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Malcolm è considerato un genio e trasferito in una classe per cervelloni.

L'abito dell'anniversario di Lois viene distrutto e lei sospetta dei figli.

Francis torna da scuola per badare ai fratelli mentre Hal e Lois sono via.

Malcolm affronta l'inimicizia di un nuovo bullo, Kevin.

La famiglia vive in roulotte mentre la casa viene disinfestata.

Malcolm passa la notte a casa di Stevie.

Francis scappa dall'accademia militare per incontrare la fidanzata.

La famiglia deve andare al picnic dei Cervelloni per gli studenti dotati.

Dewey ruba una bottiglia di cognac da 150 dollari e fa licenziare Lois.

Hal si prende un giorno libero e porta i ragazzi a una gara di stock car.

Zia Helen muore e la famiglia si prepara per il funerale.

Reese si unisce alla squadra di cheerleader per fare colpo su una ragazza.

Hal insegna a Malcolm a usare i pattini a rotelle e Malcolm impreca.

Lois visita Francis all'accademia militare dopo un'emergenza medica.

Lois ha l'influenza e non si accorge di aver passato due giorni a letto.

Tutta la famiglia va al parco acquatico, ma Dewey deve restare a casa.

La famiglia torna dal parco acquatico e resta bloccata in un ingorgo.

Francis fa tardi per Halloween e i ragazzi creano lo scherzo definitivo.

I figli distruggono il sogno di Lois di un compleanno felice e lei scappa.

Francis invita un gruppo di ragazze all'accademia e loro la distruggono.

Malcolm e famiglia vanno in vacanza in un casinò in una riserva indiana.

Hal e Lois vanno a una convention, i ragazzi restano con la babysitter.

Craig e Lois sono tenuti in ostaggio da due rapinatori da Lucky Aide.

Per evitare la scuola, Malcolm inganna lo psicologo della scuola.

Malcolm viene scritturato in una recita al liceo e fa amicizia coi liceali.

Una ragazza batte Reese nella lotta e lui rinuncia al titolo di bullo.

Malcolm deve badare a un'anziana signora dopo averle rotto il braccio.

La nuova ragazza della classe dei Cervelloni ha una cotta per Malcolm.

Arrivano i nuovi vicini di casa e le due famiglie si odiano reciprocamente.

Dopo il Giorno della Carriera alla scuola di Dewey, Hal diventa pittore.

Arrivano i genitori di Lois. Francis ha un'intossicazione al Mardi Gras.

Lois viene arrestata per via delle multe non pagate di Francis.

Malcolm operato di appendicite. Francis fa lo sciopero della fame.

Reese va a una lezione di cucina e scopre di avere talento.

Malcolm fa segretamente il compito di Reese e prende un brutto voto.

Cosa accadrebbe se ciascun genitore portasse i figli a giocare a bowling.

Francis fa competere Reese e Malcolm per i biglietti del wrestling.

Craig fa impazzire la famiglia mentre vive con loro.

Reese, Malcolm e Stevie si intrufolano nella fiera in città.

Un treno che trasporta rifiuti tossici deraglia, la città viene evacuata.

Lois potrebbe essere incinta e ricorda la nascita degli altri figli.

La famiglia va in vacanza su una casa galleggiante con i Kenarban.

Stufo della scuola militare, Francis si emancipa legalmente.

Lois si iscrive a un club del libro femminile, solo per poter socializzare.

Dopo essersi fidanzato, Malcolm ignora la famiglia e gli amici.

Lois costringe i ragazzi a fare volontariato per rinforzare il carattere.

Hal potrebbe avere una grave malattia e Lois diventa più cattiva.

Lois dà un ultimatum ai ragazzi, che rovinano il Natale ogni anno.

Abe invita finalmente Hal a giocare a poker, ma Hal si sente escluso.

Reese lavora in fast food, ma viene accusato di rubare soldi.

Lois riceve una pessima recensione da parte di un secret shopper.

Hal evita il nuovo capo al picnic aziendale con Malcolm e la famiglia.

Reese e la sua compagna nella caccia al tesoro creano problemi.

Reese si lancia in un inseguimento a tutta birra durante la scuola guida.

Cynthia torna dall'Europa e Malcolm nota il suo fisico più adulto.

Francis torna a sorpresa per il compleanno di Hal con una moglie, Piama.

Hal allena la squadra di calcio di Dewey e li trasforma in mostri.

Dewey trova un cane e lo usa per ricattare Malcolm e Reese.

Hal, Abe e i compagni di poker competono per delle stupidaggini.

Pensando che abbiano rovinato l'auto, Hal manda i ragazzi dallo psichiatra.

Lois fa da giurato e Hal cerca di capire di quale caso si tratti.

Dopo un incidente, i Cervelloni devono unirsi al resto della scuola.

Reese pensa di aver un futuro come poliziotto dopo aver steso un ladro.

In this Biography special we see the cast and crew of the hit television series "Malcolm in the Middle" get together in order to discuss the show and how it came to be.

Malcolm è depresso e la famiglia va allo zoo.

Malcolm arriva finalmente al liceo ma grazie a Lois, che gli rovina dal primo giorno la reputazione, tutti gli danno il soprannome di Macchia così è costretto a tornare con i suoi amici "secchioni" delle medie.

Malcolm e la sua famiglia vanno a trovare il suo ricco nonno, il padre di Hal, trovando anche il resto dei parenti. Reese e Dewey fanno a gara con il resto dei figli dei parenti per accaparrarsi la ricca eredità conquistando la simpatia del nonno. I parenti però cominciano a manifestare la loro antipatia per Lois, al punto da escluderla dalla foto di famiglia. Ogni volta però che Hal tenta di parlare di questo con suo padre, egli evita sempre di affrontare i problemi con facce buffe e solletico, così come si scopre ha fatto con Hal fin da quando era bambino.

A Malcolm piace Alyson la sua vicina di armadietto, ma alla ragazza lui non piace perché è troppo intelligente. Così Malcolm segue i consigli di Reese e diventa un idiota. Intanto Francis litiga con un truffatore per salvare il ranch di Otto.

Malcolm e Reese si fanno i dispetti l'uno con l'altro. Intanto Francis deve affrontare una mucca di una leggenda.

Malcolm esce furtivamente con una ragazza il cui padre lo detesta.

Malcolm, scopertosi un buon giocatore di pallacanestro, viene cacciato dopo aver detto all'allenatore che i suoi schemi sono troppo prevedibili. Decide, quindi, di provare a smettere di parlare senza riflettere. I risultati sono sorprendenti: le cose con Nicki vanno meglio, sua madre lo punisce meno e gli assegna meno lavori di casa, suo padre inizia a dargli una paghetta settimanale e riottiene il posto in squadra. Alla fine, però, tutto lo stress accumulato gli fa venire un'ulcera, ragion per cui torna a comportarsi come al solito. Nel frattempo Hal si scopre molto portato nella marcia, tanto da ricevere i complimenti dei dilettanti che girano per il quartiere, ma il campione della città lo supera facilmente. Decide quindi di allenarsi con impegno per batterlo ma, a dispetto di tutto, fallisce. Alla fine, però, si rende conto che il suo avversario bara e, dopo averlo rivelato a tutti, si prende la sua rivincita.

