Anno 0079 dell'Era Universale. Peter Rei, un giovane di Side 7, si ritrova suo malgrado a difendere la colonia dall'incursione di due giganteschi robot, alla guida della nuova arma della Federazione: il Gundam, un potentissimo robot, con il quale sbaraglia gli avversari, pur non sapendo manovrarlo correttamente.

L'attacco a Side 7 è iniziato e tra i feriti gravi vi è anche il comandante della Base Bianca. Scia, che ha ricevuto dal suo sottoposto Slender un rapporto su Gundam, decide di recarsi di persona a controllare.

La Base Bianca ha preso il volo verso Luna 2, ma Scia la segue a bordo del suo Musai, però senza poterla attaccare, perché a corto di munizioni. Avvistata la nave rifornimento che s'avvia a trasferire il suo carico d'armi sul Musai, Bright si trova di fronte a una difficile scelta: cercare di fuggire su Luna 2 o abbattere la nave prima che possa caricare le armi sul Musai?

Finalmente arrivati su Luna 2, i nostri amici trovano una brutta sorpresa: il comandante della base, Wackein, si rifiuta di accogliere i civili e anzi mette in isolamento Bright e gli altri della Base Bianca con l'accusa di aver permesso a un civile come Peter Rei di utilizzare un'arma segreta quale è il Gundam.

Mentre la Base Bianca si avvia finalmente a entrare nell'atmosfera terrestre, Scia sferra un nuovo attacco! Peter Rei esce per affrontarlo, ma deve tornare alla Base Bianca entro quattro minuti, altrimenti il Gundam fonderà per l'attrito con l'atmosfera!

La nave di Scia prende terra all'interno della corazzata Gaw, l'ammiraglia di Garma, figlio di Degwin Zabi ed ex-compagno d'accademia militare di Scia. Garma manda all'attacco della Base Bianca una formazione di Dop e quando Peter Rei e Hayato escono col Guntank per contrapporsi agli avversari, invia anche dei Magella Attack.

Per la Base Bianca le milizie di Jion non sono l'unico problema: il migliaio di civili di Side 7 che la nave ospita vuole scendere a terra e prende in ostaggio Mirka e Kikka per cercare di convincere Bright.

Jion si prepara a sferrare l'attacco alla Base Bianca nei cieli sopra il lago Mid. Bright chiede a Garma di accettare una tregua mentre i civili vengono condotti a terra e l'ufficiale di Jion, più con l'intenzione di prender tempo per completare il carico di armi terra-terra che non per pietà verso i profughi di Side 7, dà il suo consenso.

Ormai armi e vettovaglie cominciano a mancare sulla Base Bianca, e l'insoddisfazione tra civili ed equipaggio si fa ogni giorno più forte: lo stesso Peter Rei ha ormai perso ogni voglia di combattere, ma quando Bright lo sprona con forza a contrapporsi di nuovo a Scia, ritrova nuova energia e sale sul Gundam per aiutare Ryu e Hayato.

Al quartier generale nordamericano di Jion si sta tenendo un ricevimento a cui partecipano anche Scia e Garma. Quest'ultimo ben presto si apparta con la sua amata Esterina e i due si scambiano promesse d'amore: se il padre della ragazza non acconsentirà al loro matrimonio, Garma si dichiarerà pronto a spogliarsi della divisa di Jion!

Decisa a vendicare l'amato Garma, Esterina progetta con l'aiuto di un ufficiale, Darota, di attaccare la Base Bianca con tre Gaw.

Dopo la defenestrazione di Scia, il maggiore Ramba Ral è diventato il nuovo responsabile delle operazioni di Jion sulla Terra. Durante la sua prima operazione svolta a bordo della nuova corazzata Zanzibar, si imbatte nella Base Bianca.

La Base Bianca è arrivata in Giappone e Peter Rei e compagni hanno finalmente l'occasione per rincontrare i loro cari. Peter Rei scopre che sua madre lavora in un campo di sfollati controllato da Jion, cosicché è costretto a nascondersi sotto le coperte di un letto dell'infermeria.

I responsabili di una base avanzata di Jion, comandati da Kuwaran, cercano di abbattere il Gundam indipendentemente da Ramba Ral: lo aggrediscono con dei wappa, piccoli mezzi monoposto, dai quali attaccano delle bombe a tempo sulla corazza del Gundam.

Ricevuta una comunicazione di SOS, Peter si reca verso un'isola sperduta, dove trova un pilota spogliato delle armi e legato al suo mezzo.

La Base Bianca vola sul deserto del Gobi alla ricerca del lago salato di Kan, per fare rifornimento di sale.

Peter Rei studia i dati dello Zac catturato per simulare degli scontri con Gundam. Intanto il soldato di Jion catturato sul deserto del Gobi riesce a fuggire dalla cella e a comunicare con Ramba Ral.

Mirka sta percorrendo il deserto alla ricerca di Peter Rei. Quando lo trova, questi le comunica la sua intenzione di non voler tornare per nulla al mondo a bordo della Base Bianca.

Peter Rei arriva in una taverna per sfamarsi e qui trova le truppe di Ramba Ral assieme all'affascinante Hamon Ral. All'improvviso irrompono nel locale dei soldati di Jion che conducono Mirka, catturata mentre vagava nel deserto alla ricerca di Peter Rei.

Problemi sia alla Base Bianca che nelle file di Jion: il caso della fuga di Peter Rei sta creando scompiglio tra i piloti da una parte e Bright dall'altra. Nel contempo Makube, intenzionato a liberarsi di Ramba Ral, rifiuta di garantirgli i rifornimenti richiesti.

