This episode was originally supposed to air on 4/18/07, but was postponed a year due to the tragic events at Virgina Tech. As a result scenes were changed to fit in season 3 and are restored in this version.

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With optional commentary by executive producers Hart Hanson and Stephen Nathan.

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Interview on the red carpet with Angela Montenegro and Dr. Jack Hodgins

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Bones viene coinvolta in un'indagine dell'F.B.I. per scoprire l'assassino di una ragazza massacrata quasi due anni prima. Grazie alla sua abilità nell'interpretare indizi sui resti umani, la dottoressa Brennan indirizza le indagini verso la giusta soluzione.

Brennan e il suo team sono sulle tracce di un terrorista.

Il cadavere di un ragazzo viene trovato appeso a un albero come se il giovane si fosse impiccato. Booth e Brennan sono in disaccordo in quanto per l'agente dell'FBI si tratta di omicidio, mentre Brennan crede più probabile un suicidio. Le indagini portano alla luce una grottesca verità...

Booth e la dottoressa Brennan vengono inviati in una piccola cittadina di montagna per indagare su alcuni resti umani nello stomaco di un orso. Con grande sorpresa, si accorgeranno di essere alle prese con un caso di cannibalismo...

Viene ritrovato il corpo defunto di un bambino stuprato. Grazie al temperamento di Bones, che si ritrova ad avere un dialogo quasi materno con il fratello minore della vittima, si viene a conoscenza del nome dell'autore dell'omicidio.

Bones ed Angela si ritrovano coinvolte in una quasi rissa in una discoteca, che porterà la scoperta di una mummia nascosta dietro al muro della console. Si indaga sul mondo del rap e dell'hip pop.

Un avvocato tenta di salvare la vita ad un condannato a morte, secondo lei accusato senza la visione di tutte le prove. Viene coinvolto Booth che aveva arrestato l'uomo ai tempi dell'omicidio. Bones è convinto che l'uomo sia colpevole, ma realizzaerà che il caso ha ancora molti aspetti non risolti.

Un ex-professore (ed ex-amante) di Brennan - il dottor Micheal Stires, sorprende Brennan con una visita mentre è in città per un colloquio. Mentre si stanno accordando per una cena insieme, Booth porta il

La vigilia di Natale, Temperance deve identificare un cadavere ritrovato in un rifugio sotterraneo, la cui morte risale a una cinquantina di anni prima.

Bones e Booth indagano sul caso di una prostituta è stata fatta a pezzi vicino all'aeroporto. Il caso diviene più difficile del previsto, poiché la donna ha subito diverse operazioni radicali di chirurgia plastica che hanno compromesso la possibilità di risalire al suo aspetto naturale.

Il corpo incenerito di una donna viene trovato all'interno di un'auto e ci sono indizi che fanno pensare che suo figlio sia stato rapito.

Viene ritrovato il cadavere semi decomposto di un presunto giovane. Booth e Bones scoprono la sua identità: si tratta di un ragazzo solitario frequentante un clan dedito al fanatismo per i giochi di ruolo e le storie a fumetti. Zack, effettuando la pulizia delle ossa del cadavere, rileva la presenza di un altro osso non appartenente alla vittima: è caccia al suo assassino.

Il membro di una banda viene fermato con il cadavere di una giovane nascosto nel suo portabagagli.

Brennan e Zack indagano sul luogo in cui si è schiantato un piccolo jet, che aveva a bordo dei diplomatici cinesi.

Mentre indagano su un corpo che potrebbe essere di un capo-mafia, Booth e Brennan lavorano anche su dei crimini seriali.

Brennan e Booth indagano su uno strano omicidio nel sottosuolo cittadino.

Mentre Angela è in vacanza nel deserto, chiede a Brennan di raggiungerla in seguito al ritrovamento di un teschio.

Viene ritrovato un cadavere che stringe nel pugno un osso vecchio di 300 anni. Le indagini di Booth e Brennan conducono a un sito dove potrebbe essere nascosto un tesoro dei pirati.

Brennan va a New Orleans per aiutare a identificare i corpi dissotterrati dal passaggio dell'uragano Katrina.

La figlia del vice direttore dell'Fbi è malata di un cancro ai polmoni molto raro. Bones, chiede di vedere le lastre di un'operazione subita qualche tempo prima, a causa di una caduta con lo snowboard. Vengono effettuate delle analisi e la risposta è sconcertante: alla ragazzina è stato trapiantato l'osso di una persona malata di cancro, che l'ha quindi condannata.

L'apparente suicidio di un manifestante all'Arlington National Cemetery si rivela invece un omicidio e la vittima è un soldato che aveva prestato servizio in Iraq.

Booth apre un'inchiesta ufficiale sulla morte dei genitori di Bones.

Brennan viene chiamata per il deragliamento di un treno…e scopre di avere un nuovo capo!Il treno su cui viaggiava un famoso senatore viene deragliato da una macchina parcheggiata sulle rotaie. Brennan scopre perchè il cadavere di un ricco imprenditore era stato messo nella macchina. E nel frattempo continua a cercare suo padre.

I detective esaminano i resti di una donna e del feto che portava nel suo ventre.

Un incidente ad un camion della spazzatura rivela il corpo di un ragazzo scomparso da 3 settimane. Quando l’indagine rivela che una ragazzina in affido e’ il principale sospetto, Brennan si deprime vedendo come tutto il resto del team getta facilmente la colpa al sistema degli affidi di cui lei ha esperienza diretta.

Booth e Brennan dissotterrano i resti di una giovane ragazza.

Il corpo di un elettricista viene ritrovato in un sito dove si stanno costruendo dei condomini dentro una vasca da bagno piena di liquidi corrosivi.

I detective indagano su un'esplosione avvenuta in un hotel durante una conferenza sui traffici di droga.