Hal e i ragazzi vanno a trovare Francis al ranch.

La madre di Lois scivola e decide di fare causa a Hal e Lois.

Lois immagina come sarebbe la sua vita se avesse avuto delle figlie.

Lois dà lezione di educazione sessuale a Malcolm durante un lungo viaggio.

Hal caccia da casa Malcolm perché si comporta male.

Hal ottiene un secondo lavoro da "U-Buy It".

Hal incontra Larry, un vecchio amico del liceo che non è cambiato.

Lois incarica Reese di occuparsi del mercatino di famiglia.

Il sig. Herkabe costringe Malcolm a partecipare all'Octathlon accademico.

Hal e Lois ripensano a ciò che i ragazzi hanno fatto passare loro.

Reese da una festa mentre Lois e Hal sono via per il fine settimana.

Malcolm conosce un uomo di mezza età depresso con cui ha molto in comune.

Lois va in travaglio, Hal e i ragazzi sono a una fiera di abiti da sposa.

Un ansioso Hal si schianta in auto cercando di tornare a casa da Lois.

L'asilo nido di una chiesa accetta il bambino di Lois a caro prezzo.

Hal sogna di vincere alla slot-machine, così riscatta l'assicurazione sulla vita all'insaputa della moglie e convince la famiglia ad andare a Las Vegas. Dewey sta accudendo un coniglio, Gordo, ma Reese lo nutre con cibi grassi facendogli raggiungere 40 kg di peso. A Las Vegas Dewey partecipa a una mostra per conigli, dove viene squalificato. Reese per sbaglio vende Gordo a un ristorante e i due fratelli devono fare di tutto per recuperare l'animale.

Malcolm dice a Lois che si vergogna della sua famiglia, così per riparare compra due biglietti per il concerto di Vincent Van Boone, idolo delle donne over 40. Hal prova a giocare a tutto i casinò della città, e ci riesce solo all'ultimo: tuttavia il premio è un biglietto per due notti in un motel. Nel frattempo, Francis svolge male alcuni suoi lavori al ranch e finisce in un pozzo che non aveva segnalato assieme a Otto. Verranno salvati dalle mogli.

Mentre Lois dorme profondamente, sfinita per le notti insonni, gli uomini di casa devono badare a Jamie. Mentre Hal va a comprare i pannolini, Reese, Malcolm e Stevie ricevono la visita di tre ragazze bellissime che, per fare ingelosire i ragazzi che le hanno scaricate, si sono dirette dai ragazzi più disgustosi della città: questo accade mentre Dewey è uscito a buttare un puzzolentissimo pannolino. Hal va al Lucky Aide, ma siccome non ha soldi e ha trattato male Craig, quest'ultimo lo obbliga a lavorare per pagare i pannolini. Hal organizzerà una rivolta interna al supermercato. Dewey si trova pertanto solo con Jamie e per farlo calmare gli racconta una favola in cui i loro genitori hanno un appartamento segreto dove conducono una vita da nababbi. Riesce a farlo addormentare. Dopo un giro in limousine, proprio prima di poter baciare una delle ragazze, Reese trova nella propria tasca il ciuccio di Jamie e si ricorda di avere questa responsabilità: i tre ragazzi torneranno a casa.

Malcolm deve giocare nella squadra di basket per disabili di Stevie, ma per sbaglio si alza in piedi dalla carrozzina facendosi notare dagli altri ragazzi disabili. Kitty Kenarban ha divorziato dal marito da due mesi, ma quest'ultimo, iperprotettivo nei confronti del figlio, non riesce a dirglielo: quando Stevie lo scopre, entra in depressione. Per spronare l'amico, Malcolm lo prende a pallonate e la scuola pensa che lo stia bullizzando (Stevie non reagisce perché depresso): per questo viene picchiato e costretto veramente alla carrozzina. Quando parteciperà alla partita, gli altri ragazzi disabili, credendolo perfettamente sano, lo bullizzeranno a loro volta. Abe finalmente riuscirà a rimuovere il blocco che aveva parlando per la prima volta in modo onesto al figlio, che si riscuoterà.

Per la cena del Ringraziamento, Reese vuole che tutto sia perfetto arrivando a maltrattare Hal e Dewey. Effettivamente, a cena, gli ottimi cibi cancelleranno dalle teste della famiglia tutti i motivi di litigio. Francis e Piama sono a casa per il festeggiamento, ma c'è aria di crisi nel loro matrimonio. Lois cercherà di aiutarli, ma Hal pensa che sia tutto un machiavellico piano della moglie per farli separare. Malcolm invece partecipa a una festa dove flirta, e poi bacia Kirsten. I due ragazzi si ubriacheranno e lei vorrebbe copulare, ma Malcolm torna a casa: qui si presenterà alla famiglia ubriaco e vomiterà nel tacchino. Francis si complimeterà con lui per non aver approfittato di una ragazza ubriaca.

Il professor Herkabe convince Malcolm a riprendere segretamente Reese, mettendolo poi in ridicolo davanti alla scuola (si scopre che Reese in realtà è estremamente sensibile). Malcolm rimedierà frugando nelle schede disciplinari di tutti gli studenti e comunicando a tutti i segreti racchiusi in esse. Dewey marina la scuola per andare in strada a fare degli incredibili giochi di prestigio e guadagnando così centinaia di dollari che nasconderà in un vaso in casa. Al lavoro Hal pensa che l'azienda stia per compiere una fusione, e che le azioni che aveva comprato varranno presto un sacco di soldi, così ordina una nuova lavatrice. Ma si scopre presto che in realtà tutti i dirigenti sono stati arrestati. La coppia è disperata, ma Lois per sbaglio rompe il vaso dove Dewey aveva nascosto i suoi soldi, e riescono a comprare una nuova lavatrice. Nel frattempo al Grotto hanno problemi con un critico che giudica in modo pesantemente negativo l'albergo.

Lois fa assumere Malcolm al Lucky Aide, e qui il ragazzo scopre un lato nascosto della madre (che qui viene chiamata Baldoria): è estremamente rispettosa delle decisioni dei superiori, non si ribella mai arrivando anche a fare segnalazioni sul figlio, cosa che gli farà ridurre la paga oraria. Malcolm scopre anche che la madre fuma (due sigarette al giorno), ma lois gli chiede di non dirlo al marito, che tornerebbe invece a fumare pesantemente. Reese trova invece lavoro in un mattatoio, dove guadagna un sacco di denaro. Hal partecipa a un corso papà-figli della stralunatissima baby-sitter Polly: qui finisce col fare scommesse con gli altri padri che coinvolgono i figli neonati: chi ha il pannolino più pesante, chi riesce a stare seduto per più tempo, fino a una specie di curling con bebè. Dewey è scocciato di essere vessato da Malcolm e Reese e di essere ignorato dai genitori, così parte da solo per il Grotto in cerca di attenzioni da parte di Francis.

