Sheldon se ve obligado a salir con Amy para celebrar su segundo aniversario y le pide a Raj que les acompañe. Por otra parte, Leonard tiene problemas para quedar con Penny sin preguntarle sobre el futuro de su relación.

El grupo insiste para que Penny se sincere con Leonard. Mientras, Howard es el blanco de todas las bromas en la estación espacial. Por otra parte, Stuart y Raj planean irse de la ciudad.

Amy está celosa porque Sheldon ha contratado a una estudiante llamada Alex para ayudarle en su proyecto. La joven pide a Penny que les espíe para descubrir qué tipo de relación mantienen. Por otro lado, el regreso de Wolowitz del espacio se retrasa una semana.

Howard se ofende con la bienvenida que le hacen después de estar en el espacio. No se esperaba tantas sorpresas. Los juegos de la noche van subiendo de tono hasta acabar convirtiéndose en una auténtica batalla entre Penny y Sheldon.

Todo el grupo va a la fiesta de Halloween de la tienda de cómics de Stuart. Allí, Leonard aprovecha sus conocimientos científicos para seducir a Penny.

Penny se apunta a clases universitarias a espaldas de Leonard para que no intente ayudarla. Por su parte, el mundo de Sheldon se derrumba cuando el doctor Stephen Hawking se enfada al perder en un juego en red.

Wolowitz está a punto de tomar una decisión importante. Debe decidir entre quedarse en casa de su madre o irse. Mientras tanto Sheldon se ve envuelto en una discusión entre Amy y Wil Wheaton.

Raj y Howard intentan descubrir por qué Sheldon desaparece todas las tardes a las 2:45. Los celos aparecen entre Penny y Leonard.

Cuando la universidad reasigna el lugar de estacionamiento de Sheldon empieza una lucha con Howard. Todo el grupo entra en crisis por culpa de este enfrentamiento por hacerse con la plaza de aparcamiento.

Howard y Bernadette tienen una tensa cena con el padre de ella. Al final, Howard termina yendo de pesca con su suegro. Por su parte, Sheldon se presenta en el apartamento de Amy y se encuentra a su novia enferma. Raj se siente solo ya que todos sus amigos tienen citas.

Los chicos organizan una partida de Dragones y Mazmorras en versión navideña, pero no invitan a las chicas, lo que provoca un enfrentamiento. Penny, Amy y Bernadette deciden arreglarse para ir a tomar algo a un bar. Raj, primer eliminado del juego, las acompaña.

Sheldon reúne a los chicos en el departamento de Recursos Humanos para hablar de Alex y de sus métodos para ligar con Leonard. Por su parte, Penny se muestra incómoda e insegura ante esta situación y no puede evitar sentir celos.

Los chicos acuden a una convención de cómics en Bakersfield con sus disfraces de "Star Trek", pero las cosas no les salen como las tenían planeadas. Mientras, Penny, Bernadette y Amy se dirigen a la tienda de Stuart para averiguar por qué los cómics son tan fascinantes.

Sheldon se ve obligado a trabajar con su rival Barry Kripke en un proyecto que podría darles una oportunidad de ganar un Nobel. Además, deberá enfrentarse a sus sentimientos por Amy. Mientras, Howard y Raj se gastan 1000 dólares en unas figuras de acción de sí mismos.

Tras el enfrentamiento entre Sheldon y Leonard, éste decide irse a vivir a otro lugar. Además, Raj se encargará de cuidar a la señora Wolowitz mientras Howard esté de viaje.

Leonard, Penny, Howard y Bernadette salen a cenar por el día de San Valentín mientras Sheldon y Amy tratan de encontrar el regalo perfecto para el otro. Stuart y Raj tienen otro plan, acuden a una fiesta en la tienda de cómics para todos aquellos que no tienen pareja.

Raj se siente deprimido después de que su cita se escapara de él. No quiere salir de casa y no se cuida. Los demás se esfuerzan para que recupere el ánimo y vuelva a ser el Raj de siempre.