Makube invia solo scarsissimi rifornimenti a Hamon Ral, che però decide di continuare a combattere in nome del marito morto. Intanto Peter Rei è stato rinchiuso di nuovo nella cella di sicurezza e Ryu cerca di consolarlo, ma mentre gli parla crolla al suolo.

Tanto Makube quanto la Base Bianca stanno passando un momento di gravissimo pericolo: dopo aver visto distruggere molte delle sue basi segrete, l'ufficiale di Jion decide di andare al contrattacco con tutti i mezzi. La Base Bianca, da parte sua, soffre della mancanza di Bright, febbricitante per il troppo stress accumulato.

La Base Bianca è riuscita a rifugiarsi sul fondo di una vallata dove procedono febbrilmente i lavori di riparazione. Lebil ordina a Macirda di portare alla nave i rifornimenti necessari ma, tradita da una spia, viene assalita in volo dalle truppe di Makube.

Kirisha Zabi invia in aiuto a Makube il terribile terzetto della Costellazione Nera , composto da tre velocissimi Dom forniti di hovercraft e pilotati da Gaia, Mash e Ortega.

Guidata da Lebil, è iniziata l'operazione Odissea, che consiste nella distruzione di tutte le basi euroasiatiche di Makube. Intanto Peter Rei, mentre aiuta Seira nelle esercitazioni al G-Sky, vede un mezzo federale uscire da una base di Jion, e, supposto si tratti di una spia, lo segue sino alla nave federale Big Tray.

L'esercito di Jion sta ormai lasciando l'Europa e la Base Bianca si rifugia a Belfast per le riparazioni. Ma una giovane spia, Mihal Latokie, avverte il sommergibile Mad Angler dell'avvicinamento della corazzata federale.

Kai, dichiaratosi stanco della vita militare, decide di abbandonare la Base Bianca, diretta a Jabrow, per restare a Belfast e inutili sono i tentativi di Peter Rei di dissuaderlo da un simile gesto.

Kai scopre Mihal mentre fruga nei cassetti di Bright e la nasconde nella propria cabina. Intanto la Base Bianca accoglie il piccolo aereo di un gruppo del sindacato dei pescatori che dice di essere stato assalito da truppe di Jion.

La Base Bianca è arrivata a Jabrow per le riparazioni e viene accolta da Woody, il fidanzato di Macirda. Anche Scia è però riuscito ad arrivare sino a Jabrow e si prepara ad attaccare la base dal mare con una pattuglia di Z-Gock.

Char infiltrates Jaburo with a squadron of Acguy mobile suits and plant time bombs on the Federation's new mass-produced GMs, but not before being discovered by Katz, Kikka, and Letz.

La Base Bianca è in volo nello spazio, diretta verso Salomone, ma Scia la insegue senza tregua dal suo Zanzibar e invia una flotta di Bigro per abbatterla.

Senza il permesso di Scia, all'improvviso parte all'attacco della Base Bianca il mobile armor Zaclero, un modello sperimentale il cui progetto di sviluppo è stato abbandonato. Ad affrontarlo esce Hayato con il Guntank, ma se la vede brutta a cercare di star dietro ai movimenti velocissimi del mobile armor.

In need of repairs, the White Base is attacked outside the neutral Side Six by a fleet led by Captain Coskon.

Deciso a rincontrare il padre, Peter Rei torna in città ma all'improvviso, per un forte acquazzone, il ragazzo è costretto a ripararsi nella casa di una giovane chiamata Lara Sun.

La Base Bianca, lasciato Side 6, si unisce alla Terza Flotta e qui Bright viene a sapere dal comandante della flotta Wackein che l'obiettivo dell'esercito è la Base Salomone, fulcro delle attività militari di Jion.

Durante la sua breve permanenza alla Base Bianca, Sleggar finisce per innamorarsi, ricambiato, di Flammet. Prima di partire per la prima linea il ragazzo le lascia un prezioso anello, unico ricordo della madre.

Scia si reca nell'area detta Texas per prendere il comando di un nuovo mobile suit chiamato Ghial, con il quale intende sfidare Peter Rei.

Deciso a ottenere la prova del fatto che Peter Rei sia o meno un newtype, Scia lo attacca nuovamente, stavolta a bordo del Ghial, ma il pilota di Gundam dimostra di saper leggere in anticipo i movimenti dell'avversario e riesce a ridurlo quasi all'impotenza quando anche Gundam si ritrova immobilizzato per avere utilizzato troppa energia.

Gihren Zabi sends Char a Newtype to pilot the new Braw Bro; Amuro's own Newtype abilities are growing as he senses the presence of Lalah.

The Gundam is upgraded and Lalah's Elmeth enters combat for the first time; Amuro and Lalah cross paths again but this time as enemies.

Degin Zabi si trova su A Baoa Qu per firmare un trattato d'armistizio con l'esercito federale, ma le truppe di Jion non sembrano molto intenzionate a rinunciare all'uso delle armi: Gihren sta ultimando la preparazione del Solar Ray.

Sul luogo in cui Degin Zabi e Lebil si sono incontrati per firmare l'accordo di cessate il fuoco si è abbattuto il raggio distruttivo del Solar Ray! Mentre le truppe federali cercano di riorganizzarsi, Kirischa, infuriata contro il fratello Gihren che ha ucciso senza pietà il loro genitore, gli punta contro la pistola freddandolo.

Finito in parità lo scontro tra Gundam e Jiong, Peter Rei e Scia abbandonano i loro mobile suit per lottare a mani nude.