L'azienda dove lavora Hal lo manda in vacanza non pagata: per rimediare alla carenza di soldi, lui si mette in società coi tre figli per vendere alberi di Natale: partiti in quarta convinti di guadagnare tantissimo, incontreranno un sacco di problemi che li uniranno come famiglia ma faranno guadagnare spiccioli. Al Lucky Aide uno scoiattolo morde Craig e i dipendenti si mobilitano per catturare l'animale. Nel frattempo, al Grotto, Francis e Piama scoprono che anche la famiglia di Otto, venuta al ranch per Natale, è molto litigiosa.

La famiglia torna dalla vacanza prima del previsto, e scopre che nel quartiere organizzano ogni anno una festa di strada per la loro partenza: a quanto pare tutti li odiano. Reese, aiutato da Dewey, convince dei bambini a farsi picchiare in cambio di denaro, ma il progetto andrà a monte. Malcolm aiuterà un uomo a traslocare, ma scoprirà presto che era in realtà un ladro: si dispera, e all'arrivo di un poliziotto descrive minuziosamente tutta la refurtiva che però era materiale per falsificare certificati azionari, facendo così arrestare i veri inquilini della casa. Lois e Hal partecipano a una gara di mangiatori di kielbasa, vincendo a pari merito sotto gli applausi scroscianti del quartiere. Nel frattempo, Francis deve raccogliere il seme di un toro con un'improbabile struttura metallica simile a una vacca che la bestia avrebbe dovuto montare.

Malcolm scrive sul giornalino scolastico, la Nave di Cristallo, e una ragazza gli chiede di pubblicare un racconto pieno di volgarità. Il preside vieta di pubblicare il racconto senza censure: Malcolm chiede informazione all'Unione per i Diritti Civili, ma questi travisano facendo causa alla scuola. Il preside impone un aut aut a Malcolm: o rifiuta di pubblicare quel racconto o ogni attività scolastica sarà soppressa per pagare la causa. Malcolm accetterà, ma fonderà una nuova rivista indipendente dove pubblicherà il racconto senza censure. Lois obbligherà Hal a flirtare con il nuovo capo, un'attraente donna, per tenersi il posto di lavoro. Nel frattempo Francis insegna a Otto a ballare il valzer per festeggiare con Gretchen l'anniversario di matrimonio.

Hal compra un idromassaggio convincendo la famiglia, esclusa Lois, a usarlo. Tuttavia lois stessa vorrà provarlo all'insaputa degli altri. Alla fine l'acqua dell'idromassaggio diventerà un pantano. Malcolm prende il foglio rosa: per provare a guidare accompagna Polly "per fare un salto al Lucky Aide": in realtà la donna doveva recuperare un'urna contenente le ceneri di sua madre dalla casa del suo ex ragazzo Danny. Dopo poco si scoprirà che l'urna contiene anche le ceneri del padre di Danny, più quelle del loro cane e del loro gatto. Malcolm le butterà fuori dal finestrino dell'auto. Dewey fa amicizia con Noah, ma il bambino in realtà voleva solo conoscere Reese per farsi poi difendere da lui.

Malcolm si fa il piercing alla lingua e fa di tutto per non pronunciare la "S", che lo metterebbe nei guai con i genitori. Ida si presenta in casa dicendo che si sta per risposare con un certo Mister Li, un cinese raffinato, gentile ed educato: la famiglia si chiederà come abbia fatto a innamorarsi della nonna. Al matrimonio Malcolm scoprirà che il trucco stava nelle enormi quantità di oppiacei che lei versava nel tè del fidanzato, che si riprende sul più bello e si allontana dall'altare. Mentre tutta la famiglia è drogata da Ida, Malcolm confesserà la presenza del piercing e verrà punito, ma non sgridato. Dewey non sopporta più Reese, e per ripicca finge di non vederlo. Nel frattempo, al Grotto, viene assunta una scalcagnata compagnia teatrale che mette in scena una ridicola cena con delitto, ma dando fastidio agli ospiti che se ne vanno in massa. otto non riesce a cacciarli perché vuole dare una possibilità a chiunque, così paga dei finti clienti per applaudire la compagnia.

Malcolm finisce nella squadra di softball del Lucky Aide, allenata da Lois, che non fa altro che dargli consigli soffocandolo: il ragazzo, d'altro canto, non è un bravo giocatore. Hal cerca un lavoro in vista del possibile fallimento della sua azienda, ma il colloquio è ai limiti dell'assurdo e probabilmente si trattava di un'agenzia governativa segreta. Francis è a casa per litigare con Lois sul fatto che lui non sia un ragazzo pigro. Dewey convince Reese a tentare di battere un record di Francis: il numero di tavolette da water rubate dalla discarica. La discarica però è sorvegliata da cani ferocissimi. Reese tenta il colpo e batte il record di Francis, il quale, per mantenere il record, cerca a sua volta di battere quello del fratello.

Susan, la sorella minore di Lois ed ex ragazza di Hal, viene in visita alla famiglia: qui regala a Jamie un buono del tesoro da 5000 dollari, a Dewey una macchina per lo zucchero filato e a Malcolm e Reese la sua Mustang. Lois e Hal sono imbarazzatissimi, ma Susan fa tutto questo solo per risultare migliore di Lois, con la quale è in lotta da quando le ha rubato Hal. Lois scopre però che Susan ha una disfunzione renale e decide di donarle un rene. I due genitori vietano ai ragazzi di guidare la Mustang togliendole il motore, ma Reese ha un'idea per andare a una festa al lago: fa spingere l'auto fino a una discesa e da lì arrivano alla festa in grande spolvero. Tuttavia, all'arrivo della polizia non possono spostare l'auto mettendo nei guai tutti gli altri e diventando per l'ennesima volta gli zimbelli della città. Nel frattempo, al Grotto, Francis deve badare a un gruppo di agguerrite scout.

Malcolm conosce una ragazza, Angela, e per poter uscire con lei è costretto a conoscere la sua numerosa famiglia, con la quale fa subito amicizia arrivando a frequentare sempre meno la propria. Lois inizia una battaglia contro la pizzeria "Da Luigi", che faceva pagare inconsapevolmente una mancia inclusa nel conto. Hal, Reese e Dewey sono abbattuti, perché la pizza di Luigi è ottima ed era un momento di pace familiare. Dopo varie discussioni, Lois segnala la pizzeria a "mi manda Clyde". Nel frattempo, al Grotto, Francis ha un nuovo assistente di cui si approfitterà finendo col dimenticare come fare semplici gesti quotidiani. Pertanto l'assistente verrà licenziato.

