Claudia e Steve vengono messi in allarme quando un intruso penetra nel Warehouse e rimangono sconvolti quando scoprono che si tratta di Paracelsus, che è ancora in vita. Nel frattempo, Pete, Myka e Artie vanno a caccia di alcuni artefatti che erano stati rubati secoli fa dai pirati e per ritrovarli si coalizzeranno con la misteriosa Charlotte DuPrix, ma quest’alleanza metterà tutti in pericolo.

la squadra del Warehouse dovrà affrontare le terribili conseguenze della visita di Paracelsus al Warehouse, che ha trasformato Claudia in una statua di bronzo ed ha rubato l’unico oggetto che possa riportare la ragazza alla normalità. Oltre a dare la caccia a Paracelsus, gli agenti del Warehouse dovranno gestire le conseguenze della trasformazione di Claudia, che sembrano influenzare sia il Warehouse che la signora Frederick.

Finale di stagione. Il malvagio alchimista Paracelsus rappresenta una minaccia molto concreta per il team del Warehouse. Pete e Myka devono riuscire a fermarlo prima che riesca a trasmutare la pietra necessaria ad ottenere l’immortalità. Mentre è impegnata a cercare di fermare Paracelsus, Myka dovrà combattere la propria battaglia personale contro una forma di cancro molto aggressiva.

Claudia affronta Paracelso nel magazzino, ma viene sopraffatta. Grazie ad un'intuizione di Myka, la quale intanto aveva avuto la conferma che il suo problema di salute non era più di una ciste benigna, Artie, Pete, Steven e la stessa Myka riescono ad entrare nel magazzino.