Böse Überraschung für Captain Crane: Seine Freundin Alicia entpuppt sich als Agentin. Da wird ein Anschlag auf Alicia verübt. Bevor sie stirbt, singt sie Crane eine Melodie vor, die eine geheime Botschaft enthält. Nun sind Polizei und Geheimdienste hinter Crane her.

Die Seaview befindet sich auf Exkursion in die Antarktis. Nelson und Crane stellen entsetzt fest, dass der Himmel dort ein einziges Flammenmeer ist. Das Eis des Südpols droht zu schmelzen. Nelson fasst einen gefährlichen Plan, um die Flammen zu löschen.

Die Seaview-Crew entdeckt einen mysteriösen Unterwasser-Bunker. Im Inneren stößen sie auf zwei schlafende deutsche Offiziere aus dem Zweiten Weltkrieg. Kaum erwacht, verfolgen die beiden Deutschen ihr altes Ziel: Die Allierten zu vernichten.

Ein Flammenwesen aus dem All vernichtet in der Arktis eine Forschungsstation. Auch die zur Hilfe geeilte Seaview wird bedroht. Das Wesen will mit dem Reaktor der Seaview seine schlafenden Artgenossen aus dem Packeis befreien.

Der Puppenspieler Multiple versetzt die Besatzung der Seaview in Tiefschlaf und ersetzt sie durch seine Puppen. Er nimmt Captain Crabe sowie Admiral Nelson gefangen und entführt die Seaview. Das Schiff soll einem außerirdischen Maschinenwesen als neuer Körper dienen.