Malcolm deve aiutare un ragazzo stupido, ma ottimo giocatore di football, a scrivere un saggio d'ammissione per il college. In un primo momento glielo scriverà direttamente lui, ma poi si pentirà. Il ragazzo sarà costretto a scriverne uno di suo pugno, che risulterà un testo indecente, ma vista la sua bravura a football lo accetteranno comunque. Reese ne combina una delle sue, talmente grossa che non viene neanche nominata: per questo verrà cacciato di casa. Troverà un ottimo appartamento, si responsabilizzerà e migliorerà i suoi voti. Hal e Lois si faranno un esame di coscienza e praticheranno l'ascolto attivo su Malcolm, ma malamente, e l'esperimento fallirà. Alla fine Reese tornerà a casa perché ha speso più di diecimila dollari tramite carte di credito.

Malcolm deve andare in visita a un college, ma Lois pretenderà di essere presente durante la visita (che prevede anche una notte lì). Qui si scontreranno con l'RP (responsabile di piano), Lois prima capirà di aver esagerato con il controllo sul figlio ma quando i fatti capitoleranno si ricrederà. Dewey si scopre un talento per la musica e chiede al padre un pianoforte, che gli nega. Così il bambino ruba da casa oggetti di varia natura per costruire una specie di organo a canne e dimostrare al padre di saper veramente suonare. Reese conosce una ragazza che sembra essere un'ex tossicodipendente, e si finge lui stesso tale: ma dopo un esame di coscienza decide di non vederla più. Lei crede che Reese spacci droga, ed essendo un'agente della narcotici in incognito, va a casa sua e arresta Hal. Nel frattempo, al Grotto, Francis e Otto istituiscono un asilo per bambini per permettere ai genitori un po' di privacy: il progetto andrà a monte quando Otto servirà ai bambini del limoncello.

Craig e Abe conoscono Polly: mentre Hal fa da cupido per Abe, Lois fa lo stesso con Craig. Polly esce comunque con entrambi perché non sa decidersi, ma a una fiera sportiva i tre si incontrano e i due uomini "lottano" tra di loro. Mentre Polly, Hal e Lois assistono alla scena, Jamie si allontana percorrendo la fiera gattonando passando addirittura in una tubatura d'aerazione. Dewey ha una felpa che ritiene fortunata, e incontra lo scetticismo di Malcolm sull'esistenza della fortuna. Alla fiera sportiva, Dewey scommette con Malcolm di poter vincere una palla firmata da Reggie Jackson: Malcolm va in crisi, toglie la felpa al fratello e mentre lottano assieme a Reese per la felpa, essa fa fortuitamente da materassino per Jamie, caduto dal tubo d'aerazione. Alla fine, Polly, tra Craig e Abe sceglierà il suo lavoro di baby sitter. I due uomini diventano ottimi amici. Nel frattempo, al Grotto, Francis deve combattere contro Piama che lo coccola davanti ai lavoranti, fissati con il machismo.

Dewey deve essere sottoposto ad un test di intelligenza perché considerato potenzialmente geniale dalla consulente scolastica. Malcolm però vuole evitare che venga considerato un emarginato, quindi convince Dewey a rispondere alle domande del test come farebbe Reese: Dewey però viene giudicato emotivamente disturbato e viene inserito in una classe speciale per psicolabili. Malcolm tenta di risolvere la situazione all'insaputa di Lois. Dewey finirà col fare una piccola rivoluzione interna. Hal intanto partecipa insieme a Craig a una gara di ballo alla sala giochi. Reese intanto vuole dimostrare a sé stesso e alla famiglia di essere un genio in qualcosa, rimediando soltanto ferite e contusioni.

Malcolm e Stevie hanno intenzione di partecipare a un concorso scientifico creando un nuovo tipo di enzima. Reese si offre di collaborare all'esperimento ma viene sottovalutato da Malcolm. Casualmente si rende essenziale alla riuscita dell'esperimento, ma si scoprirà che tutto era causato alla presenza di asbesto (amianto) nel soffitto. Dewey viene obbligato dai genitori a vendere tavolette di cioccolata porta a porta per la scuola: ci riuscirà ma truffando tutti. Nel frattempo, al Grotto, Francis vuole salvare Ralph, un maialino che deve essere abbattuto.

Lois viene contattata da Roberta, figlia di Victor in un altro matrimonio: va a trovarla in Canada assieme a Malcolm, Reese e Jamie. Qui scopre che Victor ha sempre dedicato più attenzioni e denaro a questa famiglia che alla loro, e la differenza tra le due famiglie è la madre: la cattiva, cinica e invadente Ida da una parte e la gentile, amorevole e accogliente Silvia dall'altra. Malcolm si trova benissimo a parlare con Jerome, figlio di Roberta, un altro genio a cui si trova affine ma molto più popolare e amato. Invece Reese, andando a caccia, sconvolge l'altro figlio di Roberta. Lois, tramite un test del DNA scopre che Victor non è il suo padre genetico, ma lo accetta comunque. La famiglia torna infine a casa. Hal e Dewey intanto dovrebbero partecipare a una gara di corsa padre-figlio, ma Hal, per un incidente, partecipa bendato.

L'azienda di Hal è indagata per truffe e reati pecuniari: Hal stesso viene contattato dai federali per testimoniare contro un collega che avrebbe truffato l'azienda, ma l'uomo non vuole dire falsità. Per questo il collega stesso lo accuserà, e Hal sarà costretto ai domiciliari con un collare elettronico alla caviglia. Un informatore gli chiede di vedersi in biblioteca per passargli informazioni, così Malcolm costruisce un dispositivo che disturba il segnale del collare, che Hal si porta in uno zainetto. L'uomo deve però lasciare il tutto fuori dalla biblioteca e all'uscita è costretto a fingersi artificiere per non dover dare spiegazioni a un agente. Reese dichiara il suo amore verso la sua nuova ragazza, Beth, che però vuole lasciarlo per Malcolm. Reese, deluso, si arruola nell'esercito fingendo di essere maggiorenne. Diventerà un soldato perfetto.

Hal riesce a scappare con il suo zainetto eludendo tutti i poliziotti accorsi in suo aiuto. Il processo inizia, ma anche il suo Uomo Misterioso lo accusa di truffa ai danni dell'azienda. Viene fornito un elenco di date di molti anni addietro in cui Hal avrebbe compiuto determinate azioni illegali. Lois impazzisce del tutto e inizia a fare centinaia di maialini con le confezioni di detersivi. A Malcolm viene in mente una cosa: ogni data fornita al processo era un venerdì, e Hal, a quanto pare, non è mai andato al lavoro di venerdì, e biglietti, foto e documenti attestano la sua partecipazione a parchi acquatici, balletti e gare di kart. L'uomo è assolto, Lois rinsavisce, ma ora entrambi i genitori sono disoccupati. Reese è ancora nell'esercito: è diventato un perfetto soldato non pensante e conduce con successo un'esercitazione militare. Per questo viene "premiato" e mandato in Afghanistan.