I resti di una ragazzina vengono trovati nel sistema di filtrazione di una centrale per il trattamento delle acque. Le indagini porteranno Booth e Brennan nel preoccupante mondo dei concorsi di bellezza per bambini.

Booth e Brennan sono a Las Vegas per indagare sullo scheletro di un procuratore federale morto cinque anni prima. Nella stessa zona trovano i resti di una ragazza morta da una settimana, uccisa con le stesse modalità del procuratore. Scopriranno che sono stati entrambi uccisi da una banda che organizza combattimenti a mani nude clandestini.

Si indaga su un serial killer, che chiede un riscatto in cambio della libertà delle sue vittime, sepolte vive.

Si indaga sulla morte di uno studente di cinema, che girava un documentario sulla leggenda di una maga.

Mentre indaga sull'omicidio di un vecchio agente dell'FBI, la squadra scopre una decina d'anni di cospirazioni. Il padre di Brennan potrebbe esservi invischiato...

I cari di Brennan sono il bersaglio di un serial killer fuggito di prigione.

Booth viene mandato da uno psichiatra dopo avere scaricato la sua pistola in pubblico senza alcun motivo. A Brennan viene così affidato un altro compagno, l'agente dell'FBI Sullivan.

Brennan e la sua squadra indagano sulla morte di un ricco donatore che conosceva Hodgins. Intanto la storia d'amore tra Brennan e Sully si fa sempre più intensa.

Le indagini sono incentrate su una serie di omicidi, che somigliano a quelli descritti in un romanzo. Booth e Sully cercano l'assassino tra i suoi appassionati lettori, misteriosi frequentatori di siti internet.

Booth interrompe le vacanze di Brennan quando il cadavere di una donna, privo di ossa, viene trovato in un fiume.

Il team indaga su un omicidio avvenuto nei sotterranei di una chiesa cattolica.

I resti di un corpo vengono scoperti dentro un blocco di cemento e Booth ha la sensazione che la vittima fosse legata a un boss del crimine organizzato.

Il team indaga sulla morte di un astronauta, che sembra essere caduto sulla Terra da un'altitudine molto elevata.

Si indaga su delle ossa lucenti, trovate in una vecchia casa in pietra. La squadra tenta di scoprire se il corpo è entrato a contatto con degli elementi radioattivi.

Il corpo di una bambina con una rara malattia che induce all'invecchiamento precoce, viene ritrovata in una zona abbandonata, una sorta di palude.

Un teschio viene lanciato da un cavalcavia e si schianta sul parabrezza di un'auto: Booth convince Bones a tornare a investigare sul campo con lui, visto che da tre mesi rimaneva chiusa in laboratorio per coprire i turni di Zack, partito per l'Iraq, che lei non riesce a sostituire.

L'omicidio improvviso di una madre di famiglia è uno spunto inaspettato per spingere Bones a rivalutare il suo rapporto con il padre e le intenzioni di lui nei suoi confronti. Booth, seguendo le indagini, scopre che l'omicidio è l'ultimo strascico di un caso aperto ben 3 anni prima e di cui si era occupato il suo mentore.

Il team indaga su un omicidio nel torbido mondo del sesso fetish.

Il team scava per risalire all'omicidio di un contadino.

In un parco dei divertimenti, all'interno di una delle attrazioni, viene trovata una mummia che purtroppo non è un fantoccio, ma un vero cadavere. Gli eventi si svolgono a ridosso della notte di Halloween e il gruppo di lavoro del Jeffersonian, che la sera sarà impegnato in una festa di rappresentanza, si trova a gestire l'indagine in abiti e situazioni fumettistiche.

In un inceneritore vengono scoperti i resti di una ragazza interna dell'istituto. Si incomincia ad indagare e tutti vorrebbero affibbiare il delitto al serial killer ma Booth lo esclude a priori e lentamente emergerà una torbida storia di amore, prestigio e contrabbando. Bones è amareggiata nello scoprire che l'assassino è proprio uno degli scienziati del Jeffersonian.

Il team indaga sul ritrovamento di un corpo in una capsula del tempo in un liceo.

La lotta al "figlio della vedova" continua.

Il team investiga sulla morte di un babbo natale.

I resti di un pilota di moto sono trovati in una sorgente termale. Il team cerca il killer.

Booth e Bones indagano sul corpo trovato nel retro delle tribune di un campo da Basket. Il cadavere si rivelerà essere di un giocatore della squadra della scuola, rimasto impantanato in una complessa situazione fatta di steroidi, di cheerleader e di gelosia paterna. Bones non ha una buona opinione generale degli sportivi e Booth approfitterà della situazione per farla ricredere.

Booth e Brennan indagano sulla scena del ritrovamento di un'automobile uscita di strada. Il corpo della vittima è stato deliberatamente incediato per evitarne il riconoscimento.

Mentre Booth e Bones si apprestano a iniziare una nuova indagine, Caroline va a informarli che sta per iniziare il processo per omicidio a carico di Max, il padre di Temperance. Durante il processo, per accusa e difesa ci saranno alti e bassi : la giuria ha bisogno di un « uomo nero » da incolpare per l'omicidio e quello nero, potrebbe darglielo proprio Bones.

Brennan e Booth investigano su'omicidio di un giovane aspirante cantante il cui corpo è stato rinvenuto sul margine di una strada di campagna.

Al Jeffersonian viene ritrovato un osso mascellare umano. Brennan e il team capiscono al volo che il serial killer Gormogon ha colpito ancora.

Booth e Brennan si trova in Inghilterra, il primo per partecipare a una conferenza a Scotland Yard come oratore, mentre Bones è stata invitata alla prestigiosa Università di Oxoford. Conoscendo le capacità professionali di entrambi, le autorità locali chiedono una consulenza sul caso di un omicidio che coinvolge una famosa ereditiera Americana.

