Le gang assiste à la Royal Knights Faire dans Crystal Cove, mais elle accueille un invité inattendu. Un gnome effrayant paralyse tous les visiteurs vêtus de costumes de pirate.

Le maire Johns achète sur Internet un temple antique pour améliorer le par d'attraction de Crystal Cove. Depuis, une bête mythique appelée "Manticore" rôde sur le parc et terrorise tout le monde. Ne voulant pas fermer le parc, le maire demande à Sammy et à toute l'équipe de neutraliser le Manticore.

Une créature de haute technologie appelé Obliteratrix attaque le gang et les oblige à enquêter sur l'affaire du trésor hanté avec l'aide de HP Hatecraft.

Le gang suit enfin la piste pour trouver le trésor caché, mais ils ne pense pas que Le Freak allait s'en prendre à eux. D'autre part, beaucoup de vérités sont révélées, y compris le but du professeur Périclès et la véritable identité des parents de Fred. Et comme si cela ne suffisait pas, le gang est confronté à un gros problème lorsque les parents se mettent en colère à cause du comportement de leurs enfants. Et juste au moment où le mystère de la ville est à son plus haut niveau, est-ce la fin la fin de la bande ou le début d'un nouveau problème?

Alors que Fred tente de retrouver l'amour de Daphné, une nouvelle venue arrive dans l'équipe: Miss Eau de Boudin. Ils devront affronter une sorcière venue de Russie avec sa maison sur pattes qui terrorise la ville.

Fred essaie de reconquérir Daphné. Le Clown Triste revient pour rançonner Crystal Cove et kidnappe Daphné. Elle est sauvée et accepte de revenir dans l'équipe. Mr. E essaie de recruter à nouveau Angel Dynamite

Dreamweaver ressuscite et lave le cerveau d'un ancien groupe de joueurs de Cryptes et Créatures (y compris le shérif Bronson Stone) en saisissant leur esprit pendant qu'ils dorment !

Une créature appelée La Hodag of Horror attaque Crystal Cove. En même temps, Brad Chiles et Judy Reeves (les vrais parents de Fred) ont soudainement réapparu.

Une goule interdit l'accès à son cimetière.

Une créature semblable à un ours attaque le maire Nettles et Sheriff Stone dans les bois de Crystal Cove près de Destroido. Ils se tournent alors vers le gang pour demander de l'aide, expliquant que la créature s'appelle le Scarebear et traque depuis des semaines toute personne se trouvant sur les terres près de la compagnie Destroido...

Un adolescent vandalisant un quartier est attaqué par une créature qui s'appelle "Krampus". Trois autres enfants sont attaqués alors que le gang rencontre le maire Nettles et Sheriff Stone à la patinoire. Le gang se tourne vers la prisonnière Mary-Ann Gleardon pour obtenir de l'aide...

L'usine de Monsieur E est la cible d'un mystérieux dragon télécommandé par l'infâme Zin. Celui-ci est à la poursuite de la pile Quest X, qui est censée produire une énergie illimitée, mais elle a été dissimulée dans un endroit surprenant...

L'organisation "Crystal Cove Haunted Historical Society" effectue des reconstitutions de l'histoire de Crystal Cove chaque année. Pendant une répétition pour la représentation de cette année, une momie fantôme ressemblant à l'un des accessoires effraie les acteurs et les membres d'équipage. Vincent Van Ghoul, appelé à reprendre en main la production, trouve l'ensemble détruit et appelle Mystery Incorporated à la rescousse. Pendant ce temps, le professeur Pericles recrute Brad et Judy pour voler le disque planisphérique.

Le professeur Pericles crée un troupeau de bovins mutants pour détruire Crystal Cove dans le but de localiser le disque planisphérique.

Alors que Francilee relance son émission de cuisine, elle est attaquée par un monstre qui s'en prend à toute nourriture à base de gluten. Le docteur Spartan, qui est devant sa télé, reconnaît le démon et décide de se rendre à Crystal Cove afin de l'empêcher de nuire...

Toute la ville de Crystal Cove est kidnappée et forcée à creuser sous la ville pour retrouver la porte menant au sarcophage.

L'équipe originelle de Mystères Associés touche au but. Mais pour arriver à leur fin, ils ont besoin de leurs successeurs. Se servant de miss Eau de Boudin comme otage, le professeur Périclès parvient à forcer Scooby Doo et ses amis à l'aider...