Reese è ancora nell'esercito, e Lois vuole andare a recuperarlo: la donna riuscirà a persuadere il sergente istruttore del figlio e a scoprire dove è stato spedito. Venderà l'auto di famiglia per acquistare un biglietto aereo per Kabul. Reese, tuttavia, appena toccato terra, si spaventa e scappa: tra un'avventura e l'altra (tra le altre cose si finge donna), finisce in India. Incredibilmente la madre gli si presenta davanti per riportarlo a casa. Malcolm, di contro, si sente responsabile per averlo fatto scappare e inizia un periodo di volontariato all'ospedale: anche quest'esperienza finirà male. Reese tornerà a casa e, dopo un breve abbraccio con i fratelli, si unirà a loro per l'ennesimo scherzo.

Hal deve trovare lavoro: per passare il tempo porta Jamie al parco e qui conosce un gruppo di aitanti culturisti. Subito diventa il loro capo, perché risulta il più intelligente, e li sfrutta facendosi trascinare l'auto (che è un rottame). Dewey non è più obbligato a stare nella classe differenziale, ma i compagni di classe si sentono perduti senza di lui. I bambini scapperanno andando a vivere sugli alberi, dove Dewey stesso li aiuterà con cibo e vettovaglie. Per trovare i bambini scomparsi, Hal assolda il suo gruppo di culturisti che trovano casualmente i compagni di Dewey. Quest'ultimo capisce che senza di lui sono persi, e si finge impazzito per essere riammesso nella classe speciale. Hal riceve una telefonata d'assunzione da un'azienda, e deve salutare i suoi amici "gorilloni".

Hal costruisce una struttura-gioco gigante per gatti, Lois non vuole avere un gatto e Hal è costretto a buttarla. Ma il netturbino non prende la struttura perché troppo grande. Così inizia una battaglia in cui i due si scaricano rifiuti l'uno nel giardino dell'altro, battaglia che coinvolge anche Reese. Lois è stata riassunta al Lucky Aide in prova. Viene esposta una sagoma pubblicitaria raffigurante un inserviente nero con delle birre in mano, sagoma che Lois reputa terribilmente razzista, e ordina a Malcolm di rimuoverla ma il ragazzo rifiuta, per seguire gli ordini del capo. Alla fine Lois deciderà che tenere quella sagoma è giusto (proprio mentre Malcolm voleva invece rimuoverla), dopo uno scambio di battute con una collega, la quale riteneva giusta la rimozione perché attirava troppi neri al negozio. A questo punto Malcolm va in crisi: se rimuove la sagoma, sembrerà spirito di contraddizione; se la lascia lì darebbe ragione alla madre.

Hal è in una guerra personale con un vicino, e decide di costruire una rappresentazione della battaglia di Pearl Harbor. In questo si fa aiutare da Dewey, il quale deve comporre un tema su di lui, "il mio eroe". Ma Hal scoprirà che Dewey ha riempito di menzogne il tema, perché Hal in fondo è un inetto. Così i due non collaborano più al progetto. Jessica inizia a frequentare la casa, come al solito mette zizzania tra Malcolm e Reese, tanto da convincere lois a portare tutta la famiglia a vedere "Mamma mia": inoltre dice ai due fratelli, separatamente, che l'altro è gay. Quando i due lo scoprono, passano al contrattacco e tramite un trucchetto convincono la madre che Jessica abbia una storia con Malcolm. Finirà che lei ufficialmente sarà bandita dalla casa, ma Lois già sa che, facendo così, i suoi figli faranno entrare di nascosto la ragazza.

Al compleanno di Dewey sono invitati Abe e Stevie: si parla, tanto per cambiare, di Kitty e del fatto che a quanto pare si sia data alla pornografia. Inoltre, Stevie deve vincere un premio per la gentilezza, e tutti si complimentano con lui. Quando i due amici si allontanano, Lois vede Kitty che spia dalla finestra: la donna vuole tornare dalla sua famiglia, ma Lois decide di non appoggiarla, dopo i due anni di assenza. A sera tarda arriva Francis, che vuole iniziare Dewey alla "fratellanza", una scusa per sfruttarlo e prenderlo in giro. Il giorno dopo la festa, Abe arriva adirato a casa della famiglia: Kitty è tornata a casa e lui l'ha accolta, ma non ha gradito il fatto che Lois non abbia aiutato Kitty. Malcolm aiuta Stevie con il discorso di ringraziamento: registra la voce dell'amico e taglia le parti in cui si sente il suo asma, rendendo più fluido e veloce l'ascolto.

È Natale, ma la famiglia non ha abbastanza soldi per i regali, inoltre Lois rompe l'auto, pertanto si decide di realizzare dei doni fatti in casa, a costo zero. Ai festeggiamenti partecipano anche Francis e Piama. I ragazzi regalano ai genitori oggetti bellissimi, mentre Hal ha preparato solo dei "buoni per un abbraccio". Il padre di famiglia convince gli altri che il regalo sia chissà dove, e partono tutti senza alcuna meta. Si scopre che Malcolm ha una carta di credito segreta, con la quale ha acquistato i regali: Hal si finge sorpreso e tradito e la famiglia utilizzerà la carta di Malcolm per andare in montagna. Durante il viaggio in auto si scopre, inoltre, che Francis ha perso il lavoro al Grotto.

Hanson e Zoey, due compagni della classe speciale di Dewey, ricevono la proposta di candidarsi come capo del Consiglio Studentesco da parte di Kyle, un bambino "normale": Dewey intuisce immediatamente che Kyle vuole deridere gli altri due, e propone il suo nome a un professore: Kyle dunque concorrerà per non essere battuto da due della classe speciale. Alla fine Hanson verrà acclamato dalla folla di ragazzini semplicemente per l'uso di volgarità varie. Non si sa chi vincerà, alla fine. Malcolm compra una chitarra, ma compone una canzone che si rivela essere già stata scritta anni addietro. Restituirà lo strumento dopo aver capito di non aver alcun talento musicale. Hal diventa sonnambulo per lo stress di cosa regalare alla moglie: Reese sfrutta la condizione del padre per ottenere aiuti e regali. Alla fine sarà Lois a soggerire al marito i regali perfetti.

Jamie cresce, e diventa un bambino pestifero: scappa dalla madre, non mangia, arriva addirittura a buttare addosso a Lois una credenza. I ragazzi trovano un trampolino, e Reese impazzisce per trovare qualcosa di divertente ma stupido da fare con lui. Si scopre che lui si sente crescere, e potrebbe essere l'ultima occasione per fare qualche stupidata. I genitori chiamano Francis per trovare aiuto (è sempre stato considerato il loro figlio peggiore) e tramite i suoi ricordi d'infanzia scoprono che Lois lo ha traumatizzato bruciando il suo orsacchiotto per fargli capire che il fuoco può far male (e facendosi lei stessa male a una mano). Si scopre anche che, un tempo, era Lois il genitore debole, mentre Hal era l'"orco cattivo". Malcolm e Dewey aiutano Reese trovando un gioco stupido da fare col trampolino, ma appena quest'ultimo mette piede sul primo gradino, il trampolino gli crolla addosso.