Booth e Brennan si trova in Inghilterra, il primo per partecipare a una conferenza a Scotland Yard come oratore, mentre Bones è stata invitata alla prestigiosa Università di Oxoford. Conoscendo le capacità professionali di entrambi, le autorità locali chiedono una consulenza sul caso di un omicidio che coinvolge una famosa ereditiera Americana.

Il corpo di un noto conduttore televisivo di reality show viene ritrovato parzialmente decomposto. Booth e Brennan si occupano delle indagini; nel frattempo Booth scopre che Bones si sta destreggiando tra due relazioni...

Il figlio di Booth, Parker, scopre un dito umano nel nido di un uccellino. La squadra rintraccia il cadavere a cui appartiene il dito ritrovato e scoprono che la vittima è stata uccisa da un cane. Le indagini portano alla scoperta di un ring illegale di lotta canina.

Un cadavere smembrato e senza testa viene ritrovato in una strana pozza d'acqua color porpora. La squadra si mette al lavoro per cercare indizi per localizzare il killer, ricevendo aiuto da Zack che sta studiando il caso dall'ospedale psichiatrico.

Il corpo di una donna viene ritrovato nella colonna dell'ascensore di un edificio. La vittima è Patty, una severa capo ufficio. Un collega è l'assassino…

Nella baia di Chesapeake, vengono ritrovati i resti del cadavere di una donna. Brennan e Booth si recano sul posto per indagare.

Il cadavere di Geoffrey Thorne, artista post-moderno, viene ritrovato in un'auto compattata, destinata a diventare una delle sue sculture.

Brennan e Booth indagano su un cadavere ritrovato durante un'esercitazione della polizia. All'inizio, il corpo sembra appartenere a un certo Jim Stegman...

Booth e Brennan sono diretti in Cina per analizzare delle antiche ossa. Sull'aereo si trovano a dover risolvere il caso di una donna uccisa a bordo.

Max, il padre di Brennan, ottiene un posto da insegnante al Jeffersonian. Quando l'uomo partecipa alle indagini su un caso di omicidio, Brennan scopre di essere infastidita dalla presenza del padre nella sua vita professionale.

Booth e Bones indagano sotto copertura in un circo per scoprire chi ha assassinato due gemelle siamesi che hanno lavorato presso lo spettacolo ambulante prima di essere assassinate.

Un vigile del fuoco viene assassinato nei pressi di un'arena di hockey. Booth non può seguire le indagini in quanto sospettato e Brennan lavora con una nuova partner inviata dall'FBI.

Alcune prove sono scomparse dal fascicolo sul Becchino e Brennan e Hodgins sono sospettati di averle sottratte. La situazione precipita quando Booth viene rapito dal Becchino e per liberarlo vuole tutte le prove a suo carico. Mentre la squadra fa di tutto per salvarlo, Booth non rimane con le mani in mano e grazie a un amico del suo passato riesce a sconfiggere il piano del Becchino.

La squadra indaga sull'omicidio di una donna trovata morta vestita da principessa medievale a una convention sci-fi. Booth ha problemi alla schiena e Brennan si ritrova in coppia con l'Agente Payton Perrotta.

La squadra ha soltanto poco tempo a disposizione per scoprire cosa è accaduto ad un venditore d'auto assassinato prima che le sue ossa si disintegrino completamente.

Brennan e Booth indagano sulla morte di una ragazza di 16 anni incinta che è stata trovata sepolta in un mucchio di sale da strada. Durante le indagini, mettono in luce un patto esistente tra la vittima ed alcune delle compagne della squadra di pallavolo.

La squadra indaga sull'omicidio dell'ex di Cam, il cui corpo è stato trovato nella gabbia della tigre allo zoo. Sweets ed Angela ipnotizzano uno dei sospetti dell'omicidio.

La squadra viene condotta in un conosciuto centro di ricerca scientifica dopo la scoperta di un pezzo di meteorite nell'orecchio di una vittima i cui resti polverizzati vengono rinvenuti tra la spazzatura. Nel frattempo, il padre di Angela ritorna alla ricerca di vendetta su Hodgins.

Un corpo femminile viene rinvenuto in un centro di riciclaggio e la squadra del Jeffersionian viene chiamata ad indagare. Nel frattempo Booth e Brennan si imbattono nella ragazza di Sweets che si trova in un negozio di abiti nuziali con un altro uomo.

Brennan e Booth indagano nel mondo della death metal music per scoprire chi ha ucciso un bassista di una band, il cui scheletro è stato usato come oggetto di scena da un'altra metal band. Nel frattempo Sweets sta lavorando al libro su Bones e Booth e chiede consiglio al Dottor Gordon Wyatt su qualche spunto narrativo.

Un impiegato del museo muore per infarto cardiaco. Mentre si trovano alla veglia, Brennan osserva il corpo e si convince che la morte non sia stata accidentale bensì causata da qualcuno. Convince Booth a rubare il corpo per poterlo esaminare meglio e uno strano mistero si dipana durante le indagini.

Brennan e Booth indagano sulla sparizione della sorella del detective Ken, un amico di Seeley. Purtroppo il ritrovamento della sua testa amputata conferma l'ipotesi di omicidio e i tre si mettono sulle tracce del killer.

La squadra indaga sul caso du un ragazzo, Beaver, appartenente a una confraterninta, ritrovato morto nell'uniforme della mascot di una scuola rivale. Nel frattempo Booth aiuta Jared a trovare un nuovo lavoro.

Temperance decide di voler avere un bambino e chiede a Booth di essere il padre. Seeley rimane scioccato dalla proposta e lo stress dell'emozione, legato a un problema di salute non diagnosticato, gli causa delle allucinazioni in cui si trova a parlare con Stewie, il perfido neonato di una nota serie a cartoni animati, I Griffin.

