Respekt …

Die wählerische Kira ist begeistert. Riker. der erste Offizier der Enterprise, ist zu Besuch auf der Raumstation und macht großen Eindruck auf sie. Die Majorin führt ihn über die Deep Space Nine und zeigt ihm alles. Auf der Defiant angekommen greift Riker Kira plötzlich an. Er entführt sie und das Schiff. Bald stellt sich heraus, wer Riker wirklich ist.

Die Ravinok, ein altes cardassianisches Schiff mit bajoranischen Gefangenen, ist vor sechs Jahren verschwunden. Nun will ein Freund Kiras es entdeckt haben und sie deshalb treffen. Da will Gul Dukat höchstpersönlich Kira begleiten. Bald stellt Kira fest, warum: Dukats uneheliche Tochter war auf dem verschollenen Schiff. Er will sicher gehen, dass sie tot ist. Oder sie selbst töten.

Odo ist eifersüchtig: Missmutig sieht er zu, wie sich Kira und Premierminister Shakaar immer besser verstehen. Deshalb kann Odo sich auch nicht auf seine Arbeit konzentrieren – obwohl er weiß, dass eine cardassianische Extremistengruppe ein Attentat auf den Minister plant. „Der wahre Weg“ will Shakaars Verhandlungen mit der Föderation auf DS9 stoppen. Und beinahe gelingt ihm das.

Worf wird angeklagt, ein ziviles Transportschiff der Klingonen mit 400 Passagieren an Bord angegriffen und vernichtet zu haben. Die Klingonen verlangen seine Auslieferung. Auf Deep Space Nine kommt es zum Prozess.

Ein Stoßtrupp der Jem’Hadar überfällt Deep Space Nine. Captain Sisko nimmt die Verfolgung auf. Unterwegs trifft er auf ein weiteres Jem’Hadar-Schiff, das die Täter verfolgt. Dessen Commander, der Vorta Weyoun, schlägt Sisko ein Büdnis vor.

Quark hat sich verspekuliert und ist pleite. Da er auch geliehenes Geld eingesetzt hat, muss er schnellstens Geld beschaffen. Sein Cousin Gaila schlägt ihm einen Waffendeal vor. Bald plagen Quark Gewissensbisse.

General Martok soll ein vermisstes Schiff suchen und bittet Worf, ihn zu begleiten. Als sie das Schiff entdecken, verweigert Martok die Hilfe. Sie befinden sich im cardassianischen Raum und er will das Dominion nicht provozieren. Es kommt zum Streit.

General Martok nimmt Verstärkung für seine Truppen an Bord. Unter den Kriegern entdeckt Worf seinen Sohn Alexander. Zwischen den beiden kommt es bald zum Streit. Worf verlangt von Martok, dass Alexander versetzt wird.

Ein Fremder, der dem verstorbenen Bareil bis aufs Haar gleicht, beamt auf die Station und nimmt Kira als Geisel. Es handelt sich um Bareil aus dem Spiegel-Universum. Er ist auf der Flucht vor der Allianz. Kira will ihm helfen.

Sisko begleitet Dukat auf der Honshu zu dessen Prozess. Als das Schiff angegriffen wird, retten sich die beiden in einem Shuttle auf einen einsamen Planeten. Während sie auf Hilfe warten, versucht Dukat Sisko von seiner Unschuld zu überzeugen.

Captain Sisko zweifelt an seinem Auftrag auf DS9. Er spielt mit dem Gedanken, den Dienst zu quittieren. Plötzlich hat Sisko eine Vision: Er befindet sich im New York der 50er-Jahre und schreibt eine Science-Fiction-Geschichte über eine Raumstation.

Nog wird beauftragt, dem Großen Nagus eine Botschaft zu überbringen. Sein Freund Jake soll ihn begleiten. Während des Fluges werden sie angegriffen. Die U.S.S. Valiant, die seit acht Monaten vermisst wird, kommt ihnen zu Hilfe.

Captain Sisko ist auf der Suche nach dem Drehkörper des Abgesandten. Gemeinsam mit seinem Vater, Jake und Ezri Dax fliegt er deshalb zum Planeten Tyree. Kira gerät unterdessen in eine Auseinandersetzung mit den Romulanern.

Der alte klingonische Dahar-Meister Kor ist auf Deep Space Nine. Er stattet Worf einen Besuch ab und bittet ihn um einen Job. Er wäre mit allem zufrieden, wenn er nur wieder kämpfen könnte. Über General Martoks Kopf hinweg stellt Worf ihn als Dritten Offizier ein.

Auf dem Planeten AR-558 trifft Captain Sisko auf Truppen der Sternenflotte. Sie halten ein Kommunikationszentrum des Dominion besetzt. Die Belagerten sind den feindlichen Jem’Hadar-Truppen weit unterlegen. Sisko beschließt, ihnen zu helfen.

Vedek Fala, Kiras ehemaliger Lehrer, stattet ihr einen Besuch ab. Er gibt ihr einen Kristall, der sie nach Empok Nor befördert. Dort erwartet sie ihr alter Feind Dukat, der inzwischen Anführer einer Sekte ist. Dukat verlangt von Kira, dass sie sich ihm anschließt.

Auf Deep Space Nine geschehen mehrere unerklärliche Morde. Ezri erhält von Sisko den Auftrag, den Täter zu finden. Dazu ruft sie den Mörder Joran, einen ihrer früheren Wirte, zu Hilfe.

Kira, Damar und Garak gelingt es freizukommen. Die Cardassianer schlagen sich schließlich auf die Seite der Föderation. Unterdessen will Kai Winn die Pah-Geister aus den Feuerhöhlen befreien.