Malcolm acquista un'auto, che in realtà è un rottame: per ogni nuovo pezzo che le monta ce n'è un altro che si rompe. Arriva quasi ad esserne ossessionato, così Reese e Stevie chiamano la "Automobilisti Anonimi". Finirà che Malcolm rimarrà rinchiuso in auto nel garage, e rischia di morire soffocato dai fumi di scarico, ma verrà salvato da Stevie. Hal, per caso, scopre di essere bravissimo a tagliare i capelli e svolge questa professione in casa, ma gratuitamente. Per caso, la moglie del capo di Lois viene a farsi tagliare i capelli e si scopre che ha una relazione con Craig. Quando l'uomo si dichiarerà a lei, si scoprirà che aveva anche una seconda relazione clandestina.

Hal sgrida i ragazzi perché passano il sabato pomeriggio in casa: a loro viene in mente di salire su un cartellone pubblicitario per imbrattarlo e scriverci "Io voglio Reese" (I want Reese). Quando la madre li scopre, loro corrono ai ripari: invece che scriverci "I want Reese", scrivono "I want respect", attirando così i gruppi femministi della zona in manifestazione. Lois fa di tutto per farli scendere.

Lois e Hal litigano perché lei compra un materasso matrimoniale più grande: Dewey approfitterà di ciò per scrivere un'opera su questa storia. Malcolm e Reese costruiscono uno slittino da strada, ma vengono sempre battuti da un corridore misterioso, che si scopre essere Stevie: scommettono l'un l'altro del denaro, e vince Stevie.

All'insicuro e indeciso Hal viene assegnato un compito: un vicino ha lasciato scritto nel testamento che sarebbe toccato a lui decidere se staccare o meno la spina in caso di coma. Hal passa tutta la puntata nell'indecisione, ma alla fine trova una soluzione che non viene rivelata allo spettatore. Craig si presenta ai ragazzi chiedendo di essere "addestrato" al combattimento sporco: si scopre che gli serve da usare contro il padre, un uomo atletico e fissato con il fitness, che vuole cedergli una catena di palestre, ma a Craig non interessa. Proprio quando quest'ultimo è sul punto di cedere, Malcolm trova una foto di sua madre, grassa come Craig stesso, il che cozza con la versione datagli dal padre secondo cui anche la madre era molto atletica. Craig e suo padre si separano.

Hal e Lois scoprono di parlare pochissimo durante il giorno a causa dei numerosi impegni di entrambi. L'uomo decide quindi di creare una "ora del Tiki", in cui la coppia può rilassarsi nel garage addobbato stile hawaiano senza scocciature di sorta. Qui si scopre che, mentre Hal crede nel Paradiso, Lois ritiene che la vita sia solo quella terrena, e Hal rimane molto offeso.

Ida è a casa, e fa il primo gesto di generosità della sua vita: salva Dewey da un camion, rimettendoci una gamba. La donna deve tornare a casa ed essere accudita dall'odiato nipote Francis, ma i due trovano un punto d'unione: invece di litigare, discutono di quanto sia opprimente e fastidiosa Lois. Malcolm e Reese vogliono trovare un momento di debolezza dell'altro per incollargli la mano alla faccia, arrivando a non dormire. Finirà che s'incolleranno da soli al pavimento. Dewey vuole fare un funerale alla gamba della nonna, ma la gamba verrà mangiata da un cane che Hal ha portato a casa.

Malcolm e Reese scoprono di essere degli emarginati: gli altri ragazzi non li invitano mai alle feste né li avvisano di quando saltano le lezioni. Fanno un esame di coscienza e pensano che tutti siano solo invidiosi della loro saccenza e violenza. Si presentano a una festa mascherati da mostri con l'intenzione di spaventare tutti, ma l'intento fallisce (stanno tutti pomiciando). Si rompe il frullatore, e Lois cerca la garanzia, finita chissà dove. Inizia a cercarla disperatamente, perché la garanzia è a vita. Dewey invita un suo compagno di classe, Chad, che è fortemente autistico: ordina tutti gli oggetti di casa per tipo (le scarpe tutte assieme, le lampade, i libri...), arrivando anche a colpire con un'accetta i vestiti per dividerne i pezzi per colore. Dewey entra in urto col padre che non voleva il ragazzino in casa, ma è proprio il padre a calmare Chad, mostrandogli un libro in cui aveva iniziato a riempire tutti i buchi delle lettere.

È il giorno del ventunesimo compleanno di Francis, e quest'ultimo si ricorda di una promessa fattagli dal padre: un viaggio in moto proprio in occasione del ventunesimo compleanno. Il problema è che Lois non vuole che Hal torni in moto, le considera troppe pericolose. Per sbaglio le due moto vengono portate a casa invece che al distributore di benzina indicato, e i due sono costretti a scappare dalle ire di Lois. La serata risulterà ottima, e si scoprirà che Francis è diventato astemio. Hal si abbatte perché Francis fa un sacco di cose senza di lui. Prima di tornare a casa, per dare ragione alle mogli sulla pericolosità delle moto, e quindi attenuarne la rabbia, Hal rompe il naso a Francis il quale rompe un dito al padre.

Reese lavora un giorno come disinfestatore, ma siccome il suo capo viene arrestato, gli rimane una scatola con mille bruchi. Alla fine della puntata si trasformeranno tutti in farfalle nella sua camera da letto. Malcolm conosce Wendy, una ragazza che lavora anch'essa al Lucky Aide, e sembrano piacersi. Lavorando in un turno di notte (ovviamente con Craig e Lois) Malcolm scopre che un uomo si è stabilito nel minimarket, tra gli scaffali. L'uomo, tuttavia, non ha mai rubato nulla, anzi, ha spesso aiutato Craig a non strozzarsi mangiando dolcetti. L'uomo da inoltre dei consigli a Malcolm su Wendy. Quando Lois scopre della sua esistenza, avvisa tutti di aver chiamato la polizia, ma appena termina il suo turno se ne va come nulla fosse. Malcolm sciorina tutte le cose che sa su Wendy alla ragazza stessa, che si spaventa credendolo un maniaco.