Leonard, Sheldon y Howard asisten al instituto con el objetivo de incentivar a las adolescentes para que dediquen su vida a la física. Por su parte, Penny, Amy y Bernadette deciden hacer novillos y viajar hasta Disneyland. Además, Raj tiene su primera cita con Lucy.

Howard se enfrenta a un serio dilema cuando deba decidir si leer o no una carta que le envió su padre hace años y que había dejado sin leer a propósito. Por su parte, Leonard y Penny dan una fiesta "adulta" en el piso de sus amigos.

Una vacante queda libre en la universidad y Leonard, Sheldon y Raj deciden solicitarla. Empieza una guerra por la plaza donde cada uno de ellos exhibe sus curiosa manera de hacerse valer.

La curiosidad de Raj sobre su nuevo amor le lleva a cambiar ciertos aspectos de su personalidad para causar una mejor impresión en la gente. Mientras, a Penny le persigue su apatía y Amy intenta curar a Sheldon y su manía enfermiza de finalizarlo todo.

Sheldon y Leonard contratan al profesor Protón, conductor del programa de televisión del barrio donde vivían de pequeños, como actor. Además, a Howard y Bernadette les surgen varios problemas mientras cuidan del perro de Raj.

Todo el grupo comparte una particular partida de "Dragones y Mazmorras" después de que el viaje de las chicas a Las Vegas se arruinara. Por su parte, Raj y Lucy siguen quedando, pero él la empuja a enfrentarse a sus miedos.

Leonard tiene la oportunidad de trabajar con doctor Stephen Hawking pero para ello debe irse cuatro meses fuera. Penny y Sheldon están muy afectados con la noticia e intentan llegar a un acuerdo con sus sentimientos para seguir dando apoyo a Leonard en su decisión.

Mientras Howard intenta ayudar a Raj a superar la ruptura con su ex, Sheldon y Penny comparten íntimos secretos.

La amistad entre Leonard y Sheldon es puesta a prueba. Mientras, la masculinidad de Howard también estará en duda debido a la estrecha relación con su madre.

Raj se siente dolido porque nadie del grupo le hizo caso cuando propuso una cena especial. Por ello, diseña una búsqueda del tesoro en que todos los miembros deberán hacer gala de sus habilidades científicas y sociales.

Sheldon trata de vengarse de Amy, quien le ha hecho ver los fallos de argumento que contiene la película "Indiana Jones en busca del arca perdida". Además, Leonard aprovecha el trauma que tiene con su madre para influenciar a Penny.

Cuando Amy consigue un nuevo trabajo en la misma Universidad en donde trabaja Sheldon, este evaluará la cantidad de tiempo que pasa con su novia. A Howard, por su parte, le tocará dormir en el sofá.

Cuando Howard intenta cortejar a Bernadette, Penny tomará la misma iniciativa con Leonard. Más adelante, Sheldon hace un descubrimiento que más que causarle alegría, hará que se sienta culpable.

Sheldon busca venganza cuando Arthur "Profesor protón" Jeffries pide ayuda a Leonard para un proyecto en vez de a él.

Sheldon pide a Leonard que le compense por un error del pasado. Penny tendrá que enfrentarse a la nueva chica de Raj, Lucy.

Todo el grupo decide celebrar el día de Acción de Gracias en casa de la familia Wolowitz, pero Sheldon no está nada satisfecho con la localización. Sin embargo, durante el festejo, el drama emerge por culpa de un episodio del pasado de Penny.

Sheldon sufrirá las consecuencias de la fama por su descubrimiento

Sheldon viaja hasta Texas para asistir al nacimiento del primer hijo de su hermana. Por ello, el resto del grupo imagina cómo habría sido cada una de sus vidas si el excéntrico científico no hubiese formado parte de ellas.

Penny busca consuelo en Leonard después de que su aparición en NCIS no haya salido como ella esperaba.

