Jack incontra Ariana Kane, un'agente dell'Alleanza mandata per investigare sulle circostanze che hanno condotto alla scomparsa di Emily Sloane. Marshall deve affrontare la sua prima missione insieme a Sydney. Will si sottopone ad un test psicologico della CIA, mentre Francie diviene sospettosa.

Dopo aver completato la sua prima missione la vita di Marshall è in serio pericolo. Il primo sospetto in merito alla scomparsa di Emily Sloane è Jack Bristow. Vaughn scopre la verità in merito al coinvolgimento di Jack nell'omicidio dell'agente della CIA Haladki. Sydney confida a Francie i suoi sentimenti per Michael.

Ariana Kane decide di servirsi di Sydney per rintracciare Jack che è fuggito, mentre questi chiede aiuto ad Irina per scoprire chi sta ricattando Sloane. Sydney e Vaughn rischiano di mettere in serio pericolo le loro posizioni quando decidono di cenare insieme, in missione, in un romantico ristorante di Parigi.