Nel finale di stagione, il team indaga su un corpo ritrovato in un famoso nightclub chiamato il Laboratorio. Le indagini prendono una piega insolita e la squadra del Jeffersonian si ritrova a investigare nei panni dello staff del club e come ufficiali di polizia.

Booth si sveglia dal coma, nel quale ha vissuto una vita parallela in cui amava Brennan. Al risveglio non riesce a capire fino a che punto i suoi sentimenti siano reali.

Booth e Brennan si dedicano a due casi di omicidio collegati fra loro, quello di un corriere russo di diamanti e di un analista della CIA.

Le ossa di Levi Yoder, un membro della comunità Amish, vengono ritrovate vicino a una linea ferroviaria. Booth e Brennan scoprono che Yoder era un brillante pianista e sospettano che il suo talento sia stata la causa della sua morte. Cam ha dei problemi con il suo nuovo ruolo di genitore e chiede consiglio a Booth per tenere in riga Michelle.

Brennan e Booth indagano su dei resti umani ritrovati durante una festa di quartiere. I due chiedono aiuto a Sweets quando si ritrovano con troppi sospettati a causa di motivi politici e scandali nel vicinato che collegano tutti a un movente o l'altro. Nel frattempo Parker, il figlio di Booth, cerca di trovargli una fidanzata.

Un gruppo di ecologisti radicali appende una mummia sul cancello di una centrale elettrica. Ben presto si scopre che la mummia è coperta di sangue...

I resti di un allevatore di polli vengono ritrovati sulla riva di un fiume e Booth e Brennan sono chiamati a investigare. La vittima, che era un attivista per i diritti degli animali, stava per ereditare una fabbrica di pollame e aveva molti nemici con altrettanti moventi per ucciderlo. Bones e Booth cercano di scovare il colpevole e assicurarlo alla giustizia.

Booth e Brennan si occupano dell'omicidio di un nano che in vita era una star del wrestling. Booth scopre che in seguito all'operazione al cervello, la sua mira da cecchino non è più quella di una volta e ha dei problemi ad superare i test dell'FBI. Inoltre una vecchia conoscenza fa ritorno in città.

Un agente immobiliare scopre dei resti umani mentre sta mostrando una casa a dei clienti. Il team indaga sul caso; nel frattemo il nonno di Booth si trasferisce da lui e lo segue durante le indagini...

Booth e Brennan sono chiamati a indagare sulla morte di un giocatore, il cui successo gli ha procurato non pochi nemici. Intatno Fisher fa amicizia con Hodgins e Sweets.

Bones e Booth indagano sulla morte di un uomo vestito da Babbo Natale che ha cercato di rapinare una banca. Intanto Max, il padre di Brennan, chiede a Margaret, una lontana parente, di trasacorrere il Natale con loro.

Booth e Brennan si recano in New Mexico per indagare su un corpo trovato nel deserto di Roswell. Intanto al laboratorio viene rivelata la storia tra Angie e Wendell.

Il Jeffersonian viene requisito da un gruppo di agenti governativi che ordinano al team di scoprire la causa della morte di un cadavere top secret. Booth, con l'aiuto del suo capo, riesce a intrufolarsi nel laboratorio per scoprire cosa sta succedendo.

Brennan e Booth indagano su uno scheletro trovato in una trincea della Guerra Civile. Bones determina che i resti sono di un dentista del presesnte, ma una sostanza incollata alle ossa previene l'identificazione della causa della morte. Intanto il fratello di Booth, Jared, torna con delle novità.

Temperance e Booth indagano su dei resti sfigurati che hanno uno stranno collegamento con un testo biblico. Una volta identificata la vittima, che era un paziente in un ospedale psichiatrico, la squadra ha dei problemi a restringere il campo dei sospettati.

In seguito alla rottura di una condotta idrica, la metropolitana dove si trova Sweets viene investita dall'acqua, cosa che porta alla luce dei resti umani e uccide sul colpo un passeggero seduto al fianco di Lance.

Nel 100esimo episodio vediamo il primo incontro tra Bones e Booth nel passato e l'evoluzione della loro amicizia nonchè del loro rapporto professionale.

Booth e Brennan indagano su dei resti umani ritrovati nel liceo frequentato da Brennan, il Burtonsville High School. Angela identifica il corpo e si scopre che si tratta di un ex compagno di classe di Temperance. Per poter indagare liberamente, i due si fingono una coppia sposata durante una riunione di ex alunni.

Il team sta lavorando sul caso che coinvolge uno squalo nel cui stomaco hanno trovato dei resti umani. In aiuto alle indagini arriva un'esperta biologa marina che trova Booth molto attraente.

La squadra di Booth e Brennan si occupa di un omicidio avvenuto in un durante un raduno fantasy-rock&roll.

La squadra indaga su due corpi ritrovati nei boschi, uno appartenente a una vittima recente, l'altro vecchio di oltre 300 anni. Booth e Bones raccolgono indizi e prove, mentre Angela e Hodgins finiscono in prigione.

La squadra di Brennan lavora per assicurare prove sufficienti per far si che il processo del Becchino si risolva con una condanna.

Mentre il team indaga su dei resti, Booth e Brennan ricevono un'occasione che capita solo una volta nella vita, inoltre Angela riceve una visita da suo padre.

Sette mesi dopo la partenza dal paese sia di Bones che di Booth, Caroline li richiama al Jeffersonian per aiutarla a salvare il lavoro di Cam e lavorare insieme ad un caso controverso.

Nel Parco Nazionale vengono rinvenuti i resti di una coppia in una grotta e la squadra cerca di scoprire chi erano e perché sono stati assassinati. Nel frattempo la ragazza di Booth arriva in città, annunciando il suo trasferimento per poter stare più vicina a Seely.