Sheldon intenta tranquilizarce después de que es forzado a tomarse unas vacaciones. Leonard intenta ser alguien de apoyo para Penny luego de que ella renuncia a su trabajo y Bernadette busca la ayuda de Stuart para reemplazar una de las historietas de Howard.

Trás que los chicos no pueden comprar entradas para la Comic-Con, Sheldon intenta hacer su propia convención y termina pasando la noche con James Earl Jones. Mientras tanto, las chicas ven si pueden actuar como "adultas".

Sheldon y Amy van de viaje a la tierra del vino con Howard y Bernadette. Penny y Leonard llevan la perra de Raj al veterinario.

Leonard compra una mesa de comedor y provoca que Sheldon se reevalue los cambios en su vida. Mientras tanto, a Wolowitz le ofrecen la oportunidad de volver al espacio y Bernadette no sabe si apoyarlo o no.

Luego de que se insulten, Bernadette intenta hacer las paces entre Wolowitz y Sheldon. Mientras tanto, A Penny le ofrecen un papel muy vergonzoso y Raj le pide a Amy que le escriba de su parte a una mujer.

Sheldon y Howard realizan un viaje a Texas para visitar a la madre de Sheldon.

Mientras que Raj se llena de culpa cuando intenta salir con dos chicas a la vez, Penny no sabe si actuar en una mala película y Sheldon no puede decidirse entre dos consolas de video juegos.

Sheldon tiene una crisis personal cuando decide que la teoría de cuerdas es una pérdida de tiempo; mientras tanto una doble cita termina en vergüenza para Howard.

Sheldon le da una oportunidad a la espontaneidad, lo cual termina en una inesperada fricción entre Penny, Bernadette y Amy. Raj le pide ayuda a Howard para prepararse para una cita con Emily.

El profesor Protón ayuda a Sheldon a lidiar con el dolor; Leonard se mete en una competencia con Penny; Bernadette y Amy preparan un regalo "Star Wars Day" para los chicos.

Un mal día obliga a Penny a reevaluar sus opciones - incluyendo Leonard; Bernadette y Howard tienen que cuidar de la Sra. Wolowitz; Sheldon da a Raj asesoramiento sobre relaciones.

Ante un futuro incierto, Sheldon considera un cambio importante; Emily y Raj deciden llevar las cosas al siguiente nivel.

Después que la madre de Sheldon y el padre de Leonard pasan una noche juntos, todos deben lidiar con una mañana extraña el día siguiente. Por otra parte, la familia de Penny llega para la ceremonia nupcial, incluyendo a su angustiada madre, Susan y su hermano vendedor de drogas, Randall.

El coronel Williams, un representante del Departamento de la Comandancia de Materiales de la Fuerza Aérea se sienta a conversar (negociar) con Wolowitz.

Las tensiones aumentan cuando los muchachos no pueden completar el proyecto en el plazo establecido y Sheldon prueba con una bebida energética para mantenerse despierto. Mientras tanto, Penny y Amy van a una “fiesta” en la casa de Bert, el geólogo; y Kootrhappali descubre los verdaderos sentimientos de Bernadette acerca de su embarazo, cuando están limpiando la futura habitación del bebé.

Cuando el departamento de Amy sufre una inundación, ella propone un “experimento de cohabitación” con Sheldon. También, Howard y Bernadette se enojan cuando Koothrappali descubre el sexo del bebé antes que ellos.

Leonard y Penny deberán mediar en una pelea entre Sheldon y Amy, cuando la convivencia de estos últimos no sale como habían planeado, y Sheldon amenaza romper su relación con Amy, si ella rehúsa cumplir el horario del baño. Mientras, Howard y Bernadette descubren que tienen invitados inesperados, cuando deciden quedarse en casa, en lugar de irse de vacaciones como habían planeado.

Es una sorpresa para Penny descubrir que tiene fans gracias a su actuación en la película “Serial Ape-ist”, cuando asista a la Comic Con de Van Nuys con Leonard. Mientras tanto, Amy ofrece una cena al estilo de Sheldon en el departamento de Penny. Y Wolowitz realiza una compra impulsiva, al comenzar a agobiarse acerca del bebé en camino.