Lois va a trovare Ida. La nonna ha conosciuto altre donne sue compatriote fumatrici incallite come lei, pronte per festeggiare il giorno di San Grotus, il patrono del loro paese natale. Lois, per non sfigurare, rimane con loro a preparare la torta del santo, un terribile dolce a 31 strati, ognuno simboleggiante una delle gesta del santo. Ad ogni minimo errore il lavoro di Lois viene distrutto, fino a farla umiliare davanti a un'altra torta molto più grande e bella della sua. I festeggiamenti terminano con una complicata danza nella quale Ida e Lois fanno un figurone. A casa, Malcolm ha iniziato un corso di ascolto di musica, in cui però prende un'insufficienza. Si fa quindi aiutare da Dewey, ma dopo un litigio Malcolm gli alza al massimo il volume delle cuffie che rendono Dewey sordo. Per un incidente, anche Malcolm diventa sordo.

Reese, pulendo il giardino dai rifiuti, fa amicizia con un branco di cani nel quale entra, stupendo Malcolm. Reese impazzisce, inizia a comportarsi da cane e a compiere scorribande con loro. Arriverà a esserne il capobranco e ad essere arrestato per essere entrato in un pollaio. I cani sono stati poi castrati. Hal partecipa a un seminario motivazionale: il retore deve andarsene all'ultimo dopo aver sconvolto tutto l'uditorio, ed è proprio Hal, distrattosi a disegnare, a risollevare il morale di tutti senza neanche accorgersene. Presto diventa lui retore dei seminari, dicendo però sciocchezze e parole a vanvera ma riscuotendo comunque molto successo. Dewey "tradisce" Lois frequentando un'altra mamma: Lois si offende come un'amante tradita.

Al Lucky Aide viene licenziato Sam, l'uomo sui trampoli, l'attrazione del negozio, e Malcolm diventa il nuovo uomo sui trampoli. Sam si ripresenta al Lucky Aide sui trampoli, e qui ingaggia una lotta col ragazzo. Alla fine, si scopre che Malcolm aveva trovato un lavoro al circo per Sam. Jamie trova una collana, che a quanto pare fa parte del cosiddetto Tesoro, una serie di gioielli di Lois che Francis nascose prima di partire per l'accademia militare. Siccome la ricompensa per il Tesoro andrebbe divisa tra i tre ragazzi, Dewey chiede al muto Jamie di trovare tutti i "pezzi del Tesoro" per tenere la ricompensa per sé. I due finiscono i casa altrui, venendo ripescati da un poliziotto.

Malcolm e Hal partecipano a una riunione dell'assicurazione di quartiere a cui però non partecipa mai nessuno da vent'anni: il legale è disperato e Hal, dietro suggerimento di Malcolm, diventa il nuovo presidente dell'associazione. Malcolm arriva ad amministrare un conto di più di 83.000 dollari sfruttando l'inettitudine del padre, ovviamente utilizzando il denaro per idee personali. Il progetto andrà a monte perché Hal scrive dei volantini con un elenco di regole per non aver abbracciato il figlio, per non tenere il giardino in ordine e altre assurdità: il quartiere si ribellerà. Francis vuole provare con Dewey dei giochi per un campeggio estivo, e torna a casa. Questo però cozza con l'impegno che Dewey ha verso i suoi compagni di classe squilibrati, i quali chiedono sempre aiuto a lui per qualsiasi cosa. Un giorno in cui Dewey è con Francis, però, i compagni legano e imbavagliano il professore, che faceva loro costruire portachiavi con i laccetti.

Malcolm, Reese e Dewey iscrivono per scherzo Lois alla parata delle Miss delle tre frontiere, una sfilata di donne sposate: Lois decide di partecipare per sentirsi migliore della sorella Susan, ex modella e partecipante di fiere simili. Alla parata è presente anche Herkabe in veste di giudice, che non perde occasione per sfruttare Malcolm minacciandolo di non far vincere Lois, ad esempio facendogli portare bigliettini alle varie partecipanti. Reese ruba un manuale di bellezza per i giudici e leggendolo si ritiene bellissimo, dimenticando che i parametri sono per donne di mezza età. Per questo si mostra ad una esperta di moda lì presente convinto di poter intraprendere una carriera da modello, ma è solo una sua illusione.

Malcolm e Reese cercano di partecipare di nascosto alla fiera "Brucia Totem" ma vengono scoperti dai genitori, i quali successivamente fanno partecipare tutta la famiglia con un camper prestato dal capo di Hal. Una volta arrivati alla fiera, una specie di raduno hippy con personaggi di ogni sorta, la famiglia si divide. Malcolm conosce una sciamana dell'età di sua mamma con cui perde la verginità, Reese si ambienta benissimo con tutti i personaggi che trova dicendo di non essere mai stato così felice, Dewey viene sfruttato da Hal il quale cura ossessivamente il camper mentre Lois conosce un gruppo di ragazze insieme a Jamie. In seguito però le cose cambiano, Malcolm rovina tutto con la sciamana che lo lascia, mentre Reese che viene scelto dai partecipanti per bruciare il totem e porre fine alla festa si rifiuta perché troppo felice. Il secondogenito però lancia la fiamma contro il camper il quale pieno di sostanze per pulirlo di Hal esplode.

Hal si dimentica di pagare l'assicurazione medica della famiglia e cerca di evitare in tutti i modi che qualsiasi componente della famiglia si faccia male nascondendo oggetti contundenti e chiudendo i figli in camera. La sua ossessione però finirà per far crollare parte della casa e fargli lussare una gamba la quale verrà curata da un amico dei figli. Lois nel frattempo partecipa con i suoi colleghi a delle riunioni segrete del sindacato per avere migliori trattamenti sul lavoro. Uno dei colleghi però fa la spia e lei pensa sia Craig il quale viene punito nonostante sia innocente. La donna per scusarsi poi accetta di partecipare a una festa a sorpresa dove Craig canta in suo onore.

Hal scopre che Dewey ha cominciato a fumare trovando tutte le sue sigarette nascoste in casa anni fa. Il padre cerca di far smettere il figlio da questo vizio e in cambio lui cerca di motivarlo smettendo di bere caffe. I due però falliscono e finiscono per invertirsi i vizi, con il padre che riprende a fumare e il figlio che inizia a bere caffè. Vengono però scoperti da Lois che fa smettere entrambi e obbliga Hal a trovare e buttare tutte le sigarette che sono nascoste ovunque in casa. Nel frattempo Reese vuole picchiare Stevie perché lo prende sempre in giro e perché ha paura che Malcolm da grande lo abbandonerà. Il secondogenito per avere uno scontro alla pari sta in una botte piena di ghiaccio dalla cintola in su per avere le gambe bloccate ignaro che Stevie sta provando un esoscheletro in grado di farlo camminare e che gli conferisce una forza sovrumana. Grazie a questo Reese viene picchiato talmente tanto da finire a letto per diverso tempo.