Un caso al Jersey Shore svela un lato nascosto di Brennan: i due si occupano del ritrovamento di un ragazzo il cui corpo in decomposizione si trova vicino a un night club. Grazie alle video camere di sorveglianza il team ha un grosso indizio, che però non è quello che sembra.....

Dopo aver trovato un teschio e delle mani in un cassonetto, il team di Bones va alla ricerca del resto delle ossa. Dopo l'identificazione della vittima, un cacciatore di taglie, il gruppo scopre che l'uomo era alla ricerca di un killer soprannominato Braverman, e che lui non era l'unico sulle sue tracce.

Booth e Brennan si occupano dell'omicidio di una ballerina che li guida a un gruppo di ballerini di strada come sospettati. Intanto Hannah finisce in ospedale dopo una sparatoria.

Behind the scenes of Bones

Il corpo di un ragazzo viene ritrovato in un'antica nave trafficante di schiavi affondata e Brennan si occupa di identificare la vittima mentre Cam scopre di avere un collegamento personale con la Amelia Rose, la nave riportata a galla.

La squadra è chiamata alla fabbrica di cioccolato della Walpert, la più grande fabbrica di barrette di cioccolato, dove purtroppo si scopre che gli ingredienti non sono i soliti latte e cacao. Cam è presa in contropiede quando Michelle sceglie un college la cui reputazione non è famosa per via dei suoi meriti accademici.

La squadra indaga su un camioncino bruciato dove sono rinvenuti i resti di una vittima fusi con il cruscotto. Tuttavia trovare la causa della morte è una sfida per Brennan e il suo team. Le tracce portano a un liceo locale dove le risposte al caso potrebbero essere nascoste in una relazione proibita.

Booth e Brennan indagano sulla morte misteriosa di un chirurgo la cui vita e morte mettono in dubbio la leggendaria obiettività di Temperance.

La squadra indaga sul caso di un cadavere trovato in una doccia collegato ad un'operazione di falsificazioni. Altrove Hodgins ed Angela devono prendere delle decisioni importanti riguardo la famiglia, mentre Booth confessa ad Hannah i sentimenti di Brennan per lui.

L'appello finale del "Gravedigger" porta l'attenzione della squadra su un cecchino che prende di mira Ms. Taffet, ma mette in pericolo anche altri.

Booth e Brennan indagano la morte di un uomo trovato in un campo di grano. L'uomo era un poligamo, sposato a tre donne, sorelle tra loro.

I resti di un ciclista vengono trovati sul tetto di un magazzino dopo un tentativo fallito di acrobazia. La squadra indaga sull'incidente e scopre che si tratta di un omicidio. Sweets chiede consiglio a Booth perché ha intenzione di dichiararsi a Daisy.

Il giorno di San Valentino la squadra indaga i resti liquefatti di un'organizzatrice di matrimoni trovata morta in casa. Cam preme perché il caso sia risolto in fretta, in modo da poter passare del tempo con il suo compagno. Booth e Brennan non danno molta importanza alla festività, mentre Hodgins ha in programma una giornata speciale per Angela.

Jacob Boradsky ritorna con un caso che lo metterà in competizione con Booth. Intanto al laboratorio il padre di Angela arriva con una delle sue solite strane richieste.

Una tempesta causa un black out durante un'indagine su un caso di omicidio e il team deve adattarsi a lavorare senza i loro giocattoli tecnologici. Sweets intanto s'intromette ancora una volta tra Booth e Brennan quando quest'ultimi rimangono bloccati in un ascensore.

Brennan si associa a un esperto canadese per determinare l'identità di alcune vittime dopo che sette paia di piedi approdano sulle rive al confine con il Canada. Cam intanto ha dei problemi con Michelle perché intende decidere al suo posto quale sarà l'università che dovrà frequentare.

I resti di un uomo che presentava un programma su leggende e mitologia, vengono ritrovati nei boschi della Virginia Occidentale. Le cose si complicano quando viene ritrovato un video che da' rilevanza a una teoria su possibili eventi sovrannaturali.

Il corpo di una guardia giurata viene ritrovato nelle Everglades in Florida dopo il tentativo di furto di una carta nautica del 17esimo secolo. Booth chiama Walter Sherman come consulente al caso. Sherman, che ha la reputazione di poter trovare l'introvabile, si dimostra essere di grande aiuto.

Il team indaga sui resti di un uomo d'affari che in vita era molto amato, ma che da morto sembra aver suscitato l'odio di tutti. Durante le indagini si scopre che la vittima aveva una sua personale filosofia di vita e i membri della squadra decidono di provare a seguirla con risultati abbastanza sorprendenti...

Una ragazza non udente viene ritrovata per strada, ricoperta di sangue e con un coltello tra le mani. Bones e Brennan cercano di scoprire chi sia e se è effettivamente l'autrice di un omicidio.

Jacob Broadsky si fa di nuovo vivo con un'altra vittima e Booth è deciso a catturarlo una volta e per tutte.

La squadra sta indagando sui resti di un giocatore di bowling ritrovati incastrati in una delle piste. A corto di indizi e piste da seguire, Booth e Brennan decidono di indagare sotto copertura come una coppia di campioni di bowling.

Il corpo di una donna viene ritrovato sotto un campo da giochi e porta più domande che risposte, soprattutto perché non si riesce a scoprire la sua identità. Per quanto riguarda Booth e Brennan stanno imparando a condividere i loro spazi e la pancia di Temperance che sta crescendo.

Un nuovo elemento, un genio dal passato criminale, si unisce al team del Jeffersonian, collaborando alle indagini sul ritrovamento del cadavere di una campionessa di "gare di cibo"…

La scoperta di un direttore di un'azienda di giocattoli impacchettato insieme ai suoi prodotti dà a Boothe e Sweets libero accesso alla compagnia mentre sono a caccia dell'assassino. Intanto Brennan è preoccupata per il suo ruolo come madre mentre Sweets è alle prese con la sua certificazione per il possesso di un'arma da fuoco.