Para poder seguir viviendo con Sheldon, Amy le miente acerca del avance en las reparaciones de su departamento y ellos graban un episodio de “Diversión con Banderas” en una “locación”, es decir, en el departamento de Penny. Además, Leonard deja que Penny redecore la antigua habitación de Sheldon, luego que él se da cuenta de que ella está llevando secretamente los coleccionables de su esposo a un depósito.

Luego de un exitoso experimento combinando sus genes, Sheldon no se detendrá ante nada para convencer a Amy de que deben procrear. Mientras, Koothrappali se avergüenza de decirle a sus amigos cómo se gana la vida la nueva mujer con la que ha comenzado a salir.

Cuando Bert, un geólogo de Caltech, gana la beca MacArthur Genius, Sheldon es dominado por los celos. Además, Wolowitz encuentra un viejo control remoto de una figura de acción de Stephen Hawking que había inventado.

Sheldon y Leonard intentan dividir sus pertenencias compartidas, pero no pueden ponerse de acuerdo en nada. Además, Koothrappali y Stuart luchan entre sí por ser el más útil, durante las últimas semanas del embarazo de Bernadette.

Tal como el año pasado, en el cumpleaños de Amy, Sheldon y Amy vuelven a tener su noche “especial”, pero el nacimiento del bebé Howardette podría interponerse en sus planes.

Tras pasar las vacaciones separados, todos se reúnen para hablar sobre sus viajes y sobre los primeros días de Howard y Bernadette como padres.

Cuando Penny siente que Leonard la está dando por sentado, decide ir a un fin de semana de spa con Amy. Además, Wolowitz y Koothrappali tratan de arreglar una tabla de piso chirriante en la habitación del bebé.

Sheldon prueba una versión preliminar de un invento del MIT, tras oír que este le ayudará a interpretar las emociones de las personas. Además, Leonard no puede esconder sus sentimientos cuando Penny le anuncia que su hermano vendrá a la ciudad y Raj invita a sus exnovias para que le den consejos sobre salir en citas.

Leonard y Wolowitz intentan distraer a Sheldon cuando este entorpece el progreso de su sistema guía. Mientras, Penny y Amy se llevan a Bernadette para salir juntas de noche, dejando a Raj y Stuart al cuidado de Halley.

Sheldon y Amy tienen su primera pelea desde que se mudaron juntos y Koothrappali es golpeado por la dura realidad de la independencia financiera luego que deja de recibir el apoyo de su padre.

El viaje anual de los chicos a la Comic-Con pende de un hilo ya que Raj no puede permitirse ir.

Cuando Raj deja su departamento, Leonard y Penny le ofrecen la antigua habitación de Sheldon.

Leonard, Penny y Raj acuerdan nuevas reglas ahora que viven juntos, y Sheldon se interesa en el trabajo de Amy.

Sheldon llega a su límite cuando colabora en el proyecto con Leonard y Wolowitz, así como con Amy, en el mismo día. Además, la licencia de maternidad de Bernadette llega a su fin y ella debe volver al trabajo.

Howard y Bernadette tienen dificultades para que Halley se quede en la guardería cuando Bernadette debe volver a trabajar. Además, Bert le presenta al grupo a su nueva novia, Rebecca.

Leonard no se emociona demasiado cuando Penny considera tomar un nuevo trabajo, el cual le es ofrecido por su exnovio, Zack. Además, Sheldon decide asumir nuevos retos.

Luego que Leonard, Sheldon y Wolowitz celebran la culminación del proyecto ultrasecreto para la Fuerza Aérea, se llevan una desagradable sorpresa. Además, a Amy le ofrecen un puesto durante el verano como investigadora visitante.

Cuando el vuelo de Leonard a su antigua universidad se cancela, Leonard intenta usar todos los medios posibles para poder acudir a dar su discurso.