Malcolm e Reese scoprono che la casa in cui vive la famiglia è stato teatro di un massacro molti anni prima, questo terrorizza a morte il padre. Il giorno di successivo è Halloween ma Malcolm ha la febbre e deve stare a casa con Hal il quale ha paura che ci sia un fantasma in casa. Reese e Dewey vanno di casa in casa a fare "scherzetto o dolcetto" portandosi dietro Jamie, ma dopo una casa in cui lanciano uova contro un anziano non si accorgono di averlo scambiato con un altro bambino. Il quintogenito torna quindi a casa e si nasconde in una presa di aereazione mangiando i dolci e facendo rumori, Malcolm e il padre non sapendolo si spaventano pensando sia effettivamente un fantasma. Intanto Lois va a prendere quello che pensa sia Jamie dagli altri due figli e lo porta a lavoro dove però viene arrestata perché i poliziotti pensano abbia rapito quella che si rivela essere una bambina.

Malcolm vuole andare a vedere un autore di fumetti ma la mamma non gli da la macchina. In seguito scopre che Jessica invece l'ha ricevuta da Lois semplicemente facendo finta di sentirsi molto dispiaciuta per il periodo difficile che passa, il ragazzo fa lo stesso e comincia a ottenere vari favori. Nel frattempo Reese ha come compito a scuola di scrivere a un amico di penna in Cina, tuttavia per sue strane argomentazioni ci litiga e decide di partire dentro una cassa per andare a picchiarlo nel paese asiatico. In questo si fa aiutare da Dewey che però in realtà tiene la cassa in garage e gli fa una marea di scherzi. Malcolm viene in seguito ricattato da Jessica nel tentativo di avere la casa libera per avere un rapporto sessuale con il suo ragazzo, ma il primogenito della famiglia poi torna a casa in lacrime perché ha confessato tutto alla madre e interrompe i due fidanzati.

When Malcolm gets paired with a dimwitted beauty as his chemistry partner, he thinks it's a recipe for disaster, but when she reveals her feelings for him, sparks fly. They agree to keep their romantic experiment under wraps until Malcolm realizes that she's just embarrassed to be dating him. Meanwhile, Lois demands that Reese get a job, and she kicks him out of the house to prove that she means business.

Francis decides to surprise the family by coming home, and the power goes out in the house. Meanwhile, it's Lois who's in the dark when Hal decides to cancel their anniversary dinner in favor of a Reese-cooked meal at home. And Malcolm ends up in hot water after he sneaks three Dutch girls into the house.

When Lois finds renewed energy with orthotic inserts for her shoes, Hal fears she will not look to him for support anymore and plots to destroy the inserts. A former female army buddy of Reese's comes to their house for a visit. But she gets defensive when Reese thinks they are way more than just friends and comes intact to the idea of trying to sleep with her.

Lois thinks the new babysitter she found for Jamie is perfect... until she starts driving Lois crazy. Meanwhile, Reese starts getting picked on by the teacher when he and Malcolm are in the same class. However, Malcolm decides to defend him.

Malcolm receives a check for $10,000. After Hal and Lois find out, they decide to keep the money and spend it on something for themselves. However, when Dewey overhears this, he wants to get in on it, too. Now, they'll have to find a way to pay Malcolm back.

Lois, Hal, and Dewey go out of town for a piano competition, so they get Ida to watch over Malcolm and Reese while they're gone. Since Ida thinks Reese needs to become a man, she comes up with a competition for Malcolm and Reese, and if Reese wins, he can take Raduca as his bride. Now, when Lois and Hal return, they're surprised to find out that Reese has run away to Las Vegas to get married.

A broke Francis gets talked into getting a real job by Dewey, but one of Francis' rocker friends decides to offer him the position of tour manager of his band instead. Back home, Hal takes over the college recruiters, which Malcolm refuses to meet with, and treats each one as a suitor. However, Hal's plans are ruined when Malcolm chooses to go Harvard.

Lois discovers she has mono after a visit to the doctor. She then ends up giving it to Malcolm after her maternal instincts begin. As a result, both Lois and Malcolm are forced to spend an entire day and night together in the same room. Hal, meanwhile, is invited to all of his neighbors' parties after they know Lois will not be attending any of them.

Hal learns that his father has passed away, but sheds no tears and passes it off as nothing since he never knew him. So, to make sure nothing like that happens again, he lets the boys do whatever they want by letting them miss school and even offering to buy Malcolm a new car, until Lois puts a stop to it. Noticing how depressed Hal has become, his friend Abe brings George Takei over for a visit in an attempt to cheer him up.

Francis receives a visit from Lois and Hal to celebrate his one-year anniversary of sobriety. However, when they attend one of his A.A. meetings, it's revealed that it was Lois who forced him to start drinking. Back home, Dewey finds Hal's spare key for his car and tries to get Malcolm and Reese to drive him to the arcade, but, of course, they refuse.

When four popular high school girls play an evil prank on Reese by pretending he has a secret admirer and then dropping a pig off at his front door, Lois comes to his rescue. She plots her revenge on the four unsuspecting girls and wreaks havoc on their adolescent lives. Meanwhile, Hal realizes Lois is at a dangerous emotional place so he decides to get some distance and stumbles upon the idea for making his own pitching machine out of stuff in the garage.

Hal's friend Trey tells him to come to his dental office when he looses a tooth during a poker game, but their friendship becomes in jeopardy when Hal's faced with a $2,000 bill and causes a fight between them. Reese, meanwhile, teaches Lois how to ride a bike, while Malcolm and Dewey find sleeping as their new favorite pastime.

Malcolm joins a local dance class to impress a girl, but when she loses her footing, he realizes that to win the competition he'll need a partner who can step it up. Dick, a rival student in the class who takes dancing a bit too seriously, challenges Malcolm to a dance-off. Meanwhile, Hal discovers an underground bachelor pad in the backyard.

When Stevie goes to the hospital, Malcolm tries making up every excuse he can think of to not go because he can't face the truth about his illness. Meanwhile, back home, Hal gets highly competitive about his new remote control boat, while Lois thinks she's going insane.

Reese meets a cute vegetarian named Carrie when he goes back to work at the meat plant. At first, he goes along with her political talk, but she catches him with a pork chop. So, to get Carrie back, he sets free all the cows at the meat plant. Malcolm, meanwhile, tries to fool Lois in order to attend a rock concert.

For the senior prom, Reese gets paid to take Janine, a studious girl in class, but only after she gives him a makeover and sends him to finishing school, while Malcolm aligns with the unpopular kids to form an anti-prom they call "Morp." Unfortunately, while Malcolm and his friends protest the official dance, they don't know how to make their "Morp" exciting. Meanwhile, Dewey discovers there aren't any childhood pictures of him, so he concocts an elaborate scavenger hunt to punish Hal and Lois.

Malcolm struggles with his speech when he's elected valedictorian of his graduating class at school. However, Lois refuses to listen to any of his complaints and reveals that she wants him to become President of the United States. Meanwhile, Reese does everything he can to get a permanent job as a high school janitor, which includes creating the most disgusting mess ever. In the meantime, Hal has problems with Malcolm's Harvard tuition, while Francis finally gets a real 9-5 job that he actually enjoys. Also returning for the family celebrations is Grandma Ida, as they all say goodbye to Malcolm when he leaves for college.