Il team del Jeffersonian indaga sull'orrido ritrovamento fatto da alcuni impiegati delle poste: pacchi postali pieni di pezzi di cadavere. Intanto Booth riceve una notizia scioccante…

Il corpo di un appassionato di tornado viene ritrovato dopo che un twister ha sconquassato l'area e durante le ricerche viene rinvenuto un video che mostra un colpevole diverso dalla tempesta di Madre Natura. Angela e Hodgins si rivolgono al padre di lei per avere aiuto, mentre Brennan deve affrontare le ansie di Booth che si preoccupa per ogni suo spostamento.

Il team indaga su una scena del crimine nei pressi di un monumento nazionale. L'unico indizio lasciato è un messaggio in codice scritto con sangue umano che dà inizio a una caccia alla soluzione, omaggio dell'ultimo killer incontrato dalla squadra che ha una passione per i codici e la tecnologia. Intanto Brennan e Booth sono alla ricerca di una casa.

I resti di un evaso vengono ritrovati in una fogna ma l'esame delle condutture, indica che l'omicidio è avvenuto all'interno della prigione. Brennan insiste nel volersi occupare del caso nonostante Booth le chieda di prendersi del tempo per riposare. I due rimangono scioccati dall'arrivo imprevisto e poco ortodosso della loro piccolina.

È il primo giorno di lavoro per Brennan dopo le otto settimane di maternità e decide di rimanere in laboratorio mentre Booth continua a lavorare con Genny Shaw. Cam intanto non è felice del fatto che Michelle stia uscendo con Finn.

Un corpo viene ritrovato dipinto di blu e Arastoo Vaziri trova il modo di eliminare i danni prodotti al cadavere per identificare la vittima. Bones continua a non sentirsi ancora a suo agio con il suo corpo dopo aver partorito e Booth decide di fare qualcosa per farla sentire meglio con sé stessa.

Il corpo di un camionista viene ritrovato nei boschi, Booth e Brennan interrogano il figlio della vittima e dopo si recano nella palestra di karate che la vittima frequentava per cercare un movente. Hodgins intanto si sta occupando di acquistare nuove attrezzature tecniche per il laboratorio. Il figlio di Booth, Parker, ritorna dall'Europa e Brennan è ansiosa su come accoglierà la nuova sorellina.

Un altro corpo viene rinvenuto nei boschi e si scopre che la vittima era coinvolta in una profonda faida tra due famiglie. Brennan è riluttante a servirsi di suo padre come babysitter ed è costretta ancora una volta ad affrontare il suo passato per risolvere il problema.

Brennan e Booth si dirigono a Los Angeles per fare da consulenti al film che li vedrà protagonisti. Una volta sul set Brennan interviene per correggere dei difetti nell'interpretazione degli attori ed errori scientifici nella sceneggiatura. Temperance si accorge che un cadavere usato come oggetto di scena è in realtà un cadavere vero cosa che coinvolge lei e Booth nelle indagini. Un dettaglio imbarazzante della vita di Cam viene alla luce.

Christopher Pelant, un sospettato in un vecchio caso di Brennan e Booth, torna in tribunale per un appello. Sapendo di quello che è capace, i due avvisano il giudice che è il sospettato in due casi di omicidio. Booth e Bones si recano sulla scena di un altro omicidio e si rendono conto che la vittima è amica di Brennan.

Brennan è stata accusata di omicidio e si sta nascondendo dall'FBI con l'aiuto di suo padre. Booth e il team dello Jeffersonian sono convinti che Christopher Pelant ha manipolato le prove per far sì che Brennan venisse accusata. Una soffiata anonima guida Booth ai resti di un consulente scolastico che potrebbero avere la chiave per provare l'innocenza di Temperance.

Con Brennan tornata al suo posto, la squadra lavora al caso di un famoso avvocato divorzista, ucciso proprio mentre lui stesso stava separandosi dalla moglie. Intanto Brennan e Booth, a casa, hanno qualche problema a riprendere la normale routine.

Dopo l'esplosione di una bomba nel parcheggio di un hotel, la squadra del Jeffersonian è chiamata per ricomporre e riconoscere i corpi delle vittime. Per Brennan e la sua squadra questa volta ci sarà una grossa sopresa quasi paranormale. Intanto Booth deve lavorare dietro la scrivania per poter avere una promozione, così Sweets si trova a lavorare temporaneamente con l'agente speciale Olivia Sparlin.

Il team del Jeffersonian lavora per ricostruire le cause della morte di un impiegato di un'expo di animali. Intanto Sweets e Daisy parlano della loro relazione, e prendono un'importante decisione.

Il team indaga sulla morte di una donna il cui corpo è stato ritrovato mutilato ed eviscerato in modo estremamente accurato, in un cassonetto della città. Booth, scopre che Sweet vive nel suo ufficio al Jeffersonian, e lo invita a stare a casa sua con lui e Brennan mentre è alla ricerca di un nuovo appartamento.

Bones è decisa a fare un'esercitazione che sia anche un'esperienza di team building per i suoi, e li incita a cimentarsi in una sfida all'ultimo 'cadavere non identificato'. Durante le indagini il team scopre l'identità di un uomo che è morto in seguito all'attacco dell'11 Settembre.

La dottoressa Temperance Brennan e l’agente Seeley Booth indagheranno sul misterioso omicidio di un esperto di pulizie di scene del crimine, i cui resti vengono ritrovati in una capsula ermeticamente sigillata, una sorta di bacello, rinvenuta su una spiaggia. Nel frattempo, Angela e Hodgins vengono a sapere che Cam è coinvolto in una storia d’amore che fino ad allora era stata mantenuta rigorosamente segreta.

Un artista di strada, il grande artista Zed, idolo di Angela, sta cercando di incollare un suo lavoro su un manifesto quando cade nella colla, e su un cadavere. Bones e i suoi dovranno districare le varie ossa, e capire cosa sia successo realmente.

Mentre la squadra indaga sui resti di un ragazzino trovato in una serra abbandonata, al Jeffersonian si presenta la sensitiva Avalon Harmonia (Guest star: Cindy Lauper), dicendo che la vittima, a cui anima sembra rimasta intrappolata nel mondo dei vivi, le ha chiesto di trovare il suo assassino. Durante l'indagine che sfiora il paranormale, i membri della squadra inizieranno ad interrogarsi su quello che è il loro concetto di vita dopo la morte.

Brennan e Booth indagheranno sul misterioso omicidio di una ballerina professionista che è stata assassinata tre giorni prima di un’importante audizione per entrare a far parte del cast di un popolare show televisivo. Per condurre meglio le indagini, i nostri due agenti parteciperanno sotto copertura come concorrenti dello show per scoprire se fra i partecipanti si nascondono potenziali assassini. L'esperienza lascerà il segno, soprattutto su Bones.

Un archeologo viene trovato ucciso nel suo studio-laboratorio. Qui lo studioso conservava preziosi resti di Uomini di Neanderthal e Homosapiens, che vengono assegnati a Clark, suscitando la gelosia di Brennan.

Hodgins e Angela vengono narcotizzati, e al loro risveglio trovano un cadavere appeso al baldacchino del loro letto, e petali di fiori intorno alla culla del loro bambino: Hodgins e' sicuro che Pelant sia tornato in cerca di vendetta. Il team del Jeffersonian scopre che il cadavere appartiene ad un agente delle forze speciali.

Il team del Jeffersonian lavora su due cadaveri trovati inaspettatamente nella stessa sepoltura: una donna malata terminale di cancro, e l'uomo che la stava aiutando nel percorso di accettazione della malattia.

L'indagine sul delitto di una campionessa di pattinaggio porta Angela sulla pista, per scoprire dall'interno chi avrebbe potuto volere la vittima morta. Intanto Cam è preoccupata per il numero di vsite mediche che sta prenotando Brennan.

Una sera che è rimasta nel laboratorio al Jeffersonian a lavorare, Brennan viene attaccata e ferita da un colpo di e viene portata d’urgenza in ospedale dove verserà in condizioni critiche. Mentre combatte tra la vita e la morte, Brennan avrà delle visioni di sua madre, che scardinano la sua logica ferrea. Nel frattempo, tutte le prove ritrovate sulla scena del crimine fanno pensare che il misterioso assalitore di Brennan è legato in qualche maniera al team del Jeffersonian.

Il team del Jeffersonian indagherà sui resti di un ragazzo quindicenne, descritto dalla madre come intelligente, ma con scarse abilità di socializzazione. Nel corso delle indagini, si scoprirà che il ragazzo aveva partecipato ad un festino con droga due settimane prima ed inoltre una ragazza minorenne confessa di essere stata violentata, compromettendo la reputazione del defunto. Nel frattempo, mentre tutti i riflettori sono puntati sugli inganni che sono emersi durante questo caso, Finn Abernathy prende in considerazione l’ipotesi di dire a Cam che sua figlia è in città per un breve periodo.

In un campo viene ritrovato il cadavere di un ragazzo. Mentre al Jeffersonian arriva un nuovo tirocinante, il brillante dottor Wells, un uomo molto intelligente con varie lauree tra cui fisica, è lega subito con Hodgins.

Il team del Jeffersonian indagherà sulla morte di Symchay Conteh, un giovane i cui resti sono stati ritrovati all’interno di un barile in un impianto di smaltimento di rifiuti tossici. Ad effettuare la macabra scoperta, un immigrato della Sierra Leone, che faceva numerosi lavori part time per sbarcare il lunario. Nel frattempo, mentre le indagini proseguono, Cam e Arastoo si rendono conto che è difficile mantenere segreta la loro relazione clandestina e Brennan e Booth si decidono a scegliere una destinazione per le loro vacanze.

L’agente speciale Seeley Booth e la dottoressa Brennan dovranno indagare sui resti di un cadavere carbonizzato, che è stato rinvenuto in un bunker e le indagini porteranno loro ed il resto del team del Jeffersonian ad avere a che fare con un Marine congedato ed un gruppo di attivisti che si stanno preparando per l'Apocalisse. Sweets potrebbe aver finalmente trovato un nuovo appartamento.

Un agente di polizia che stava indagando sotto copertura su una serie di rapine, viene trovato morto all’interno di un furgone con un sacchetto di diamanti nascosto nel suo corpo mutilato e per questo il team del Jeffersonian dovrà scoprire se i rapinatori sono anche degli assassini o qualcun altro ha brutalmente ucciso il poliziotto. Nel frattempo, Brennan è il soggetto di un documentario che viene realizzato per raccogliere fondi per il Jeffersonian e si sforza di essere simpatica alla telecamera.

Il team del Jeffersonian investigherà sulla morte di un produttore televisivo. intanto, Brennan si ritroverà a dover accettare che Christine è una bambina nella media quando sua figlia viene accusata di aver morso un suo compagno di classe. Infine, Hodgins usa tutti gli strumenti del laboratorio del Jeffersonian per ricreare la salsa speciale piccante di Finn.

Il team del Jeffersonian indagherà sulla morte di Jack Spindler, impiegato modello di giorno e spogliarellista di notte e quando i resti dell’uomo vengono trovati in un sito di demolizione ed emerge quanto il secondo lavoro della vittima influenzasse la sua vita privata, gli agenti iniziano a torchiare l’amico dello spogliarellista, Storm. Nel frattempo, dopo ventiquattro anni di assenza, la madre di Booth ricompare con una speciale richiesta per lui.

Il team del Jeffersonian deve evitare la diffusione di un virus letale, mentre investiga sull’omicidio della giornalista Mia Garrett, il cui corpo è stato ritrovato in un impianto di rischio biologico. Quando il virus che ha ucciso Mia contagia anche lo stagista Arastoo Vaziri, la sua unica speranza di sopravvivenza è che il team riesca a trovare l’assassino, dando il via ad una gara contro il tempo per poter trovare una cura e salvare la sua vita e quella di milioni di persone.

In questo finale dell'ottava stagione: Il genio del male Christopher Pelant torna a giocare con la squadra del Jeffersonian nella loro ultima indagine, dove si scopre che una serie di omicidi sono legati ad agenti dell’FBI molto vicini a Booth. Nel corso delle indagini, Sweets si rende conto che alcune prove gli sembrano fin troppo familiari e Brennan inizia a riconsiderare la sua relazione con Booth quando quest’ultimo sembra essere il prossimo bersaglio di Pelant.

Il team del Jeffersonian indagherà sulla morte di Jason Siedel, i cui resti sono stati ritrovati nell’impianto di aria condizionata di un hotel. Booth ritrova il suo vecchio compagno Danny Beck e chiede consiglio ad Aldo Clemens, un ex prete, su come gestire la relazione con Brennan dopo che Pelant li ha divisi. Intanto, Brennan deve decidere se credere a Booth o interrompere la loro relazione.

Le indagini per l’omicidio di Adam Pak, un consulente i cui resti sono stati ritrovati divorati dalle linci rosse, portano Booth e Brennan in un luogo di villeggiatura per coppie, dove i due agenti andranno sotto copertura indossando le vesti di Roxie e Tony e dove incontreranno Bill ed Evelyn Schumacher, il cui matrimonio sembra troppo perfetto. Infine, Cam viene arrestata per errore quando la sua identità viene rubata e Sweets decide di prendersi una pausa dall’FBI.

Il team del Jeffersonian dovrà indagare sull’omicidio di Jamie Delcampo, un membro della gang Estrellas Locas, i cui resti sono stati ritrovati carbonizzati in un auto; nel frattempo, dopo essersi preso una pausa dall’FBI in seguito ai terribili avvenimenti successivi all’aggressione di Pelant, Sweets decide di aiutare sul campo durante le indagini quando scopre che uno dei bambini del centro dove fornisce aiuto come volontario è il figlio di uno dei membri della gang.

Pelant è tornato ed i membri del Jeffersonian vogliono mettere fine alla sua carriera di serial killer una volta per tutte e per questo ordiscono un piano con l’aiuto dell’agente special Hayes Flynn, utilizzando un cadavere umano desideroso di aiutare il team nella cattura del criminale e ponendolo in posizione tale da emulare Pelant. Il loro piano fallisce quando Pelant risulta essere un passo avanti a loro ed uccide una persona cara a Booth; nel frattempo Sweets ritorna sul campo e convince l’agente Flynn che non è la persona che tutti credevano fosse.

Il Jeffersonian team indaga sull’omicidio di Charlie McCord, il direttore di un liceo che dopo aver scoperto di avere un cancro in fase terminale, ha aperto un sito dove la gente può dargli consigli sui video da realizzare. Quando vengono rinvenuti un video dove Charlie prende a pugni il pugile Chuck Liddell ed una lista di cose da fare prima di morire, il team inizia ad avvicinarsi alla soluzione del caso.

Il team del Jeffersonian indaga sulla morte di Nancy Handelman, i cui resti sono stati ritrovati nel giorno delle nozze di Brennan e Booth; quando il caso si fa più serio, Cam ed Angela fanno tutto ciò che è in loro potere per tenere Brennan all’oscuro e fare in modo che la donna si concentri sul suo grande giorno. La tensione sale quando uno sfortunato evento interrompe il matrimonio e Max si presenta in città con una borsa piena di denaro.

Mentre sono in luna di miele a Buenos Aires, Booth e Brennan non riescono a rilassarsi e decidono di aiutare Raphael Valenza, un detective locale e grande fan dei libri di Brennan, a risolvere l’omicidio di un criminale di guerra nazista, i cui resti sono stati ritrovati vicino una storica fossa comune, mentre a Washington, Hodgins e Angela cercano di prendersi cura di Christine mentre i due colleghi sono in luna di miele.

Il team del Jeffersonian indagherà sull’omicidio di Sean Nolan, un ex modello i cui resti sono stati rinvenuti vicino ad una diga; durante le indagini, la squadra scopre che l’unica fonte di reddito dell’ex modello erano le donazioni di sperma. Quando la squadra scopre che Sean Nolan ha falsificato i registri delle donazioni, automaticamente le donne che hanno ricevuto il suo seme rientrano nella sfera dei sospetti; infine, Brennan lotta con le convenzioni sociali quando rimane coinvolta in una faida con l’autrice Tess Brown e Hodgins mette alla prova il suo istinto materno prendendosi cura di una larva di una mosca.

Brennan è un giurato nel processo ad un calciatore, accusato di aver ucciso la propria moglie. Succederà qualcosa di imprevisto.

Il team del Jeffersonian investiga sulla morte di uno scienziato del cibo, i cui resti sono stati gettati in un tritacarne e mescolati ad uno stufato servito in una caffetteria di una scuola; quando il team scopre l’ultima invenzione dello scienziato, i sospetti ricadono su altri professionisti del settore. Intanto, Angela pianifica un addio al nubilato dopo le nozze per Brennan e la festa diventa più folle di quanto avesse pianificato.